More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0456 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0456  HAE1 family efflux transporter  100 
 
 		 752 aa  1509    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.857513  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1701  HAE1 family efflux transporter  44.61 
 
 		 777 aa  673    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.271028  normal  0.950997 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0768  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  44.99 
 
 		 747 aa  699    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.53096  normal  0.282667 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1961  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  57.99 
 
 		 758 aa  912    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1059  HAE1 family efflux transporter  44.44 
 
 		 777 aa  672    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.101015 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0222  efflux transporter, , hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  48.07 
 
 		 746 aa  688    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1056  efflux transporter, , hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  51.29 
 
 		 756 aa  775    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0557741  normal  0.21545 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0901  HAE1 family efflux transporter  46.4 
 
 		 752 aa  706    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395656  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1269  RND superfamily protein  35.52 
 
 		 748 aa  479  1e-134  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2275  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  34.81 
 
 		 812 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0590834  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0867  HAE1 family efflux transporter  34.57 
 
 		 778 aa  426  1e-118  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3150  RND superfamily protein  33.6 
 
 		 755 aa  421  1e-116  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0817693  normal  0.0240782 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4897  hypothetical protein  30.34 
 
 		 864 aa  301  3e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0113  MMPL domain-containing protein  26.23 
 
 		 865 aa  226  9e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.382745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2999  MMPL domain-containing protein  29.96 
 
 		 821 aa  218  2e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2964  hypothetical protein  27.2 
 
 		 687 aa  205  2e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4453  RND efflux transporter  29.03 
 
 		 889 aa  199  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4341  Patched family protein  26.31 
 
 		 895 aa  154  7e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.354864  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1637  hypothetical protein  29.35 
 
 		 385 aa  150  6e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0572  hypothetical protein  28.26 
 
 		 385 aa  137  8e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.67085  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1297  hypothetical protein  24.78 
 
 		 380 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0264  MMPL domain-containing protein  27.15 
 
 		 385 aa  135  3e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00700265 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1669  hypothetical protein  28.1 
 
 		 388 aa  130  1.0000000000000001e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0691  hypothetical protein  26.1 
 
 		 805 aa  129  3e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2865  Patched family protein  25.39 
 
 		 1011 aa  127  7e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1628  RND superfamily protein-like exporter  27.35 
 
 		 921 aa  125  3e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.221009 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2918  exporter of the RND superfamily protein  24.71 
 
 		 1204 aa  123  9.999999999999999e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0248285  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08450  efflux transporter, putative, hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  20.47 
 
 		 764 aa  123  9.999999999999999e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0020  Patched family protein  23.63 
 
 		 1359 aa  122  3e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.637086  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0297  hypothetical protein  25.55 
 
 		 387 aa  120  7.999999999999999e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.981573  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0788  Patched family protein  24.51 
 
 		 923 aa  119  1.9999999999999998e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3221  hypothetical protein  23.55 
 
 		 874 aa  115  4.0000000000000004e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2229  Patched family protein  21.07 
 
 		 755 aa  111  5e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.271746  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1668  Patched family protein  24.13 
 
 		 842 aa  110  1e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0610  exporter of the RND superfamily protein-like protein  21.09 
 
 		 807 aa  108  4e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1161  Patched family protein  22.65 
 
 		 831 aa  107  5e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1239  hypothetical protein  24.48 
 
 		 862 aa  104  6e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2986  RND efflux transporter  23.45 
 
 		 1051 aa  103  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.594238  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1774  Patched family protein  20.46 
 
 		 815 aa  101  6e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3164  hypothetical protein  21.55 
 
 		 784 aa  101  6e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.330305  normal  0.727475 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1238  hypothetical protein  23.55 
 
 		 855 aa  100  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.409284  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1317  RND efflux transporter  18.46 
 
 		 778 aa  97.8  6e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00469095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1805  Patched family protein  20.26 
 
 		 804 aa  96.3  2e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.732433  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5040  RND efflux transporter  23.94 
 
 		 786 aa  96.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.981854  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5820  RND efflux transporter  23.94 
 
 		 786 aa  96.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0581  RND efflux transporter  21.11 
 
 		 788 aa  94.7  5e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.843516  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0413  conserved hypothetical protein, membrane  20.82 
 
 		 773 aa  94  9e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0655355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4359  RND efflux transporter  23.6 
 
 		 786 aa  93.6  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4346  RND efflux transporter  23.57 
 
 		 786 aa  92  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.312397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1720  RND superfamily transporter  22.05 
 
 		 788 aa  90.9  8e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.362573  normal  0.170717 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0469  hypothetical protein  21.68 
 
 		 905 aa  88.2  5e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3675  membrane protein  20.24 
 
 		 808 aa  87  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4865  RND efflux transporter  21.04 
 
 		 786 aa  86.7  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.743305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0860  Patched family protein  34.21 
 
 		 1131 aa  85.9  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6840  RND efflux transporter  22.36 
 
 		 786 aa  85.1  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.172281  normal  0.135262 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0077  putative membrane transporter  21.21 
 
 		 797 aa  84  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.273508 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1699  hypothetical protein  22.15 
 
 		 847 aa  82.8  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0923287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4267  putative RND superfamily transporter  20.89 
 
 		 789 aa  82.8  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3579  RND superfamily transporter  20.85 
 
 		 788 aa  82  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.900215  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2608  exporter of the RND superfamily protein  22.77 
 
 		 860 aa  81.6  0.00000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0269848  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6781  RND efflux transporter  21.72 
 
 		 799 aa  81.3  0.00000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2963  putative membrane transporter  22.04 
 
 		 785 aa  80.9  0.00000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.581109 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2594  hypothetical protein  22.07 
 
 		 771 aa  79.7  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3357  putative integral membrane protein  21.31 
 
 		 872 aa  79.7  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.42147  normal  0.0868518 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2200  hypothetical protein  22.43 
 
 		 816 aa  79  0.0000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4435  transporter, putative  21.77 
 
 		 786 aa  78.6  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.565976 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1534  RND superfamily exporter  22 
 
 		 787 aa  78.6  0.0000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0360223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4325  transporter, putative  21.77 
 
 		 786 aa  78.6  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0993317 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2803  hypothetical protein  20.65 
 
 		 772 aa  77.8  0.0000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.929153  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1808  hypothetical protein  21.5 
 
 		 767 aa  77.8  0.0000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2275  RND superfamily transporter  21.79 
 
 		 797 aa  77.4  0.0000000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.857443  normal  0.323939 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0943  RND efflux transporter  21.33 
 
 		 791 aa  77.4  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0958  hypothetical protein  21.36 
 
 		 779 aa  77  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.764454  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3078  exporter of the RND superfamily protein-like protein  31.94 
 
 		 1109 aa  77.4  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2971  RND efflux transporter  22.99 
 
 		 797 aa  76.3  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1018  MMPL domain-containing protein  24.09 
 
 		 861 aa  76.3  0.000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00165976  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0806  hypothetical protein  21.81 
 
 		 1083 aa  75.9  0.000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.712772  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0677  RND efflux transporter  22.57 
 
 		 811 aa  75.9  0.000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3229  hypothetical protein  23.79 
 
 		 794 aa  75.1  0.000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0514277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2127  hypothetical protein  21.01 
 
 		 816 aa  74.7  0.000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00224294  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1714  RND superfamily transporter  22.06 
 
 		 789 aa  74.7  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0904131 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1701  hypothetical protein  22.52 
 
 		 796 aa  74.3  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.49055 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2935  Patched family protein  22.7 
 
 		 784 aa  74.3  0.000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1447  RND efflux transporter  22.85 
 
 		 820 aa  74.3  0.000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.751862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2163  MMPL domain-containing protein  25.95 
 
 		 1013 aa  74.3  0.000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4241  MMPL domain protein  30.29 
 
 		 709 aa  73.9  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.682094  normal  0.157718 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1728  hypothetical protein  20.2 
 
 		 769 aa  73.6  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2278  transport protein, putative  20.36 
 
 		 835 aa  73.9  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0258  hypothetical protein  19.62 
 
 		 767 aa  73.9  0.00000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.467137  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2006  RND superfamily exporter  22.47 
 
 		 794 aa  73.6  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.882933  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1194  hypothetical protein  29.78 
 
 		 832 aa  72.8  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.0000134903  hitchhiker  0.0000145799 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1784  hypothetical protein  21.6 
 
 		 771 aa  73.2  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.455314  normal  0.263872 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3777  hypothetical protein  23.78 
 
 		 796 aa  72.4  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3833  transport protein  23.61 
 
 		 944 aa  72  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0356  hypothetical protein  21.11 
 
 		 685 aa  72  0.00000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2477  hypothetical protein  20.32 
 
 		 772 aa  71.6  0.00000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0495637  normal  0.0162982 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3322  exporter of the RND superfamily protein-like protein  31.22 
 
 		 872 aa  71.6  0.00000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2196  hypothetical protein  22.32 
 
 		 771 aa  71.2  0.00000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.233357  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2749  transporter, putative  21.91 
 
 		 804 aa  70.9  0.00000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00176897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6390  transporter, putative  22.18 
 
 		 786 aa  70.5  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.191266  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>