More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0581 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1805  Patched family protein  56.79 
 
 		 804 aa  830    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.732433  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04040  hypothetical protein  56.89 
 
 		 803 aa  867    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0581  RND efflux transporter  100 
 
 		 788 aa  1589    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.843516  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3675  membrane protein  39.95 
 
 		 808 aa  600  1e-170  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0413  conserved hypothetical protein, membrane  37.75 
 
 		 773 aa  557  1e-157  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0655355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0460  putative exporter of the RND superfamily protein  37.47 
 
 		 806 aa  539  9.999999999999999e-153  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1161  Patched family protein  35.54 
 
 		 831 aa  530  1e-149  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2229  Patched family protein  23.82 
 
 		 755 aa  228  4e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.271746  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1317  RND efflux transporter  26.14 
 
 		 778 aa  216  9.999999999999999e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00469095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08450  efflux transporter, putative, hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  21.78 
 
 		 764 aa  197  5.000000000000001e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0610  exporter of the RND superfamily protein-like protein  23.1 
 
 		 807 aa  192  2e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1774  Patched family protein  22.58 
 
 		 815 aa  181  4e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2200  hypothetical protein  24.17 
 
 		 816 aa  177  6e-43  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0392  exporter of the RND superfamily protein-like protein  21.41 
 
 		 837 aa  171  6e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4151  hypothetical protein  24.29 
 
 		 807 aa  163  1e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.735313  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1526  RND efflux transporter  21.57 
 
 		 756 aa  159  2e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1279  hypothetical protein  23.51 
 
 		 821 aa  159  2e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2986  RND efflux transporter  22.69 
 
 		 1051 aa  155  4e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.594238  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2006  hypothetical protein  23.16 
 
 		 789 aa  152  2e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000691446  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0367  putative integral membrane protein  24.05 
 
 		 821 aa  151  5e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.1024  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003709  predicted exporter of the RND superfamily  21.57 
 
 		 792 aa  144  5e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0277  hypothetical protein  25.43 
 
 		 823 aa  143  9.999999999999999e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1281  resistance-nodulation-cell division family transporter  25.23 
 
 		 828 aa  143  9.999999999999999e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.338562  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1652  hypothetical protein  21.34 
 
 		 779 aa  142  3e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0699635  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1180  hypothetical protein  21.85 
 
 		 801 aa  141  4.999999999999999e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0321  putative integral membrane protein  22.73 
 
 		 813 aa  140  7.999999999999999e-32  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.322021  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1565  hypothetical protein  25.34 
 
 		 823 aa  140  8.999999999999999e-32  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3142  transporter, putative  21.35 
 
 		 799 aa  140  1e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1376  hypothetical protein  24.91 
 
 		 823 aa  139  2e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0588  hypothetical protein  22.99 
 
 		 815 aa  139  3.0000000000000003e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2278  transport protein, putative  22.82 
 
 		 835 aa  137  9.999999999999999e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1321  RND efflux transporter  21.27 
 
 		 800 aa  135  1.9999999999999998e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0562  hypothetical protein  23.42 
 
 		 800 aa  133  2.0000000000000002e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.593707  normal  0.20774 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2594  hypothetical protein  21.51 
 
 		 771 aa  132  3e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2196  hypothetical protein  22.04 
 
 		 771 aa  132  3e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.233357  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2001  hypothetical protein  22.18 
 
 		 771 aa  131  4.0000000000000003e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1742  hypothetical protein  22.74 
 
 		 824 aa  131  4.0000000000000003e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00144404  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0677  RND efflux transporter  20.07 
 
 		 811 aa  130  9.000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2270  putative transport protein  21.83 
 
 		 799 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0857118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0943  RND efflux transporter  20.2 
 
 		 791 aa  129  3e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1784  hypothetical protein  21.34 
 
 		 771 aa  128  3e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.455314  normal  0.263872 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1679  hypothetical protein  21.56 
 
 		 771 aa  129  3e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.980542  normal  0.247829 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1754  hypothetical protein  21.56 
 
 		 771 aa  129  3e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0558079  normal  0.523278 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1591  hypothetical protein  21.84 
 
 		 768 aa  127  7e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0469  hypothetical protein  22.46 
 
 		 905 aa  126  1e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1941  Patched family protein  22.08 
 
 		 767 aa  126  1e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.314196  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3164  hypothetical protein  20.3 
 
 		 784 aa  125  2e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.330305  normal  0.727475 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1728  hypothetical protein  21.67 
 
 		 769 aa  126  2e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2467  RND efflux transporter  20.13 
 
 		 792 aa  125  3e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.022945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4691  putative transport protein  20.34 
 
 		 797 aa  125  4e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.628482  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2375  transport protein, putative  22.03 
 
 		 825 aa  120  7.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2139  hypothetical protein  22.26 
 
 		 770 aa  120  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.124395 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2477  hypothetical protein  20.51 
 
 		 772 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0495637  normal  0.0162982 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2554  hypothetical protein  21.48 
 
 		 771 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0631379  normal  0.121883 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2803  hypothetical protein  20.52 
 
 		 772 aa  118  5e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.929153  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3723  RND efflux transporter  22.02 
 
 		 799 aa  117  6e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1910  hypothetical protein  21.56 
 
 		 771 aa  117  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0338156  normal  0.0625477 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2434  hypothetical protein  21.56 
 
 		 771 aa  117  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.338411  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2019  hypothetical protein  22.02 
 
 		 799 aa  117  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.62058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0540  hypothetical protein  19.26 
 
 		 764 aa  117  7.999999999999999e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1551  hypothetical protein  22.2 
 
 		 799 aa  117  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2222  hypothetical protein  21.08 
 
 		 768 aa  117  1.0000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1579  hypothetical protein  22.28 
 
 		 799 aa  115  3e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.69775  normal  0.0697261 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1534  RND superfamily exporter  21.39 
 
 		 787 aa  115  3e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0360223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4865  RND efflux transporter  21.57 
 
 		 786 aa  115  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.743305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3357  putative integral membrane protein  21.45 
 
 		 872 aa  114  8.000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.42147  normal  0.0868518 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3778  putative transport protein  21.3 
 
 		 796 aa  114  9e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000448082  decreased coverage  0.0000696113 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2441  hypothetical protein  21.43 
 
 		 771 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4897  hypothetical protein  23.4 
 
 		 864 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0154  RND efflux transporter  23.11 
 
 		 751 aa  112  2.0000000000000002e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3202  transporter, putative  19.58 
 
 		 826 aa  112  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.320198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3229  hypothetical protein  21.01 
 
 		 794 aa  111  5e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0514277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2064  RND efflux transporter  20.69 
 
 		 795 aa  109  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1808  hypothetical protein  20.33 
 
 		 767 aa  108  3e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2127  hypothetical protein  20.41 
 
 		 816 aa  107  7e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00224294  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0595  RND efflux transporter  20.37 
 
 		 806 aa  107  8e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.115384  hitchhiker  0.0000495016 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0582  RND efflux transporter  20.32 
 
 		 805 aa  106  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000135299 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0133  transporter, putative  21.9 
 
 		 808 aa  107  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.134014  normal  0.924862 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2060  hypothetical protein  21.47 
 
 		 790 aa  105  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.137629  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3429  hypothetical protein  22.16 
 
 		 787 aa  105  4e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1701  hypothetical protein  20.51 
 
 		 796 aa  105  5e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.49055 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0645  RND family transporter  20.61 
 
 		 834 aa  104  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0103634  normal  0.324813 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4325  transporter, putative  19.97 
 
 		 786 aa  104  6e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0993317 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4435  transporter, putative  19.97 
 
 		 786 aa  104  6e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.565976 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2006  RND superfamily exporter  20.67 
 
 		 794 aa  103  9e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.882933  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3777  hypothetical protein  19.67 
 
 		 796 aa  103  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6840  RND efflux transporter  20.63 
 
 		 786 aa  102  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.172281  normal  0.135262 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3300  exporter of the RND superfamily protein-like protein  20.62 
 
 		 967 aa  102  2e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.107727  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4346  RND efflux transporter  20.56 
 
 		 786 aa  102  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.312397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2165  transporter, putative  19.44 
 
 		 808 aa  102  3e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.119631 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3230  hypothetical protein  20.23 
 
 		 808 aa  102  4e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0901  HAE1 family efflux transporter  21.06 
 
 		 752 aa  102  4e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395656  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0456  HAE1 family efflux transporter  21.11 
 
 		 752 aa  101  5e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.857513  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2704  hypothetical protein  19.06 
 
 		 898 aa  101  5e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24330  hypothetical protein  21.28 
 
 		 793 aa  101  5e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.507248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1018  MMPL domain-containing protein  23.31 
 
 		 861 aa  101  6e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00165976  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2749  transporter, putative  21.08 
 
 		 804 aa  101  6e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00176897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1350  RND efflux transporter  19.37 
 
 		 790 aa  100  9e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000832069  decreased coverage  0.00000222062 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1269  RND superfamily protein  20.42 
 
 		 748 aa  100  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2812  transporter, putative  20.43 
 
 		 804 aa  99.8  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.796656  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>