294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1774 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1774  Patched family protein  100 
 
 		 815 aa  1656    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0392  exporter of the RND superfamily protein-like protein  46.65 
 
 		 837 aa  704    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0610  exporter of the RND superfamily protein-like protein  29.74 
 
 		 807 aa  334  5e-90  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2229  Patched family protein  25.98 
 
 		 755 aa  267  5.999999999999999e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.271746  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1317  RND efflux transporter  25.93 
 
 		 778 aa  260  6e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00469095  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2006  hypothetical protein  24.51 
 
 		 789 aa  254  4.0000000000000004e-66  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000691446  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0677  RND efflux transporter  24.47 
 
 		 811 aa  248  4e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08450  efflux transporter, putative, hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  23.98 
 
 		 764 aa  230  1e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1321  RND efflux transporter  26.28 
 
 		 800 aa  224  6e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1652  hypothetical protein  25.45 
 
 		 779 aa  222  1.9999999999999999e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0699635  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003709  predicted exporter of the RND superfamily  26.39 
 
 		 792 aa  221  6e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0540  hypothetical protein  26.5 
 
 		 764 aa  218  4e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2278  transport protein, putative  25.06 
 
 		 835 aa  217  7e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1279  hypothetical protein  24.25 
 
 		 821 aa  211  3e-53  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1180  hypothetical protein  23.18 
 
 		 801 aa  209  1e-52  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3675  membrane protein  25.13 
 
 		 808 aa  207  9e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1526  RND efflux transporter  24.97 
 
 		 756 aa  194  7e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2375  transport protein, putative  23.88 
 
 		 825 aa  188  4e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1161  Patched family protein  22.8 
 
 		 831 aa  181  4.999999999999999e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0460  putative exporter of the RND superfamily protein  22.58 
 
 		 806 aa  179  1e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2200  hypothetical protein  23.21 
 
 		 816 aa  178  4e-43  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0154  RND efflux transporter  25.63 
 
 		 751 aa  178  4e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0581  RND efflux transporter  24.9 
 
 		 788 aa  176  9.999999999999999e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.843516  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0413  conserved hypothetical protein, membrane  24.37 
 
 		 773 aa  176  9.999999999999999e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0655355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4151  hypothetical protein  22.89 
 
 		 807 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.735313  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1117  hypothetical protein  22.5 
 
 		 765 aa  174  5e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.103936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0277  hypothetical protein  24.1 
 
 		 823 aa  167  9e-40  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1376  hypothetical protein  24.38 
 
 		 823 aa  166  1.0000000000000001e-39  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0321  putative integral membrane protein  20.6 
 
 		 813 aa  166  1.0000000000000001e-39  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.322021  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1565  hypothetical protein  24.5 
 
 		 823 aa  166  2.0000000000000002e-39  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1281  resistance-nodulation-cell division family transporter  21.85 
 
 		 828 aa  165  4.0000000000000004e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.338562  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0806  hypothetical protein  24.1 
 
 		 1083 aa  164  6e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.712772  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3300  exporter of the RND superfamily protein-like protein  26.95 
 
 		 967 aa  163  1e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.107727  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1742  hypothetical protein  22.49 
 
 		 824 aa  162  2e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00144404  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0367  putative integral membrane protein  21.54 
 
 		 821 aa  159  2e-37  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.1024  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2787  transporter, putative  22.74 
 
 		 869 aa  152  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2968  RND efflux transporter  23.1 
 
 		 869 aa  151  4e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2986  RND efflux transporter  22.02 
 
 		 1051 aa  150  7e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.594238  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1805  Patched family protein  25.83 
 
 		 804 aa  150  8e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.732433  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0588  hypothetical protein  21.54 
 
 		 815 aa  150  8e-35  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04040  hypothetical protein  24.41 
 
 		 803 aa  149  2.0000000000000003e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0469  hypothetical protein  23.83 
 
 		 905 aa  145  4e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0258  hypothetical protein  21.13 
 
 		 767 aa  144  5e-33  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.467137  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3357  putative integral membrane protein  22.26 
 
 		 872 aa  138  5e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.42147  normal  0.0868518 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1519  putative integral membrane protein  21.22 
 
 		 859 aa  134  6e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.430265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0632  RND efflux transporter  20.91 
 
 		 763 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.510967  normal  0.17381 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1269  RND superfamily protein  21.7 
 
 		 748 aa  122  3e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3579  RND superfamily transporter  23.62 
 
 		 788 aa  120  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.900215  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1720  RND superfamily transporter  22.25 
 
 		 788 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.362573  normal  0.170717 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2467  RND efflux transporter  21.95 
 
 		 792 aa  119  1.9999999999999998e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.022945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2061  putative membrane transporter  23.24 
 
 		 796 aa  118  5e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2704  hypothetical protein  22.13 
 
 		 898 aa  117  6e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0958  hypothetical protein  21.25 
 
 		 779 aa  117  8.999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.764454  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0077  putative membrane transporter  23.19 
 
 		 797 aa  117  1.0000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.273508 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0562  hypothetical protein  22.18 
 
 		 800 aa  116  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.593707  normal  0.20774 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4267  putative RND superfamily transporter  23.22 
 
 		 789 aa  116  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1021  exporter of the RND superfamily protein-like protein  21.81 
 
 		 762 aa  111  6e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.119734  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0456  HAE1 family efflux transporter  20.69 
 
 		 752 aa  111  6e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.857513  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0943  RND efflux transporter  20.75 
 
 		 791 aa  111  6e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4691  putative transport protein  19.56 
 
 		 797 aa  110  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.628482  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1152  RND efflux transporter  24.68 
 
 		 692 aa  108  5e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0148359  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3230  hypothetical protein  21.83 
 
 		 808 aa  107  9e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1940  RND efflux transporter  23.37 
 
 		 877 aa  107  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1714  RND superfamily transporter  22.71 
 
 		 789 aa  106  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0904131 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0901  HAE1 family efflux transporter  21.28 
 
 		 752 aa  105  5e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395656  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2275  RND superfamily transporter  22.05 
 
 		 797 aa  104  6e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.857443  normal  0.323939 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05360  predicted exporters of the RND superfamily  23.48 
 
 		 727 aa  102  4e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000165826  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2270  putative transport protein  21.07 
 
 		 799 aa  101  4e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0857118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0768  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  20.3 
 
 		 747 aa  102  4e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.53096  normal  0.282667 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2963  putative membrane transporter  21.64 
 
 		 785 aa  99  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.581109 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0788  Patched family protein  22.82 
 
 		 923 aa  99  3e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2688  RND superfamily transporter  23.29 
 
 		 787 aa  98.6  4e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0209  Patched family protein  22.24 
 
 		 881 aa  98.6  4e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1238  hypothetical protein  22.22 
 
 		 855 aa  97.4  1e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.409284  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2275  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  20.19 
 
 		 812 aa  96.7  2e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0590834  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3183  exporter of the RND superfamily protein-like protein  21.53 
 
 		 717 aa  95.5  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1018  MMPL domain-containing protein  24.37 
 
 		 861 aa  95.5  4e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00165976  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4341  Patched family protein  22.68 
 
 		 895 aa  93.2  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.354864  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2918  exporter of the RND superfamily protein  21.54 
 
 		 1204 aa  92.4  3e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0248285  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1239  hypothetical protein  23.44 
 
 		 862 aa  91.7  5e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1525  hypothetical protein  23.17 
 
 		 694 aa  89.4  2e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1486  RND efflux transporter  23.7 
 
 		 694 aa  86.3  0.000000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0030427  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2744  RND efflux transporter  22.2 
 
 		 860 aa  85.1  0.000000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.343287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1056  efflux transporter, , hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  18.77 
 
 		 756 aa  83.6  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0557741  normal  0.21545 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0048  integral membrane protein  21.01 
 
 		 788 aa  83.6  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3229  hypothetical protein  20.69 
 
 		 794 aa  82.8  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0514277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0528  RND superfamily transporter  22.7 
 
 		 789 aa  82.4  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.760184 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0109  hypothetical protein  21.27 
 
 		 674 aa  80.1  0.0000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1961  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  19.65 
 
 		 758 aa  80.1  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3322  exporter of the RND superfamily protein-like protein  22.06 
 
 		 872 aa  80.1  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0582  RND efflux transporter  21.01 
 
 		 805 aa  79  0.0000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000135299 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1350  RND efflux transporter  18.58 
 
 		 790 aa  79  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000832069  decreased coverage  0.00000222062 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3150  RND superfamily protein  20.55 
 
 		 755 aa  78.6  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0817693  normal  0.0240782 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4897  hypothetical protein  18.75 
 
 		 864 aa  78.2  0.0000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2064  RND efflux transporter  21.9 
 
 		 795 aa  78.2  0.0000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2553  hypothetical protein  21.43 
 
 		 862 aa  78.2  0.0000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.531881  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1297  hypothetical protein  19.57 
 
 		 380 aa  77.8  0.0000000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1701  hypothetical protein  21.33 
 
 		 796 aa  77.4  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.49055 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1701  HAE1 family efflux transporter  19.39 
 
 		 777 aa  77.4  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.271028  normal  0.950997 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0264  MMPL domain-containing protein  25.37 
 
 		 385 aa  76.6  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00700265 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>