More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_1628 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_1628  RND superfamily protein-like exporter  100 
 
 		 921 aa  1743    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.221009 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1269  RND superfamily protein  27.54 
 
 		 748 aa  263  8.999999999999999e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1961  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  27.73 
 
 		 758 aa  262  2e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1056  efflux transporter, , hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  28.02 
 
 		 756 aa  258  5e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0557741  normal  0.21545 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4897  hypothetical protein  24.54 
 
 		 864 aa  250  7e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0867  HAE1 family efflux transporter  29.25 
 
 		 778 aa  246  9.999999999999999e-64  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0456  HAE1 family efflux transporter  28.1 
 
 		 752 aa  240  8e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.857513  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0901  HAE1 family efflux transporter  26.83 
 
 		 752 aa  218  2.9999999999999998e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395656  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1701  HAE1 family efflux transporter  26.01 
 
 		 777 aa  205  2e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.271028  normal  0.950997 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0222  efflux transporter, , hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  25.29 
 
 		 746 aa  205  4e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1059  HAE1 family efflux transporter  24.96 
 
 		 777 aa  201  5e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.101015 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0113  MMPL domain-containing protein  29.88 
 
 		 865 aa  186  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.382745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2275  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  27.87 
 
 		 812 aa  164  5.0000000000000005e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0590834  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3150  RND superfamily protein  28.68 
 
 		 755 aa  162  3e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0817693  normal  0.0240782 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0768  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  26 
 
 		 747 aa  152  4e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.53096  normal  0.282667 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4453  RND efflux transporter  31.38 
 
 		 889 aa  124  6e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2964  hypothetical protein  30.96 
 
 		 687 aa  115  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2999  MMPL domain-containing protein  30.09 
 
 		 821 aa  110  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1669  hypothetical protein  23.68 
 
 		 388 aa  108  5e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08450  efflux transporter, putative, hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  21.89 
 
 		 764 aa  98.2  7e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1637  hypothetical protein  24.62 
 
 		 385 aa  97.8  8e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3221  hypothetical protein  34.76 
 
 		 874 aa  96.3  3e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4341  Patched family protein  34.84 
 
 		 895 aa  92.8  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.354864  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0264  MMPL domain-containing protein  23.51 
 
 		 385 aa  91.7  6e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00700265 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0572  hypothetical protein  24.54 
 
 		 385 aa  90.5  1e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.67085  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1297  hypothetical protein  30 
 
 		 380 aa  90.1  2e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3322  exporter of the RND superfamily protein-like protein  36.32 
 
 		 872 aa  87  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1239  hypothetical protein  34.86 
 
 		 862 aa  84.3  0.000000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2865  Patched family protein  33.33 
 
 		 1011 aa  84.3  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2918  exporter of the RND superfamily protein  33.57 
 
 		 1204 aa  83.6  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0248285  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0860  Patched family protein  32.9 
 
 		 1131 aa  82.4  0.00000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1238  hypothetical protein  32.99 
 
 		 855 aa  81.3  0.00000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.409284  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1194  hypothetical protein  29.41 
 
 		 832 aa  80.1  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.0000134903  hitchhiker  0.0000145799 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2704  hypothetical protein  23.76 
 
 		 898 aa  78.2  0.0000000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3078  exporter of the RND superfamily protein-like protein  34.25 
 
 		 1109 aa  77.8  0.0000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2739  hypothetical protein  30.77 
 
 		 845 aa  76.6  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2375  transport protein, putative  26.01 
 
 		 825 aa  75.9  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1668  Patched family protein  35.71 
 
 		 842 aa  75.9  0.000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0297  hypothetical protein  21.91 
 
 		 387 aa  72  0.00000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.981573  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4493  MMPL domain protein  32.65 
 
 		 358 aa  70.1  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.617386  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0691  hypothetical protein  31.65 
 
 		 805 aa  69.3  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1526  RND efflux transporter  26.94 
 
 		 756 aa  68.9  0.0000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0788  Patched family protein  30.77 
 
 		 923 aa  67.8  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0225  MMPL domain-containing protein  33.33 
 
 		 745 aa  67  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.196903  normal  0.86442 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3196  MMPL domain-containing protein  25.16 
 
 		 1049 aa  66.6  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04040  hypothetical protein  19.81 
 
 		 803 aa  65.9  0.000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2278  transport protein, putative  29.53 
 
 		 835 aa  65.5  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6559  drug exporter of the RND superfamily-like protein  30.48 
 
 		 812 aa  65.5  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116362 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1161  Patched family protein  28.79 
 
 		 831 aa  65.5  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003709  predicted exporter of the RND superfamily  31.18 
 
 		 792 aa  65.1  0.000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0110  RND efflux transporter  25.64 
 
 		 674 aa  65.5  0.000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.384036  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0109  hypothetical protein  27.18 
 
 		 674 aa  65.5  0.000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0308  MMPL domain protein  29.49 
 
 		 717 aa  65.1  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2553  hypothetical protein  27.38 
 
 		 862 aa  64.7  0.000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.531881  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7157  MmpL domain-containing protein  30.46 
 
 		 723 aa  64.3  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00858649 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2681  hypothetical protein  29.29 
 
 		 879 aa  64.3  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.43238 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3339  MmpL domain-containing protein  33.55 
 
 		 732 aa  63.9  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0617981 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2752  drug exporter of the RND superfamily-like protein  34.35 
 
 		 724 aa  64.3  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0520418 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0020  Patched family protein  22.77 
 
 		 1359 aa  63.5  0.00000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.637086  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0469  hypothetical protein  24.8 
 
 		 905 aa  62.4  0.00000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2574  MMPL domain-containing protein  27.68 
 
 		 829 aa  62.8  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3675  membrane protein  20.45 
 
 		 808 aa  62.8  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2628  MMPL domain-containing protein  27.68 
 
 		 829 aa  62.8  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.971864  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2188  hypothetical protein  27.15 
 
 		 839 aa  62.4  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0580  putative transporter  20.27 
 
 		 1109 aa  61.2  0.00000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0665985  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3812  MMPL domain-containing protein  27.59 
 
 		 753 aa  61.2  0.00000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.443864  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3230  hypothetical protein  22.96 
 
 		 808 aa  61.2  0.00000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0591  MmpL family membrane protein  20.61 
 
 		 1109 aa  60.5  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0588  hypothetical protein  21.87 
 
 		 815 aa  60.8  0.0000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3091  exporter of the RND superfamily protein-like protein  34.03 
 
 		 776 aa  60.8  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.114197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1271  MMPL domain protein  33.33 
 
 		 747 aa  60.8  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.017354 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1018  MMPL domain-containing protein  26.77 
 
 		 861 aa  59.7  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00165976  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12363  transmembrane transport protein mmpL9  27.27 
 
 		 962 aa  60.1  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2082  RND superfamily exporter  25.84 
 
 		 893 aa  60.5  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10456  transmembrane transport protein mmpL4  29.78 
 
 		 967 aa  59.7  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3628  MMPL domain protein  28.24 
 
 		 737 aa  59.7  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0245  transporter, putative  28.09 
 
 		 893 aa  59.3  0.0000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1453  MMPL domain-containing protein  29.17 
 
 		 736 aa  59.3  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.213811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3778  putative transport protein  24.61 
 
 		 796 aa  59.7  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000448082  decreased coverage  0.0000696113 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0818  MMPL domain protein  34.13 
 
 		 1054 aa  59.3  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0967  MMPL domain protein  28.93 
 
 		 576 aa  59.3  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.100325 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3348  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  27.03 
 
 		 1045 aa  59.3  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2666  MMPL  31.25 
 
 		 778 aa  58.9  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.1973 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3357  putative integral membrane protein  24.21 
 
 		 872 aa  58.9  0.0000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.42147  normal  0.0868518 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05360  predicted exporters of the RND superfamily  28.12 
 
 		 727 aa  59.3  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000165826  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4865  RND efflux transporter  27.1 
 
 		 786 aa  58.9  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.743305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2986  RND efflux transporter  26.77 
 
 		 1051 aa  58.9  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.594238  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0456  hypothetical protein  28.86 
 
 		 849 aa  58.5  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.897508  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1742  hypothetical protein  24.74 
 
 		 824 aa  58.5  0.0000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00144404  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1774  Patched family protein  20.73 
 
 		 815 aa  58.2  0.0000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3359  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  26.78 
 
 		 883 aa  57.8  0.0000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000128558  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10518  transmembrane transport protein mmpL2  25.5 
 
 		 968 aa  57.8  0.0000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.930398 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1195  MMPL domain protein  26.36 
 
 		 741 aa  57.8  0.0000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4975  MMPL domain protein  27.68 
 
 		 682 aa  57.4  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0548  MMPL domain protein  28.99 
 
 		 684 aa  57.4  0.000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0460  putative exporter of the RND superfamily protein  22.67 
 
 		 806 aa  57.4  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4418  transport protein  27.41 
 
 		 948 aa  57.4  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.063936  normal  0.179465 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2608  exporter of the RND superfamily protein  28.16 
 
 		 860 aa  57.8  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0269848  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0656  MMPL domain-containing protein  34.41 
 
 		 796 aa  57.4  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.177102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5544  MmpL family membrane protein  25.87 
 
 		 632 aa  57.8  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0167345 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>