258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0548 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_0819  antibiotic ABC transporter, permease protein  48.39 
 
 
695 aa  655    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.23648  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0548  MMPL domain protein  100 
 
 
684 aa  1368    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1909  hypothetical protein  47.22 
 
 
692 aa  616  1e-175  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00515667  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1480  hypothetical protein  43.14 
 
 
701 aa  571  1e-161  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0156637  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0356  hypothetical protein  32.84 
 
 
685 aa  310  4e-83  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1709  hypothetical protein  27.96 
 
 
688 aa  295  3e-78  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0159  hypothetical protein  27.25 
 
 
706 aa  270  5e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2396  hypothetical protein  29.29 
 
 
724 aa  266  8e-70  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.92908 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1342  putative transporter  22.11 
 
 
730 aa  92  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.487554  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4002  putative transporter  22.04 
 
 
730 aa  89.4  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000986471 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2330  MMPL domain protein  22.17 
 
 
730 aa  86.3  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.949575  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1143  hypothetical protein  19.94 
 
 
704 aa  85.1  0.000000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3628  MMPL domain protein  21.09 
 
 
737 aa  84.3  0.000000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1206  MmpL family protein  22.24 
 
 
730 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3812  MMPL domain-containing protein  20.44 
 
 
753 aa  82  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.443864  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1184  transporter  21.63 
 
 
730 aa  80.1  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.410115  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3618  MMPL domain-containing protein  22.01 
 
 
712 aa  79.3  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1182  transporter  21.35 
 
 
730 aa  77.8  0.0000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0572  hypothetical protein  23.59 
 
 
385 aa  78.2  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.67085  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0264  MMPL domain-containing protein  23.59 
 
 
385 aa  77.4  0.0000000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00700265 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1204  transporter  21.31 
 
 
730 aa  77  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1380  putative transporter  21.31 
 
 
730 aa  77  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.032742 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1302  transporter  21.31 
 
 
730 aa  77  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1669  hypothetical protein  23.83 
 
 
388 aa  77  0.000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1444  putative transporter  21.93 
 
 
730 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0335  MMPL domain protein  22.21 
 
 
702 aa  75.5  0.000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.114406 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1637  hypothetical protein  23.59 
 
 
385 aa  74.3  0.000000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1297  hypothetical protein  23.14 
 
 
380 aa  73.9  0.000000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08450  efflux transporter, putative, hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  20.63 
 
 
764 aa  73.6  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1403  transporter, putative  21.08 
 
 
730 aa  72.4  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1012  transporter  20.38 
 
 
729 aa  70.5  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.699507  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2628  MMPL domain-containing protein  23.74 
 
 
829 aa  70.1  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.971864  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1512  MMPL domain-containing protein  21.44 
 
 
713 aa  70.1  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.625812  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2574  MMPL domain-containing protein  23.74 
 
 
829 aa  70.1  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2637  MMPL domain protein  21.61 
 
 
1013 aa  69.7  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0905  MMPL domain protein  21.56 
 
 
713 aa  69.3  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2964  hypothetical protein  28.66 
 
 
687 aa  69.3  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1961  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  20.4 
 
 
758 aa  68.6  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4841  MMPL  24.56 
 
 
1022 aa  68.9  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0784394  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4929  MMPL domain-containing protein  24.56 
 
 
1022 aa  68.9  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.559096  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0222  efflux transporter, , hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  20.87 
 
 
746 aa  68.2  0.0000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0020  Patched family protein  21.68 
 
 
1359 aa  68.2  0.0000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.637086  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2275  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  19.26 
 
 
812 aa  67.4  0.0000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0590834  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37330  predicted RND superfamily drug exporter  23.5 
 
 
699 aa  67.4  0.0000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.366571 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7072  MMPL domain protein  20.37 
 
 
710 aa  67.4  0.0000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.369607  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15430  predicted RND superfamily drug exporter  20.57 
 
 
775 aa  67  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.246156  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0312  MMPL domain-containing protein  24.58 
 
 
1028 aa  66.6  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4595  MMPL domain-containing protein  32.92 
 
 
1040 aa  66.6  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4975  MMPL domain protein  22.97 
 
 
682 aa  67  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4632  MMPL domain-containing protein  32.92 
 
 
681 aa  67  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.839502 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7115  MMPL domain-containing protein  21.65 
 
 
699 aa  65.9  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.910736  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1269  RND superfamily protein  19.96 
 
 
748 aa  66.2  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0788  Patched family protein  27.49 
 
 
923 aa  66.2  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1018  MMPL domain-containing protein  24.79 
 
 
861 aa  66.2  0.000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00165976  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15720  predicted RND superfamily drug exporter  20.92 
 
 
920 aa  65.9  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.448336  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1195  MMPL domain protein  23.87 
 
 
741 aa  65.5  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_775  membrane protein, MmpL family  23.55 
 
 
974 aa  65.1  0.000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2999  MMPL domain-containing protein  24.89 
 
 
821 aa  64.3  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11555  transmembrane transport protein mmpL12  24.74 
 
 
1146 aa  62.8  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0225  MMPL domain-containing protein  26.58 
 
 
745 aa  63.2  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.196903  normal  0.86442 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1049  MMPL domain protein  20.13 
 
 
723 aa  62  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.700963  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1271  MMPL domain protein  21.21 
 
 
747 aa  61.6  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.017354 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0297  hypothetical protein  26.19 
 
 
387 aa  61.6  0.00000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.981573  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2900  MMPL domain-containing protein  22.88 
 
 
1003 aa  62  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.689966  normal  0.0696558 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0482  MMPL domain protein  22.1 
 
 
909 aa  61.6  0.00000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0790  MMPL domain-containing protein  26.34 
 
 
974 aa  61.6  0.00000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0872  MmpL family membrane protein  23.39 
 
 
981 aa  60.8  0.00000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0881306  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2220  MMPL domain-containing protein  22.29 
 
 
743 aa  60.8  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.243308  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2627  MMPL domain protein  21.52 
 
 
701 aa  60.8  0.00000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.606801  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1180  hypothetical protein  21.11 
 
 
801 aa  60.1  0.0000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6213  drug exporter of the RND superfamily-like protein  22.31 
 
 
736 aa  60.5  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.509369 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3120  MMPL domain-containing protein  21.22 
 
 
699 aa  60.5  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.184679  hitchhiker  0.00179324 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0591  MmpL family membrane protein  23.05 
 
 
1109 aa  60.5  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0580  putative transporter  23.38 
 
 
1109 aa  60.1  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0665985  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11207  transmembrane transport protein mmpL10  20.23 
 
 
1002 aa  60.5  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12363  transmembrane transport protein mmpL9  23.53 
 
 
962 aa  60.1  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0161  hypothetical protein  24.42 
 
 
934 aa  60.5  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.703618 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4897  hypothetical protein  22.71 
 
 
864 aa  59.7  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4241  MMPL domain protein  22.42 
 
 
709 aa  59.3  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.682094  normal  0.157718 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0967  MMPL domain protein  22.65 
 
 
576 aa  59.3  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.100325 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4509  MMPL domain protein  20.41 
 
 
723 aa  59.7  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0507667  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1701  HAE1 family efflux transporter  22.49 
 
 
777 aa  59.7  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.271028  normal  0.950997 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2844  MMPL domain protein  21.09 
 
 
738 aa  59.3  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10456  transmembrane transport protein mmpL4  21.84 
 
 
967 aa  58.9  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0467  MMPL domain-containing protein  19.97 
 
 
731 aa  58.9  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0196039  normal  0.101106 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17640  predicted RND superfamily drug exporter  20.98 
 
 
761 aa  58.5  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0285272 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0109  hypothetical protein  24.33 
 
 
674 aa  58.2  0.0000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1013  hypothetical protein  21.81 
 
 
860 aa  58.2  0.0000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000000218575 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13857  integral membrane transport protein mmpL8  21.48 
 
 
1089 aa  57.8  0.0000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1013  hypothetical protein  26.79 
 
 
906 aa  57.8  0.0000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2842  drug exporter of the RND superfamily-like protein  20.92 
 
 
740 aa  57.8  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1238  hypothetical protein  30 
 
 
855 aa  57.4  0.0000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.409284  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5128  MMPL domain-containing protein  23.73 
 
 
740 aa  57.4  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6559  drug exporter of the RND superfamily-like protein  26.74 
 
 
812 aa  57.4  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116362 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1057  transport protein  23.3 
 
 
963 aa  57.4  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10690  transmembrane transport protein mmpL5  24.15 
 
 
964 aa  56.6  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0196  large membrane protein  28.65 
 
 
1013 aa  57  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4825  transport protein  21.35 
 
 
1001 aa  57.4  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.718694 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2658  MMPL domain protein  19.66 
 
 
841 aa  55.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3656  MMPL domain-containing protein  20.55 
 
 
719 aa  55.8  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0733435  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>