285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1180 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG1180  hypothetical protein  100 
 
 		 801 aa  1639    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2006  hypothetical protein  36.9 
 
 		 789 aa  546  1e-154  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000691446  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0610  exporter of the RND superfamily protein-like protein  28.07 
 
 		 807 aa  318  2e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0392  exporter of the RND superfamily protein-like protein  25.06 
 
 		 837 aa  237  8e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1317  RND efflux transporter  25.46 
 
 		 778 aa  231  4e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00469095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1774  Patched family protein  23.17 
 
 		 815 aa  215  2.9999999999999995e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2229  Patched family protein  26.88 
 
 		 755 aa  210  9e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.271746  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0677  RND efflux transporter  24.06 
 
 		 811 aa  202  1.9999999999999998e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0540  hypothetical protein  23.78 
 
 		 764 aa  192  2.9999999999999997e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08450  efflux transporter, putative, hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  24.05 
 
 		 764 aa  189  2e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1652  hypothetical protein  23.09 
 
 		 779 aa  180  8e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0699635  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1321  RND efflux transporter  23.08 
 
 		 800 aa  177  9.999999999999999e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2986  RND efflux transporter  22.11 
 
 		 1051 aa  172  2e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.594238  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1161  Patched family protein  22.51 
 
 		 831 aa  150  6e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3675  membrane protein  22.97 
 
 		 808 aa  149  2.0000000000000003e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003709  predicted exporter of the RND superfamily  21.68 
 
 		 792 aa  148  3e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1279  hypothetical protein  22.64 
 
 		 821 aa  145  3e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0413  conserved hypothetical protein, membrane  20.82 
 
 		 773 aa  144  6e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0655355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0581  RND efflux transporter  21.85 
 
 		 788 aa  142  3e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.843516  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0632  RND efflux transporter  22.99 
 
 		 763 aa  141  3.9999999999999997e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.510967  normal  0.17381 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4151  hypothetical protein  23.78 
 
 		 807 aa  141  3.9999999999999997e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.735313  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2787  transporter, putative  24.1 
 
 		 869 aa  134  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0460  putative exporter of the RND superfamily protein  22.46 
 
 		 806 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0154  RND efflux transporter  23.89 
 
 		 751 aa  130  1.0000000000000001e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2968  RND efflux transporter  23.77 
 
 		 869 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0321  putative integral membrane protein  20.7 
 
 		 813 aa  129  2.0000000000000002e-28  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.322021  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1742  hypothetical protein  22.07 
 
 		 824 aa  129  3e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00144404  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1281  resistance-nodulation-cell division family transporter  22.05 
 
 		 828 aa  127  6e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.338562  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2278  transport protein, putative  23.82 
 
 		 835 aa  127  6e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0806  hypothetical protein  22.49 
 
 		 1083 aa  126  1e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.712772  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1526  RND efflux transporter  23.73 
 
 		 756 aa  126  1e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0258  hypothetical protein  22.24 
 
 		 767 aa  125  2e-27  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.467137  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0367  putative integral membrane protein  22.81 
 
 		 821 aa  125  4e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.1024  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0469  hypothetical protein  23.96 
 
 		 905 aa  123  1.9999999999999998e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3357  putative integral membrane protein  24.61 
 
 		 872 aa  122  1.9999999999999998e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.42147  normal  0.0868518 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04040  hypothetical protein  21.77 
 
 		 803 aa  117  6e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2467  RND efflux transporter  21.47 
 
 		 792 aa  117  6.9999999999999995e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.022945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1805  Patched family protein  20.7 
 
 		 804 aa  116  1.0000000000000001e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.732433  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1376  hypothetical protein  21.76 
 
 		 823 aa  113  1.0000000000000001e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0958  hypothetical protein  19.92 
 
 		 779 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.764454  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1018  MMPL domain-containing protein  22.84 
 
 		 861 aa  113  2.0000000000000002e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00165976  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1565  hypothetical protein  21.76 
 
 		 823 aa  112  3e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0943  RND efflux transporter  20.57 
 
 		 791 aa  112  4.0000000000000004e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0277  hypothetical protein  21.26 
 
 		 823 aa  108  3e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2375  transport protein, putative  22.17 
 
 		 825 aa  108  4e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2704  hypothetical protein  26.03 
 
 		 898 aa  107  1e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0582  RND efflux transporter  21.74 
 
 		 805 aa  103  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000135299 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0588  hypothetical protein  21.53 
 
 		 815 aa  103  1e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0595  RND efflux transporter  21.29 
 
 		 806 aa  102  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.115384  hitchhiker  0.0000495016 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1350  RND efflux transporter  19.25 
 
 		 790 aa  98.2  5e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000832069  decreased coverage  0.00000222062 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2200  hypothetical protein  21.51 
 
 		 816 aa  97.4  8e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4691  putative transport protein  18.89 
 
 		 797 aa  95.5  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.628482  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2270  putative transport protein  21.47 
 
 		 799 aa  94  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0857118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1117  hypothetical protein  20.03 
 
 		 765 aa  90.9  8e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.103936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2061  putative membrane transporter  22.37 
 
 		 796 aa  90.1  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3300  exporter of the RND superfamily protein-like protein  22.57 
 
 		 967 aa  89  3e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.107727  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0077  putative membrane transporter  22.03 
 
 		 797 aa  88.6  4e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.273508 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1519  putative integral membrane protein  32.72 
 
 		 859 aa  86.7  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.430265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1269  RND superfamily protein  20.17 
 
 		 748 aa  85.9  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0885  RND efflux transporter  21.58 
 
 		 805 aa  85.5  0.000000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0397  RND efflux transporter  21.58 
 
 		 805 aa  85.5  0.000000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0562  hypothetical protein  21.41 
 
 		 800 aa  84.7  0.000000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.593707  normal  0.20774 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0901  HAE1 family efflux transporter  22.26 
 
 		 752 aa  84.7  0.000000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395656  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1056  efflux transporter, , hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  19.97 
 
 		 756 aa  84.7  0.000000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0557741  normal  0.21545 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3230  hypothetical protein  19.87 
 
 		 808 aa  83.6  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0209  Patched family protein  25 
 
 		 881 aa  82.8  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0020  Patched family protein  20.92 
 
 		 1359 aa  81.3  0.00000000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.637086  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0768  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  19.42 
 
 		 747 aa  80.1  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.53096  normal  0.282667 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4267  putative RND superfamily transporter  21.12 
 
 		 789 aa  79.7  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0048  integral membrane protein  21.56 
 
 		 788 aa  79.3  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1637  hypothetical protein  21.82 
 
 		 385 aa  76.3  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3229  hypothetical protein  18.99 
 
 		 794 aa  75.9  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0514277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1701  hypothetical protein  19.11 
 
 		 796 aa  74.7  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.49055 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2963  putative membrane transporter  20.83 
 
 		 785 aa  73.6  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.581109 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2562  RND efflux transporter  22.22 
 
 		 697 aa  73.2  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.143404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1422  RND efflux transporter  20.41 
 
 		 865 aa  73.2  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0501757  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3183  exporter of the RND superfamily protein-like protein  21.07 
 
 		 717 aa  73.2  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2275  RND superfamily transporter  21.19 
 
 		 797 aa  72  0.00000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.857443  normal  0.323939 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1143  hypothetical protein  20.91 
 
 		 704 aa  72  0.00000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2744  RND efflux transporter  21.99 
 
 		 860 aa  71.2  0.00000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.343287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1940  RND efflux transporter  21.03 
 
 		 877 aa  71.2  0.00000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1021  exporter of the RND superfamily protein-like protein  22.41 
 
 		 762 aa  70.1  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.119734  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2275  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  24.34 
 
 		 812 aa  70.1  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0590834  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3777  hypothetical protein  18.71 
 
 		 796 aa  68.6  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05360  predicted exporters of the RND superfamily  17.8 
 
 		 727 aa  68.2  0.0000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000165826  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3579  RND superfamily transporter  20.9 
 
 		 788 aa  68.6  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.900215  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3164  hypothetical protein  18.35 
 
 		 784 aa  68.2  0.0000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.330305  normal  0.727475 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0222  efflux transporter, , hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  20 
 
 		 746 aa  67.8  0.0000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03830  hypothetical membrane protein  22.21 
 
 		 1225 aa  67.8  0.0000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2918  exporter of the RND superfamily protein  21.03 
 
 		 1204 aa  67.4  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0248285  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0691  hypothetical protein  21.28 
 
 		 805 aa  67  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0572  hypothetical protein  21.09 
 
 		 385 aa  66.2  0.000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.67085  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2060  hypothetical protein  20.1 
 
 		 790 aa  66.2  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.137629  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0264  MMPL domain-containing protein  20.49 
 
 		 385 aa  65.5  0.000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00700265 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1961  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  20.61 
 
 		 758 aa  65.1  0.000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1669  hypothetical protein  29.37 
 
 		 388 aa  65.1  0.000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2477  hypothetical protein  19.49 
 
 		 772 aa  64.7  0.000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0495637  normal  0.0162982 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1591  hypothetical protein  19.65 
 
 		 768 aa  64.7  0.000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6781  RND efflux transporter  20.11 
 
 		 799 aa  64.3  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4897  hypothetical protein  20.03 
 
 		 864 aa  63.5  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>