233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2006 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE2006  hypothetical protein  100 
 
 		 789 aa  1602    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000691446  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1180  hypothetical protein  36.54 
 
 		 801 aa  531  1e-149  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0610  exporter of the RND superfamily protein-like protein  24.66 
 
 		 807 aa  272  2e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0392  exporter of the RND superfamily protein-like protein  24.62 
 
 		 837 aa  244  3.9999999999999997e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1774  Patched family protein  24.22 
 
 		 815 aa  239  1e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1317  RND efflux transporter  24.16 
 
 		 778 aa  217  8e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00469095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2229  Patched family protein  25.67 
 
 		 755 aa  197  6e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.271746  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0677  RND efflux transporter  23.04 
 
 		 811 aa  195  3e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1321  RND efflux transporter  25 
 
 		 800 aa  175  2.9999999999999996e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3675  membrane protein  23.16 
 
 		 808 aa  169  2.9999999999999998e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003709  predicted exporter of the RND superfamily  22.8 
 
 		 792 aa  166  2.0000000000000002e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1526  RND efflux transporter  23.61 
 
 		 756 aa  165  3e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0632  RND efflux transporter  22.54 
 
 		 763 aa  159  3e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.510967  normal  0.17381 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08450  efflux transporter, putative, hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  23.14 
 
 		 764 aa  157  9e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0540  hypothetical protein  21.13 
 
 		 764 aa  155  4e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1652  hypothetical protein  22.09 
 
 		 779 aa  153  8.999999999999999e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0699635  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0581  RND efflux transporter  23.03 
 
 		 788 aa  142  3e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.843516  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2986  RND efflux transporter  20.77 
 
 		 1051 aa  135  3e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.594238  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2467  RND efflux transporter  21.05 
 
 		 792 aa  131  4.0000000000000003e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.022945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0154  RND efflux transporter  25.15 
 
 		 751 aa  129  2.0000000000000002e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1161  Patched family protein  21.05 
 
 		 831 aa  128  3e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0460  putative exporter of the RND superfamily protein  20.96 
 
 		 806 aa  125  4e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0806  hypothetical protein  22.72 
 
 		 1083 aa  122  1.9999999999999998e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.712772  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1805  Patched family protein  22.12 
 
 		 804 aa  122  1.9999999999999998e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.732433  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0413  conserved hypothetical protein, membrane  20.2 
 
 		 773 aa  119  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0655355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2278  transport protein, putative  21.02 
 
 		 835 aa  117  8.999999999999998e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04040  hypothetical protein  21.92 
 
 		 803 aa  115  2.0000000000000002e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1350  RND efflux transporter  20.33 
 
 		 790 aa  111  5e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000832069  decreased coverage  0.00000222062 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1742  hypothetical protein  22.37 
 
 		 824 aa  111  6e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00144404  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0321  putative integral membrane protein  21.88 
 
 		 813 aa  110  1e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.322021  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1279  hypothetical protein  22.63 
 
 		 821 aa  109  2e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4151  hypothetical protein  22.75 
 
 		 807 aa  108  3e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.735313  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2375  transport protein, putative  21.59 
 
 		 825 aa  107  6e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0943  RND efflux transporter  19.3 
 
 		 791 aa  105  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4691  putative transport protein  18.89 
 
 		 797 aa  105  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.628482  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3357  putative integral membrane protein  22 
 
 		 872 aa  102  3e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.42147  normal  0.0868518 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1018  MMPL domain-containing protein  23.94 
 
 		 861 aa  102  4e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00165976  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3230  hypothetical protein  21.07 
 
 		 808 aa  101  5e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1281  resistance-nodulation-cell division family transporter  21.53 
 
 		 828 aa  100  7e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.338562  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2200  hypothetical protein  20.96 
 
 		 816 aa  100  8e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0077  putative membrane transporter  20.18 
 
 		 797 aa  97.1  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.273508 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0562  hypothetical protein  23.75 
 
 		 800 aa  94.7  5e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.593707  normal  0.20774 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1269  RND superfamily protein  20.34 
 
 		 748 aa  93.2  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1714  RND superfamily transporter  19.78 
 
 		 789 aa  92  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0904131 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2061  putative membrane transporter  18.45 
 
 		 796 aa  91.7  5e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1565  hypothetical protein  23.42 
 
 		 823 aa  90.1  1e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0277  hypothetical protein  23.55 
 
 		 823 aa  90.1  1e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0367  putative integral membrane protein  21.13 
 
 		 821 aa  89.7  2e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.1024  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4267  putative RND superfamily transporter  19.73 
 
 		 789 aa  89.4  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0588  hypothetical protein  21.39 
 
 		 815 aa  87.8  8e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1940  RND efflux transporter  25.43 
 
 		 877 aa  87  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1376  hypothetical protein  23.28 
 
 		 823 aa  87  0.000000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1720  RND superfamily transporter  19.78 
 
 		 788 aa  86.7  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.362573  normal  0.170717 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2270  putative transport protein  19.6 
 
 		 799 aa  85.1  0.000000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0857118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2963  putative membrane transporter  19.41 
 
 		 785 aa  84.7  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.581109 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2275  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  24.07 
 
 		 812 aa  84.7  0.000000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0590834  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2918  exporter of the RND superfamily protein  23.29 
 
 		 1204 aa  84.3  0.000000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0248285  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1117  hypothetical protein  18.92 
 
 		 765 aa  84.7  0.000000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.103936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0209  Patched family protein  22.02 
 
 		 881 aa  84.3  0.000000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3778  putative transport protein  19.53 
 
 		 796 aa  82.8  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000448082  decreased coverage  0.0000696113 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1486  RND efflux transporter  23.11 
 
 		 694 aa  83.2  0.00000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0030427  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0258  hypothetical protein  20.78 
 
 		 767 aa  82  0.00000000000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.467137  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2275  RND superfamily transporter  18.34 
 
 		 797 aa  81.6  0.00000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.857443  normal  0.323939 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0958  hypothetical protein  19.67 
 
 		 779 aa  79  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.764454  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2968  RND efflux transporter  20.56 
 
 		 869 aa  78.2  0.0000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1519  putative integral membrane protein  29.17 
 
 		 859 aa  78.2  0.0000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.430265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1525  hypothetical protein  21.67 
 
 		 694 aa  77.8  0.0000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2787  transporter, putative  20.2 
 
 		 869 aa  76.6  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2704  hypothetical protein  22.65 
 
 		 898 aa  76.6  0.000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3300  exporter of the RND superfamily protein-like protein  22.5 
 
 		 967 aa  76.3  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.107727  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0867  HAE1 family efflux transporter  21.29 
 
 		 778 aa  76.6  0.000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3579  RND superfamily transporter  18.73 
 
 		 788 aa  75.1  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.900215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1152  RND efflux transporter  21.72 
 
 		 692 aa  73.9  0.00000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0148359  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0691  hypothetical protein  22.5 
 
 		 805 aa  73.2  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1422  RND efflux transporter  22.34 
 
 		 865 aa  73.2  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0501757  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2744  RND efflux transporter  21.31 
 
 		 860 aa  72  0.00000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.343287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05360  predicted exporters of the RND superfamily  20.62 
 
 		 727 aa  70.5  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000165826  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2688  RND superfamily transporter  19.04 
 
 		 787 aa  70.1  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1238  hypothetical protein  20.23 
 
 		 855 aa  68.2  0.0000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.409284  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0469  hypothetical protein  24 
 
 		 905 aa  67.4  0.000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0048  integral membrane protein  20.04 
 
 		 788 aa  66.6  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1078  phospholipid/glycerol acyltransferase  19.97 
 
 		 1226 aa  66.2  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0582  RND efflux transporter  20.71 
 
 		 805 aa  64.7  0.000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000135299 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0595  RND efflux transporter  20.9 
 
 		 806 aa  64.3  0.000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.115384  hitchhiker  0.0000495016 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4002  putative transporter  21.73 
 
 		 730 aa  63.5  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000986471 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0456  HAE1 family efflux transporter  19.36 
 
 		 752 aa  63.9  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.857513  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2865  Patched family protein  19.59 
 
 		 1011 aa  62.8  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3091  exporter of the RND superfamily protein-like protein  27.23 
 
 		 776 aa  62.8  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.114197  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3221  hypothetical protein  20.8 
 
 		 874 aa  61.6  0.00000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3359  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  33.08 
 
 		 883 aa  61.6  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000128558  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0768  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  19.79 
 
 		 747 aa  61.6  0.00000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.53096  normal  0.282667 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1021  RND efflux transporter  26.85 
 
 		 920 aa  61.6  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000753999  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3150  RND superfamily protein  19.34 
 
 		 755 aa  61.2  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0817693  normal  0.0240782 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0886  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  28 
 
 		 883 aa  61.6  0.00000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.34494e-16 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0901  HAE1 family efflux transporter  19.01 
 
 		 752 aa  60.8  0.00000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395656  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1021  exporter of the RND superfamily protein-like protein  24.29 
 
 		 762 aa  60.5  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.119734  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1057  transport protein  22.72 
 
 		 963 aa  60.8  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1297  hypothetical protein  25 
 
 		 380 aa  59.3  0.0000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0383  phospholipid/glycerol acyltransferase  20.54 
 
 		 1172 aa  60.1  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3142  transporter, putative  20.32 
 
 		 799 aa  59.7  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>