238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0540 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_003709  predicted exporter of the RND superfamily  45.88 
 
 		 792 aa  669    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1652  hypothetical protein  53.48 
 
 		 779 aa  798    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0699635  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1321  RND efflux transporter  50.07 
 
 		 800 aa  775    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0677  RND efflux transporter  45.63 
 
 		 811 aa  677    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0540  hypothetical protein  100 
 
 		 764 aa  1555    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1117  hypothetical protein  33.91 
 
 		 765 aa  468  9.999999999999999e-131  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.103936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0610  exporter of the RND superfamily protein-like protein  28.74 
 
 		 807 aa  279  1e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1317  RND efflux transporter  25.65 
 
 		 778 aa  262  2e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00469095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2229  Patched family protein  26.43 
 
 		 755 aa  243  7.999999999999999e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.271746  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0392  exporter of the RND superfamily protein-like protein  25.68 
 
 		 837 aa  229  1e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3183  exporter of the RND superfamily protein-like protein  25.59 
 
 		 717 aa  227  7e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1774  Patched family protein  26.26 
 
 		 815 aa  219  2e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1180  hypothetical protein  23.66 
 
 		 801 aa  188  3e-46  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3168  exporter of the RND superfamily protein-like protein  22.58 
 
 		 723 aa  178  3e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.210013  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2006  hypothetical protein  21.74 
 
 		 789 aa  171  5e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000691446  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0154  RND efflux transporter  25.03 
 
 		 751 aa  171  5e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3675  membrane protein  20.78 
 
 		 808 aa  169  2.9999999999999998e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2986  RND efflux transporter  21.97 
 
 		 1051 aa  164  8.000000000000001e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.594238  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1526  RND efflux transporter  22.91 
 
 		 756 aa  150  6e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2787  transporter, putative  22.76 
 
 		 869 aa  148  5e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08450  efflux transporter, putative, hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  21.1 
 
 		 764 aa  146  1e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2968  RND efflux transporter  22.92 
 
 		 869 aa  146  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4151  hypothetical protein  22.76 
 
 		 807 aa  146  1e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.735313  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0460  putative exporter of the RND superfamily protein  21.72 
 
 		 806 aa  145  3e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0632  RND efflux transporter  24.38 
 
 		 763 aa  138  3.0000000000000003e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.510967  normal  0.17381 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1161  Patched family protein  21.72 
 
 		 831 aa  133  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0321  putative integral membrane protein  22.19 
 
 		 813 aa  131  5.0000000000000004e-29  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.322021  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0806  hypothetical protein  20.62 
 
 		 1083 aa  124  5e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.712772  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2278  transport protein, putative  21.69 
 
 		 835 aa  124  6e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0413  conserved hypothetical protein, membrane  20.56 
 
 		 773 aa  122  3e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0655355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0581  RND efflux transporter  19.09 
 
 		 788 aa  120  9.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.843516  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1281  resistance-nodulation-cell division family transporter  20.5 
 
 		 828 aa  119  3e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.338562  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1805  Patched family protein  23.6 
 
 		 804 aa  119  3e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.732433  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1279  hypothetical protein  21.07 
 
 		 821 aa  118  3.9999999999999997e-25  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0367  putative integral membrane protein  21.54 
 
 		 821 aa  117  1.0000000000000001e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.1024  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0469  hypothetical protein  21.65 
 
 		 905 aa  114  5e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2375  transport protein, putative  24.14 
 
 		 825 aa  114  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0958  hypothetical protein  20.66 
 
 		 779 aa  108  3e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.764454  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0258  hypothetical protein  21.05 
 
 		 767 aa  107  1e-21  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.467137  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3300  exporter of the RND superfamily protein-like protein  24.35 
 
 		 967 aa  106  2e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.107727  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2270  putative transport protein  21.11 
 
 		 799 aa  105  3e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0857118  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04040  hypothetical protein  20.03 
 
 		 803 aa  104  5e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0562  hypothetical protein  23.36 
 
 		 800 aa  99  3e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.593707  normal  0.20774 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0588  hypothetical protein  20.55 
 
 		 815 aa  98.2  6e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3778  putative transport protein  19.85 
 
 		 796 aa  97.4  8e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000448082  decreased coverage  0.0000696113 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0209  Patched family protein  22.36 
 
 		 881 aa  97.4  1e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1021  exporter of the RND superfamily protein-like protein  25.43 
 
 		 762 aa  96.7  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.119734  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2200  hypothetical protein  20.69 
 
 		 816 aa  96.3  2e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2704  hypothetical protein  21.77 
 
 		 898 aa  95.5  3e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1742  hypothetical protein  20.12 
 
 		 824 aa  95.5  3e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00144404  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0109  hypothetical protein  21.67 
 
 		 674 aa  92  4e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2744  RND efflux transporter  21.34 
 
 		 860 aa  91.3  6e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.343287  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0048  integral membrane protein  24.84 
 
 		 788 aa  89.4  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0110  RND efflux transporter  21.52 
 
 		 674 aa  87.8  7e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.384036  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05360  predicted exporters of the RND superfamily  23.67 
 
 		 727 aa  87  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000165826  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4267  putative RND superfamily transporter  21.29 
 
 		 789 aa  87  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2061  putative membrane transporter  22.68 
 
 		 796 aa  85.9  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1940  RND efflux transporter  21.35 
 
 		 877 aa  85.9  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0768  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  19.13 
 
 		 747 aa  84.3  0.000000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.53096  normal  0.282667 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2467  RND efflux transporter  19.22 
 
 		 792 aa  82.8  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.022945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1376  hypothetical protein  20.13 
 
 		 823 aa  82.8  0.00000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1565  hypothetical protein  20.13 
 
 		 823 aa  81.3  0.00000000000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2477  hypothetical protein  21.61 
 
 		 772 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0495637  normal  0.0162982 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0901  HAE1 family efflux transporter  20.86 
 
 		 752 aa  80.5  0.0000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395656  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1941  Patched family protein  21.92 
 
 		 767 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.314196  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2594  hypothetical protein  21.13 
 
 		 771 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4897  hypothetical protein  21.1 
 
 		 864 aa  79  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0277  hypothetical protein  19.61 
 
 		 823 aa  79  0.0000000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1808  hypothetical protein  20.85 
 
 		 767 aa  78.6  0.0000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1152  RND efflux transporter  23.67 
 
 		 692 aa  77.4  0.0000000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0148359  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1422  RND efflux transporter  21.02 
 
 		 865 aa  77.4  0.0000000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0501757  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1720  RND superfamily transporter  22.41 
 
 		 788 aa  77  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.362573  normal  0.170717 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1519  putative integral membrane protein  33.81 
 
 		 859 aa  76.6  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.430265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3230  hypothetical protein  19.88 
 
 		 808 aa  75.9  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1701  HAE1 family efflux transporter  20.39 
 
 		 777 aa  75.5  0.000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.271028  normal  0.950997 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1269  RND superfamily protein  19.85 
 
 		 748 aa  75.5  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3579  RND superfamily transporter  23.03 
 
 		 788 aa  75.1  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.900215  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1679  hypothetical protein  20.76 
 
 		 771 aa  75.5  0.000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.980542  normal  0.247829 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1754  hypothetical protein  20.76 
 
 		 771 aa  75.5  0.000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0558079  normal  0.523278 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1056  efflux transporter, , hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  19.79 
 
 		 756 aa  75.1  0.000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0557741  normal  0.21545 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1910  hypothetical protein  20.08 
 
 		 771 aa  74.7  0.000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0338156  normal  0.0625477 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2554  hypothetical protein  20.08 
 
 		 771 aa  74.3  0.000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0631379  normal  0.121883 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2434  hypothetical protein  20.08 
 
 		 771 aa  74.7  0.000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.338411  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2275  RND superfamily transporter  22.94 
 
 		 797 aa  73.9  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.857443  normal  0.323939 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1784  hypothetical protein  20.63 
 
 		 771 aa  73.6  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.455314  normal  0.263872 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3429  hypothetical protein  21.46 
 
 		 787 aa  72.8  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1447  RND efflux transporter  21.68 
 
 		 820 aa  73.2  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.751862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0077  putative membrane transporter  22.65 
 
 		 797 aa  72  0.00000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.273508 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1534  RND superfamily exporter  21.44 
 
 		 787 aa  71.6  0.00000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0360223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1714  RND superfamily transporter  22.22 
 
 		 789 aa  71.2  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0904131 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2139  hypothetical protein  21.93 
 
 		 770 aa  71.2  0.00000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.124395 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2196  hypothetical protein  20.18 
 
 		 771 aa  70.9  0.00000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.233357  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0456  HAE1 family efflux transporter  23.55 
 
 		 752 aa  70.9  0.00000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.857513  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2441  hypothetical protein  19.95 
 
 		 771 aa  70.1  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3164  hypothetical protein  19.09 
 
 		 784 aa  70.9  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.330305  normal  0.727475 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0943  RND efflux transporter  18.61 
 
 		 791 aa  70.5  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1169  hypothetical protein  35.16 
 
 		 403 aa  65.9  0.000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3357  putative integral membrane protein  21.74 
 
 		 872 aa  65.9  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.42147  normal  0.0868518 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3091  exporter of the RND superfamily protein-like protein  26.09 
 
 		 776 aa  65.1  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.114197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0766  hypothetical protein  21.5 
 
 		 689 aa  64.7  0.000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.71633  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>