210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1281 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0321  putative integral membrane protein  42.28 
 
 		 813 aa  644    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.322021  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1281  resistance-nodulation-cell division family transporter  100 
 
 		 828 aa  1649    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.338562  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0588  hypothetical protein  43.05 
 
 		 815 aa  654    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1742  hypothetical protein  45.28 
 
 		 824 aa  713    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00144404  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0367  putative integral membrane protein  46.15 
 
 		 821 aa  695    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.1024  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2375  transport protein, putative  42.13 
 
 		 825 aa  661    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2200  hypothetical protein  43.05 
 
 		 816 aa  655    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2278  transport protein, putative  43.57 
 
 		 835 aa  721    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1279  hypothetical protein  41.1 
 
 		 821 aa  610  1e-173  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3357  putative integral membrane protein  37.83 
 
 		 872 aa  569  1e-161  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.42147  normal  0.0868518 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1519  putative integral membrane protein  37.71 
 
 		 859 aa  560  1e-158  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.430265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0277  hypothetical protein  39.98 
 
 		 823 aa  546  1e-154  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1376  hypothetical protein  39.73 
 
 		 823 aa  543  1e-153  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1565  hypothetical protein  39.48 
 
 		 823 aa  540  9.999999999999999e-153  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4151  hypothetical protein  35.39 
 
 		 807 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.735313  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0562  hypothetical protein  30.16 
 
 		 800 aa  362  1e-98  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.593707  normal  0.20774 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2229  Patched family protein  22.63 
 
 		 755 aa  188  3e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.271746  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1317  RND efflux transporter  23.64 
 
 		 778 aa  182  2e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00469095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1774  Patched family protein  21.69 
 
 		 815 aa  171  7e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3675  membrane protein  23.22 
 
 		 808 aa  169  2.9999999999999998e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0460  putative exporter of the RND superfamily protein  23.72 
 
 		 806 aa  157  6e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08450  efflux transporter, putative, hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  20.91 
 
 		 764 aa  154  4e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0581  RND efflux transporter  25.95 
 
 		 788 aa  152  2e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.843516  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0048  integral membrane protein  22.52 
 
 		 788 aa  150  1.0000000000000001e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0392  exporter of the RND superfamily protein-like protein  22.16 
 
 		 837 aa  149  2.0000000000000003e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1180  hypothetical protein  22.51 
 
 		 801 aa  145  4e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1161  Patched family protein  23.38 
 
 		 831 aa  143  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0413  conserved hypothetical protein, membrane  20.81 
 
 		 773 aa  140  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0655355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003709  predicted exporter of the RND superfamily  21.3 
 
 		 792 aa  137  7.000000000000001e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1652  hypothetical protein  22.4 
 
 		 779 aa  136  1.9999999999999998e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0699635  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1805  Patched family protein  24.81 
 
 		 804 aa  135  3.9999999999999996e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.732433  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1526  RND efflux transporter  22.56 
 
 		 756 aa  134  6.999999999999999e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3183  exporter of the RND superfamily protein-like protein  22.94 
 
 		 717 aa  125  4e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0469  hypothetical protein  20.95 
 
 		 905 aa  123  9.999999999999999e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0540  hypothetical protein  20.05 
 
 		 764 aa  121  3.9999999999999996e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2006  hypothetical protein  21.73 
 
 		 789 aa  120  9e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000691446  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1021  exporter of the RND superfamily protein-like protein  22.76 
 
 		 762 aa  118  5e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.119734  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1321  RND efflux transporter  20.54 
 
 		 800 aa  117  7.999999999999999e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0610  exporter of the RND superfamily protein-like protein  20.69 
 
 		 807 aa  116  2.0000000000000002e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3300  exporter of the RND superfamily protein-like protein  21.69 
 
 		 967 aa  115  3e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.107727  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2061  putative membrane transporter  21.08 
 
 		 796 aa  115  3e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2986  RND efflux transporter  21.49 
 
 		 1051 aa  115  5e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.594238  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0958  hypothetical protein  20.66 
 
 		 779 aa  113  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.764454  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04040  hypothetical protein  23.71 
 
 		 803 aa  112  3e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0632  RND efflux transporter  24.07 
 
 		 763 aa  111  4.0000000000000004e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.510967  normal  0.17381 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0154  RND efflux transporter  22.74 
 
 		 751 aa  107  6e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4267  putative RND superfamily transporter  21.13 
 
 		 789 aa  105  5e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0258  hypothetical protein  25.67 
 
 		 767 aa  103  9e-21  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.467137  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1525  hypothetical protein  21.61 
 
 		 694 aa  103  1e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2963  putative membrane transporter  21.33 
 
 		 785 aa  103  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.581109 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1720  RND superfamily transporter  20.55 
 
 		 788 aa  103  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.362573  normal  0.170717 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0806  hypothetical protein  21.48 
 
 		 1083 aa  102  3e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.712772  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0677  RND efflux transporter  20.15 
 
 		 811 aa  102  4e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3579  RND superfamily transporter  20.29 
 
 		 788 aa  101  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.900215  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1714  RND superfamily transporter  21.23 
 
 		 789 aa  97.8  7e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0904131 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0209  Patched family protein  20.03 
 
 		 881 aa  96.7  1e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1486  RND efflux transporter  20.99 
 
 		 694 aa  96.7  2e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0030427  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2704  hypothetical protein  27.4 
 
 		 898 aa  90.1  1e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0768  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  20.93 
 
 		 747 aa  90.1  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.53096  normal  0.282667 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1940  RND efflux transporter  20.04 
 
 		 877 aa  89  4e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0867  HAE1 family efflux transporter  22.45 
 
 		 778 aa  85.9  0.000000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0077  putative membrane transporter  18.74 
 
 		 797 aa  85.5  0.000000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.273508 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0109  hypothetical protein  21.8 
 
 		 674 aa  85.1  0.000000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0110  RND efflux transporter  22.59 
 
 		 674 aa  82.4  0.00000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.384036  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2918  exporter of the RND superfamily protein  20.59 
 
 		 1204 aa  82  0.00000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0248285  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0528  RND superfamily transporter  20.29 
 
 		 789 aa  81.3  0.00000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.760184 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1269  RND superfamily protein  20.24 
 
 		 748 aa  80.1  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0456  HAE1 family efflux transporter  20.31 
 
 		 752 aa  80.1  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.857513  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1117  hypothetical protein  18.71 
 
 		 765 aa  79.7  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.103936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1297  hypothetical protein  23.98 
 
 		 380 aa  78.2  0.0000000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3150  RND superfamily protein  20.37 
 
 		 755 aa  75.9  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0817693  normal  0.0240782 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1961  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  21.23 
 
 		 758 aa  75.9  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2787  transporter, putative  20.51 
 
 		 869 aa  75.1  0.000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1152  RND efflux transporter  21.56 
 
 		 692 aa  75.1  0.000000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0148359  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2968  RND efflux transporter  20.03 
 
 		 869 aa  72.8  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0264  MMPL domain-containing protein  24.73 
 
 		 385 aa  73.2  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00700265 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1637  hypothetical protein  21.52 
 
 		 385 aa  73.2  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2681  hypothetical protein  23.38 
 
 		 879 aa  72.8  0.00000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.43238 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0572  hypothetical protein  24.37 
 
 		 385 aa  72  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.67085  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0766  hypothetical protein  21.99 
 
 		 689 aa  71.2  0.00000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.71633  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1422  RND efflux transporter  28.92 
 
 		 865 aa  71.2  0.00000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0501757  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4341  Patched family protein  21.43 
 
 		 895 aa  71.2  0.00000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.354864  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1056  efflux transporter, , hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  20.14 
 
 		 756 aa  70.5  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0557741  normal  0.21545 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2744  RND efflux transporter  17.88 
 
 		 860 aa  68.9  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.343287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1239  hypothetical protein  25.3 
 
 		 862 aa  68.9  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1238  hypothetical protein  22.13 
 
 		 855 aa  68.2  0.0000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.409284  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0901  HAE1 family efflux transporter  19.1 
 
 		 752 aa  66.6  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395656  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4897  hypothetical protein  29.53 
 
 		 864 aa  65.9  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3168  exporter of the RND superfamily protein-like protein  20.97 
 
 		 723 aa  66.2  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.210013  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2562  RND efflux transporter  19.86 
 
 		 697 aa  65.5  0.000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.143404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2270  putative transport protein  19.96 
 
 		 799 aa  65.5  0.000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0857118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3229  hypothetical protein  20.47 
 
 		 794 aa  65.1  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0514277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05360  predicted exporters of the RND superfamily  19.08 
 
 		 727 aa  64.7  0.000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000165826  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3091  exporter of the RND superfamily protein-like protein  26.44 
 
 		 776 aa  62.8  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.114197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0860  Patched family protein  23.11 
 
 		 1131 aa  63.2  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2558  hypothetical protein  22.07 
 
 		 890 aa  62.8  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.808467  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2275  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  19.52 
 
 		 812 aa  62.4  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0590834  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2467  RND efflux transporter  21.47 
 
 		 792 aa  62.8  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.022945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2127  hypothetical protein  20.2 
 
 		 816 aa  62.4  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00224294  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2865  Patched family protein  21.84 
 
 		 1011 aa  62  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>