More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0806 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0806  hypothetical protein  100 
 
 		 1083 aa  2200    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.712772  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0958  hypothetical protein  31.21 
 
 		 779 aa  378  1e-103  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.764454  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2986  RND efflux transporter  26.05 
 
 		 1051 aa  317  8e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.594238  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2229  Patched family protein  26 
 
 		 755 aa  252  3e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.271746  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1317  RND efflux transporter  23.99 
 
 		 778 aa  207  7e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00469095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0610  exporter of the RND superfamily protein-like protein  23.98 
 
 		 807 aa  197  1e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08450  efflux transporter, putative, hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  25.96 
 
 		 764 aa  197  1e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1774  Patched family protein  24.1 
 
 		 815 aa  184  6e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0677  RND efflux transporter  23.15 
 
 		 811 aa  181  8e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0392  exporter of the RND superfamily protein-like protein  23.16 
 
 		 837 aa  179  2e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003709  predicted exporter of the RND superfamily  22.85 
 
 		 792 aa  168  4e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2467  RND efflux transporter  22.22 
 
 		 792 aa  164  1e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.022945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1940  RND efflux transporter  28.05 
 
 		 877 aa  162  3e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1526  RND efflux transporter  23.93 
 
 		 756 aa  162  3e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2278  transport protein, putative  22.63 
 
 		 835 aa  159  2e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2744  RND efflux transporter  27.25 
 
 		 860 aa  155  2.9999999999999998e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.343287  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2787  transporter, putative  23.55 
 
 		 869 aa  155  4e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2968  RND efflux transporter  23.55 
 
 		 869 aa  154  1e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1321  RND efflux transporter  23.64 
 
 		 800 aa  153  2e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3778  putative transport protein  23.06 
 
 		 796 aa  150  1.0000000000000001e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000448082  decreased coverage  0.0000696113 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2270  putative transport protein  23.56 
 
 		 799 aa  149  3e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0857118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1422  RND efflux transporter  25.05 
 
 		 865 aa  149  3e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0501757  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2006  hypothetical protein  22.72 
 
 		 789 aa  147  8.000000000000001e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000691446  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1180  hypothetical protein  23.54 
 
 		 801 aa  147  1e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0469  hypothetical protein  23.83 
 
 		 905 aa  147  1e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1652  hypothetical protein  20.74 
 
 		 779 aa  145  4e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0699635  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2200  hypothetical protein  21.52 
 
 		 816 aa  144  6e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0540  hypothetical protein  21.38 
 
 		 764 aa  142  1.9999999999999998e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0154  RND efflux transporter  23.69 
 
 		 751 aa  142  3e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0209  Patched family protein  26.38 
 
 		 881 aa  142  3e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3675  membrane protein  22.9 
 
 		 808 aa  142  4.999999999999999e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4151  hypothetical protein  21.95 
 
 		 807 aa  141  6e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.735313  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2009  hypothetical protein  36.89 
 
 		 261 aa  140  1e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0943  RND efflux transporter  21.16 
 
 		 791 aa  137  9.999999999999999e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1279  hypothetical protein  21.68 
 
 		 821 aa  137  9.999999999999999e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3230  hypothetical protein  21.93 
 
 		 808 aa  134  6.999999999999999e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1316  hypothetical protein  30.33 
 
 		 273 aa  133  2.0000000000000002e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0910605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1350  RND efflux transporter  22.24 
 
 		 790 aa  132  3e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000832069  decreased coverage  0.00000222062 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0258  hypothetical protein  25.73 
 
 		 767 aa  132  4.0000000000000003e-29  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.467137  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1179  hypothetical protein  33.9 
 
 		 263 aa  125  3e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4691  putative transport protein  20.21 
 
 		 797 aa  125  6e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.628482  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2704  hypothetical protein  23.05 
 
 		 898 aa  120  9.999999999999999e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0588  hypothetical protein  21.21 
 
 		 815 aa  120  9.999999999999999e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0632  RND efflux transporter  22.24 
 
 		 763 aa  119  3.9999999999999997e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.510967  normal  0.17381 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3357  putative integral membrane protein  22 
 
 		 872 aa  117  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.42147  normal  0.0868518 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0396  hypothetical protein  29.2 
 
 		 279 aa  114  1.0000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000270968  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0321  putative integral membrane protein  21.75 
 
 		 813 aa  114  1.0000000000000001e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.322021  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0959  hypothetical protein  28.03 
 
 		 290 aa  110  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1281  resistance-nodulation-cell division family transporter  21.05 
 
 		 828 aa  110  2e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.338562  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0867  HAE1 family efflux transporter  21.65 
 
 		 778 aa  110  2e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0277  hypothetical protein  21.82 
 
 		 823 aa  109  3e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0413  conserved hypothetical protein, membrane  22.19 
 
 		 773 aa  109  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0655355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1155  RND efflux transporter  20.85 
 
 		 830 aa  108  5e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1376  hypothetical protein  21.55 
 
 		 823 aa  108  8e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1117  hypothetical protein  21.15 
 
 		 765 aa  107  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.103936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2918  exporter of the RND superfamily protein  24.91 
 
 		 1204 aa  107  1e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0248285  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0367  putative integral membrane protein  23.4 
 
 		 821 aa  107  1e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.1024  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2786  hypothetical protein  25.62 
 
 		 278 aa  106  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.402012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2375  transport protein, putative  23.9 
 
 		 825 aa  106  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2969  putative sigma E regulatory protein, MucB/RseB  25.62 
 
 		 278 aa  106  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003708  outer membrane lipoprotein-sorting protein  30.22 
 
 		 263 aa  105  3e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.212614  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1565  hypothetical protein  21.18 
 
 		 823 aa  104  8e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4341  Patched family protein  25 
 
 		 895 aa  104  8e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.354864  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1322  von Willebrand factor, type A  29.39 
 
 		 266 aa  103  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0048  integral membrane protein  21.44 
 
 		 788 aa  103  2e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1653  hypothetical protein  28.95 
 
 		 266 aa  103  3e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.561802  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0460  putative exporter of the RND superfamily protein  19.01 
 
 		 806 aa  102  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08460  hypothetical protein  30.04 
 
 		 262 aa  102  5e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0562  hypothetical protein  23.58 
 
 		 800 aa  101  8e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.593707  normal  0.20774 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1659  hypothetical protein  29.67 
 
 		 270 aa  101  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1742  hypothetical protein  21.89 
 
 		 824 aa  99.4  3e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00144404  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0581  RND efflux transporter  21.67 
 
 		 788 aa  98.6  6e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.843516  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2225  hypothetical protein  27.75 
 
 		 264 aa  97.1  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2002  hypothetical protein  27.78 
 
 		 277 aa  97.1  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.465014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2743  putative outer membrane protein  27.62 
 
 		 284 aa  95.5  5e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1056  efflux transporter, , hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  20.89 
 
 		 756 aa  95.1  6e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0557741  normal  0.21545 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0768  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  23.76 
 
 		 747 aa  94.7  7e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.53096  normal  0.282667 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1161  Patched family protein  19.5 
 
 		 831 aa  93.2  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0885  RND efflux transporter  22.06 
 
 		 805 aa  92.8  3e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0397  RND efflux transporter  21.92 
 
 		 805 aa  92.8  3e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0210  hypothetical protein  26.35 
 
 		 268 aa  92.4  4e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.892318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0456  HAE1 family efflux transporter  21.56 
 
 		 752 aa  91.7  8e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.857513  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1873  phospholipid/glycerol acyltransferase  23.42 
 
 		 1291 aa  91.7  8e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0582  RND efflux transporter  21.85 
 
 		 805 aa  89.7  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000135299 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1152  RND efflux transporter  23.62 
 
 		 692 aa  90.5  2e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0148359  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1941  hypothetical protein  24.15 
 
 		 277 aa  90.1  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.143192  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0595  RND efflux transporter  21.9 
 
 		 806 aa  90.1  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.115384  hitchhiker  0.0000495016 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1423  putative outer membrane protein  25.1 
 
 		 281 aa  87  0.000000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0426224  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1269  RND superfamily protein  21.79 
 
 		 748 aa  85.9  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0676  hypothetical protein  26.16 
 
 		 271 aa  85.5  0.000000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.860563 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1018  MMPL domain-containing protein  21.93 
 
 		 861 aa  84.7  0.000000000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00165976  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2703  hypothetical protein  27.95 
 
 		 261 aa  84.7  0.000000000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1534  RND superfamily exporter  21.13 
 
 		 787 aa  84  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0360223  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0454  hypothetical protein  26.94 
 
 		 268 aa  84  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3164  hypothetical protein  20.43 
 
 		 784 aa  83.2  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.330305  normal  0.727475 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05360  predicted exporters of the RND superfamily  21.74 
 
 		 727 aa  82  0.00000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000165826  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1515  hypothetical protein  44.19 
 
 		 268 aa  82  0.00000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.74653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0020  Patched family protein  22.24 
 
 		 1359 aa  82.4  0.00000000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.637086  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1525  hypothetical protein  22.7 
 
 		 694 aa  80.9  0.0000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1668  Patched family protein  23.53 
 
 		 842 aa  80.9  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>