43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1515 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1515  hypothetical protein  100 
 
 		 268 aa  556  1e-157  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.74653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1659  hypothetical protein  77.2 
 
 		 270 aa  414  9.999999999999999e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0435  hypothetical protein  72.69 
 
 		 268 aa  392  1e-108  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0454  hypothetical protein  72.51 
 
 		 268 aa  390  1e-107  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2009  hypothetical protein  30.34 
 
 		 261 aa  133  3e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1179  hypothetical protein  29.7 
 
 		 263 aa  124  2e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0396  hypothetical protein  29.21 
 
 		 279 aa  122  5e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000270968  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0634  hypothetical protein  31.6 
 
 		 268 aa  121  9.999999999999999e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.71934  normal  0.575914 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0152  hypothetical protein  31.76 
 
 		 269 aa  121  9.999999999999999e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1316  hypothetical protein  29.44 
 
 		 273 aa  112  8.000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0910605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1528  hypothetical protein  27.38 
 
 		 273 aa  105  1e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.676069  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003708  outer membrane lipoprotein-sorting protein  34.88 
 
 		 263 aa  101  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.212614  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2225  hypothetical protein  31.75 
 
 		 264 aa  98.2  1e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1322  von Willebrand factor, type A  26.24 
 
 		 266 aa  96.7  4e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1653  hypothetical protein  31.96 
 
 		 266 aa  95.9  6e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.561802  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08460  hypothetical protein  29.09 
 
 		 262 aa  94.4  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2703  hypothetical protein  27.45 
 
 		 261 aa  94  2e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2969  putative sigma E regulatory protein, MucB/RseB  29.31 
 
 		 278 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2786  hypothetical protein  29.31 
 
 		 278 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.402012  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0806  hypothetical protein  44.19 
 
 		 1083 aa  82  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.712772  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0959  hypothetical protein  27.93 
 
 		 290 aa  78.6  0.00000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0468  hypothetical protein  30.27 
 
 		 257 aa  77.8  0.0000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1423  putative outer membrane protein  26.95 
 
 		 281 aa  77.4  0.0000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0426224  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0210  hypothetical protein  25.88 
 
 		 268 aa  75.5  0.0000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.892318  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1941  hypothetical protein  26.44 
 
 		 277 aa  75.5  0.0000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.143192  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0676  hypothetical protein  29.89 
 
 		 271 aa  72.4  0.000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.860563 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2002  hypothetical protein  26.06 
 
 		 277 aa  71.6  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.465014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2743  putative outer membrane protein  26.45 
 
 		 284 aa  70.5  0.00000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2533  hypothetical protein  25.1 
 
 		 264 aa  70.1  0.00000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.154061  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23220  putative sigma E regulatory protein, MucB/RseB  22.93 
 
 		 248 aa  68.9  0.00000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000142114  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0539  hypothetical protein  27.37 
 
 		 269 aa  65.1  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1661  hypothetical protein  22.64 
 
 		 257 aa  63.5  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.612075  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5301  hypothetical protein  22.64 
 
 		 257 aa  63.5  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.457246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2986  RND efflux transporter  28.1 
 
 		 1051 aa  62.8  0.000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.594238  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1428  hypothetical protein  24.9 
 
 		 267 aa  56.2  0.0000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.906524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2661  hypothetical protein  24.11 
 
 		 270 aa  54.3  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1019  hypothetical protein  23.02 
 
 		 254 aa  52.4  0.000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.353251  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0436  hypothetical protein  24.68 
 
 		 260 aa  50.8  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0378114  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001463  outer membrane lipoprotein-sorting protein  23.91 
 
 		 248 aa  49.3  0.00007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05400  hypothetical protein  23.45 
 
 		 240 aa  47.8  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2902  hypothetical protein  25.79 
 
 		 243 aa  45.8  0.0006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0902383 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1294  hypothetical protein  26.74 
 
 		 262 aa  46.2  0.0006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.522431 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2496  hypothetical protein  22.18 
 
 		 262 aa  43.5  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>