44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_2786 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_2969  putative sigma E regulatory protein, MucB/RseB  100 
 
 		 278 aa  569  1e-161  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2786  hypothetical protein  100 
 
 		 278 aa  569  1e-161  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.402012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1316  hypothetical protein  33.2 
 
 		 273 aa  133  3e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0910605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0396  hypothetical protein  30.19 
 
 		 279 aa  117  3e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000270968  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2009  hypothetical protein  25.63 
 
 		 261 aa  114  1.0000000000000001e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003708  outer membrane lipoprotein-sorting protein  30.15 
 
 		 263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.212614  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0806  hypothetical protein  25.49 
 
 		 1083 aa  108  8.000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.712772  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1653  hypothetical protein  28.52 
 
 		 266 aa  105  9e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.561802  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1941  hypothetical protein  26.47 
 
 		 277 aa  103  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.143192  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2225  hypothetical protein  27.06 
 
 		 264 aa  103  3e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0210  hypothetical protein  25.64 
 
 		 268 aa  102  6e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.892318  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1322  von Willebrand factor, type A  28.14 
 
 		 266 aa  102  8e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1179  hypothetical protein  27.2 
 
 		 263 aa  100  4e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08460  hypothetical protein  29.41 
 
 		 262 aa  99.8  4e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2986  RND efflux transporter  28.84 
 
 		 1051 aa  99  7e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.594238  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1515  hypothetical protein  28.86 
 
 		 268 aa  95.1  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.74653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2743  putative outer membrane protein  24.29 
 
 		 284 aa  92.8  5e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2703  hypothetical protein  25.84 
 
 		 261 aa  91.7  1e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1423  putative outer membrane protein  26.55 
 
 		 281 aa  89.7  4e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0426224  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2002  hypothetical protein  22.99 
 
 		 277 aa  89.4  7e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.465014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0152  hypothetical protein  24.61 
 
 		 269 aa  89  8e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0454  hypothetical protein  24.44 
 
 		 268 aa  87.4  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0539  hypothetical protein  30.91 
 
 		 269 aa  87  3e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1659  hypothetical protein  25.85 
 
 		 270 aa  86.7  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0435  hypothetical protein  25 
 
 		 268 aa  85.9  6e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1528  hypothetical protein  24.05 
 
 		 273 aa  71.2  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.676069  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0634  hypothetical protein  25.1 
 
 		 268 aa  70.9  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.71934  normal  0.575914 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0676  hypothetical protein  25.43 
 
 		 271 aa  70.1  0.00000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.860563 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0959  hypothetical protein  25 
 
 		 290 aa  68.2  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23220  putative sigma E regulatory protein, MucB/RseB  27.65 
 
 		 248 aa  65.1  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000142114  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2661  hypothetical protein  25.15 
 
 		 270 aa  60.5  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1019  hypothetical protein  20.91 
 
 		 254 aa  58.5  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.353251  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2533  hypothetical protein  21.52 
 
 		 264 aa  58.2  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.154061  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29490  hypothetical protein  33.03 
 
 		 330 aa  54.3  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1428  hypothetical protein  24.84 
 
 		 267 aa  53.5  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.906524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1661  hypothetical protein  23.02 
 
 		 257 aa  50.1  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.612075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0128  hypothetical protein  21.53 
 
 		 334 aa  49.7  0.00005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.112171  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5301  hypothetical protein  23.02 
 
 		 257 aa  50.1  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.457246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1251  hypothetical protein  19.48 
 
 		 263 aa  48.1  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.309853  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0468  hypothetical protein  21.96 
 
 		 257 aa  48.5  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3198  hypothetical protein  20.61 
 
 		 255 aa  47.4  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2902  hypothetical protein  20.91 
 
 		 243 aa  43.5  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0902383 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2390  hypothetical protein  22.78 
 
 		 265 aa  43.1  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.564137  normal  0.698775 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3286  hypothetical protein  25.71 
 
 		 267 aa  43.1  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>