45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1423 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_1423  putative outer membrane protein  100 
 
 		 281 aa  568  1e-161  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0426224  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2743  putative outer membrane protein  79.15 
 
 		 284 aa  376  1e-103  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0210  hypothetical protein  51.55 
 
 		 268 aa  256  3e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.892318  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1941  hypothetical protein  41.76 
 
 		 277 aa  207  2e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.143192  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0152  hypothetical protein  29.7 
 
 		 269 aa  109  4.0000000000000004e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1179  hypothetical protein  31.22 
 
 		 263 aa  104  1e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2225  hypothetical protein  29.41 
 
 		 264 aa  98.2  1e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2009  hypothetical protein  26.29 
 
 		 261 aa  97.8  2e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0454  hypothetical protein  30.17 
 
 		 268 aa  92  9e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003708  outer membrane lipoprotein-sorting protein  29.28 
 
 		 263 aa  91.7  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.212614  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0806  hypothetical protein  24.01 
 
 		 1083 aa  90.9  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.712772  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2703  hypothetical protein  25.7 
 
 		 261 aa  89.7  4e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2786  hypothetical protein  26.55 
 
 		 278 aa  89.4  6e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.402012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2969  putative sigma E regulatory protein, MucB/RseB  26.55 
 
 		 278 aa  89.4  6e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0435  hypothetical protein  29.39 
 
 		 268 aa  87.4  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1528  hypothetical protein  28.51 
 
 		 273 aa  88.2  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.676069  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2986  RND efflux transporter  23.83 
 
 		 1051 aa  87.4  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.594238  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08460  hypothetical protein  28.24 
 
 		 262 aa  87  3e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1659  hypothetical protein  30.2 
 
 		 270 aa  87  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1019  hypothetical protein  24.32 
 
 		 254 aa  84  0.000000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.353251  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1316  hypothetical protein  24.89 
 
 		 273 aa  83.2  0.000000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0910605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1322  von Willebrand factor, type A  23.74 
 
 		 266 aa  77.8  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1515  hypothetical protein  26.95 
 
 		 268 aa  77  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.74653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0634  hypothetical protein  28.44 
 
 		 268 aa  76.3  0.0000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.71934  normal  0.575914 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0959  hypothetical protein  26.5 
 
 		 290 aa  75.9  0.0000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0396  hypothetical protein  26.52 
 
 		 279 aa  74.3  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000270968  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2002  hypothetical protein  23.39 
 
 		 277 aa  70.9  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.465014  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1653  hypothetical protein  24.11 
 
 		 266 aa  70.9  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.561802  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0676  hypothetical protein  28.38 
 
 		 271 aa  67  0.0000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.860563 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2372  hypothetical protein  23.44 
 
 		 250 aa  62  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000349314  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0468  hypothetical protein  26.11 
 
 		 257 aa  59.7  0.00000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2902  hypothetical protein  25.65 
 
 		 243 aa  58.5  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0902383 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0436  hypothetical protein  22.99 
 
 		 260 aa  57.4  0.0000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0378114  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2533  hypothetical protein  27.39 
 
 		 264 aa  56.6  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.154061  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1428  hypothetical protein  23.94 
 
 		 267 aa  55.8  0.0000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.906524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0539  hypothetical protein  28.71 
 
 		 269 aa  55.5  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5043  hypothetical protein  22.07 
 
 		 247 aa  54.7  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3198  hypothetical protein  21.97 
 
 		 255 aa  53.9  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1661  hypothetical protein  26.71 
 
 		 257 aa  52.8  0.000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.612075  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5301  hypothetical protein  26.71 
 
 		 257 aa  52.8  0.000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.457246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23220  putative sigma E regulatory protein, MucB/RseB  24.5 
 
 		 248 aa  49.3  0.00006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000142114  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2390  hypothetical protein  20.08 
 
 		 265 aa  45.4  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.564137  normal  0.698775 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001463  outer membrane lipoprotein-sorting protein  23.25 
 
 		 248 aa  45.1  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05400  hypothetical protein  23.53 
 
 		 240 aa  42.4  0.008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0366  hypothetical protein  21.35 
 
 		 253 aa  42  0.01  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>