34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2372 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2372  hypothetical protein  100 
 
 		 250 aa  511  1e-144  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000349314  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0436  hypothetical protein  48.73 
 
 		 260 aa  246  3e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0378114  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2496  hypothetical protein  48.07 
 
 		 262 aa  202  5e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5043  hypothetical protein  39.64 
 
 		 247 aa  194  1e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5301  hypothetical protein  38.71 
 
 		 257 aa  177  2e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.457246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1661  hypothetical protein  38.71 
 
 		 257 aa  177  2e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.612075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2533  hypothetical protein  41.23 
 
 		 264 aa  169  5e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.154061  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3198  hypothetical protein  33.74 
 
 		 255 aa  158  9e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1428  hypothetical protein  33.59 
 
 		 267 aa  157  1e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.906524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2661  hypothetical protein  34.93 
 
 		 270 aa  156  3e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001463  outer membrane lipoprotein-sorting protein  37.88 
 
 		 248 aa  149  4e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05400  hypothetical protein  37.88 
 
 		 240 aa  149  4e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1251  hypothetical protein  28.24 
 
 		 263 aa  121  9.999999999999999e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.309853  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2902  hypothetical protein  26.87 
 
 		 243 aa  105  9e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0902383 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0210  hypothetical protein  24.24 
 
 		 268 aa  67.4  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.892318  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2743  putative outer membrane protein  25.13 
 
 		 284 aa  66.2  0.0000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0366  hypothetical protein  23.27 
 
 		 253 aa  65.9  0.0000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2390  hypothetical protein  23.2 
 
 		 265 aa  64.7  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.564137  normal  0.698775 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1423  putative outer membrane protein  25.57 
 
 		 281 aa  59.7  0.00000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0426224  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3286  hypothetical protein  23.81 
 
 		 267 aa  58.5  0.00000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1294  hypothetical protein  25 
 
 		 262 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.522431 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08460  hypothetical protein  22.7 
 
 		 262 aa  54.7  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23220  putative sigma E regulatory protein, MucB/RseB  22.03 
 
 		 248 aa  50.8  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000142114  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1800  hypothetical protein  20.49 
 
 		 241 aa  47.8  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.73611  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0396  hypothetical protein  23.95 
 
 		 279 aa  47  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000270968  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1179  hypothetical protein  25.64 
 
 		 263 aa  45.4  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0435  hypothetical protein  24.51 
 
 		 268 aa  44.7  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0454  hypothetical protein  24.33 
 
 		 268 aa  43.9  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2986  RND efflux transporter  21.69 
 
 		 1051 aa  43.9  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.594238  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0152  hypothetical protein  26.27 
 
 		 269 aa  43.5  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0634  hypothetical protein  28.21 
 
 		 268 aa  43.1  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.71934  normal  0.575914 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1659  hypothetical protein  25 
 
 		 270 aa  42.4  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1322  von Willebrand factor, type A  23.74 
 
 		 266 aa  42  0.008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2009  hypothetical protein  19.77 
 
 		 261 aa  42  0.009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>