47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0454 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_0454  hypothetical protein  100 
 
 		 268 aa  554  1e-157  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0435  hypothetical protein  97.19 
 
 		 268 aa  507  1e-143  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1659  hypothetical protein  78.31 
 
 		 270 aa  413  1e-114  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1515  hypothetical protein  69.03 
 
 		 268 aa  392  1e-108  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.74653  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2009  hypothetical protein  31.47 
 
 		 261 aa  131  9e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0152  hypothetical protein  30.56 
 
 		 269 aa  129  4.0000000000000003e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0634  hypothetical protein  31.4 
 
 		 268 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.71934  normal  0.575914 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0396  hypothetical protein  30.74 
 
 		 279 aa  124  2e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000270968  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1179  hypothetical protein  31.68 
 
 		 263 aa  122  9e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2225  hypothetical protein  33.86 
 
 		 264 aa  112  6e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1528  hypothetical protein  30.85 
 
 		 273 aa  102  5e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.676069  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1316  hypothetical protein  27.39 
 
 		 273 aa  102  5e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0910605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003708  outer membrane lipoprotein-sorting protein  35.8 
 
 		 263 aa  97.8  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.212614  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1423  putative outer membrane protein  30.17 
 
 		 281 aa  92  8e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0426224  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2743  putative outer membrane protein  31.75 
 
 		 284 aa  91.7  1e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08460  hypothetical protein  30.14 
 
 		 262 aa  89.7  4e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1653  hypothetical protein  29.61 
 
 		 266 aa  89.7  5e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.561802  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2703  hypothetical protein  27.17 
 
 		 261 aa  89.7  5e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1322  von Willebrand factor, type A  27.75 
 
 		 266 aa  87.8  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0806  hypothetical protein  26.94 
 
 		 1083 aa  85.1  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.712772  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2786  hypothetical protein  24.48 
 
 		 278 aa  82.4  0.000000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.402012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2969  putative sigma E regulatory protein, MucB/RseB  24.48 
 
 		 278 aa  82.4  0.000000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0468  hypothetical protein  24.9 
 
 		 257 aa  76.3  0.0000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0210  hypothetical protein  25.37 
 
 		 268 aa  73.2  0.000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.892318  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2986  RND efflux transporter  24.19 
 
 		 1051 aa  72.4  0.000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.594238  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2002  hypothetical protein  25.36 
 
 		 277 aa  72.4  0.000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.465014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2533  hypothetical protein  25.63 
 
 		 264 aa  71.2  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.154061  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0676  hypothetical protein  28.57 
 
 		 271 aa  70.1  0.00000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.860563 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5301  hypothetical protein  25.45 
 
 		 257 aa  66.2  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.457246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1661  hypothetical protein  25.45 
 
 		 257 aa  66.2  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.612075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0959  hypothetical protein  25.52 
 
 		 290 aa  63.9  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1019  hypothetical protein  25 
 
 		 254 aa  63.2  0.000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.353251  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23220  putative sigma E regulatory protein, MucB/RseB  26.84 
 
 		 248 aa  62.4  0.000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000142114  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0539  hypothetical protein  29.17 
 
 		 269 aa  61.2  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1941  hypothetical protein  25.36 
 
 		 277 aa  58.2  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.143192  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2661  hypothetical protein  23.44 
 
 		 270 aa  53.5  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05400  hypothetical protein  25 
 
 		 240 aa  52.8  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1428  hypothetical protein  25 
 
 		 267 aa  52.8  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.906524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1294  hypothetical protein  26.4 
 
 		 262 aa  52.8  0.000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.522431 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5043  hypothetical protein  25.4 
 
 		 247 aa  51.6  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001463  outer membrane lipoprotein-sorting protein  27.54 
 
 		 248 aa  50.8  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3198  hypothetical protein  27.13 
 
 		 255 aa  47  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0436  hypothetical protein  20.91 
 
 		 260 aa  45.8  0.0007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0378114  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2902  hypothetical protein  24.08 
 
 		 243 aa  45.4  0.0009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0902383 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2372  hypothetical protein  24.06 
 
 		 250 aa  43.5  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000349314  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3041  hypothetical protein  22.79 
 
 		 317 aa  43.9  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.123051 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1251  hypothetical protein  23.62 
 
 		 263 aa  42.4  0.009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.309853  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>