59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001463 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_001463  outer membrane lipoprotein-sorting protein  100 
 
 		 248 aa  511  1e-144  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05400  hypothetical protein  83.26 
 
 		 240 aa  396  1e-109  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3198  hypothetical protein  75.62 
 
 		 255 aa  389  1e-107  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1428  hypothetical protein  75.44 
 
 		 267 aa  367  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.906524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2661  hypothetical protein  74.57 
 
 		 270 aa  366  1e-100  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1251  hypothetical protein  59.21 
 
 		 263 aa  293  2e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.309853  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5301  hypothetical protein  41.95 
 
 		 257 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.457246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1661  hypothetical protein  41.95 
 
 		 257 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.612075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2533  hypothetical protein  38.14 
 
 		 264 aa  176  2e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.154061  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5043  hypothetical protein  36.28 
 
 		 247 aa  169  6e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0436  hypothetical protein  37.17 
 
 		 260 aa  168  6e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0378114  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2372  hypothetical protein  37.27 
 
 		 250 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000349314  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2496  hypothetical protein  38.84 
 
 		 262 aa  161  9e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08460  hypothetical protein  27.47 
 
 		 262 aa  96.3  4e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1179  hypothetical protein  29.02 
 
 		 263 aa  94  2e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2902  hypothetical protein  24.53 
 
 		 243 aa  91.3  1e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0902383 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23220  putative sigma E regulatory protein, MucB/RseB  26.07 
 
 		 248 aa  89.4  4e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000142114  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2390  hypothetical protein  27.31 
 
 		 265 aa  88.2  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.564137  normal  0.698775 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0366  hypothetical protein  25.91 
 
 		 253 aa  86.7  3e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3286  hypothetical protein  26.44 
 
 		 267 aa  84.7  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2009  hypothetical protein  30.41 
 
 		 261 aa  82.8  0.000000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2703  hypothetical protein  25.91 
 
 		 261 aa  68.2  0.0000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003708  outer membrane lipoprotein-sorting protein  26.2 
 
 		 263 aa  66.6  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.212614  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1800  hypothetical protein  23.67 
 
 		 241 aa  66.2  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.73611  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1316  hypothetical protein  21.37 
 
 		 273 aa  64.7  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0910605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1322  von Willebrand factor, type A  25.67 
 
 		 266 aa  63.2  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0468  hypothetical protein  23.72 
 
 		 257 aa  62.4  0.000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2225  hypothetical protein  21.46 
 
 		 264 aa  60.8  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0210  hypothetical protein  23.11 
 
 		 268 aa  58.2  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.892318  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0539  hypothetical protein  26.62 
 
 		 269 aa  57.8  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0396  hypothetical protein  23.33 
 
 		 279 aa  57.8  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000270968  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2986  RND efflux transporter  24.28 
 
 		 1051 aa  57  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.594238  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1653  hypothetical protein  25.27 
 
 		 266 aa  54.7  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.561802  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2002  hypothetical protein  24.34 
 
 		 277 aa  52.4  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.465014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2743  putative outer membrane protein  21.34 
 
 		 284 aa  52.4  0.000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0435  hypothetical protein  25.93 
 
 		 268 aa  50.8  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0806  hypothetical protein  23.83 
 
 		 1083 aa  50.8  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.712772  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1659  hypothetical protein  24.77 
 
 		 270 aa  51.2  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0454  hypothetical protein  25.12 
 
 		 268 aa  50.4  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1515  hypothetical protein  23.63 
 
 		 268 aa  49.7  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.74653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2021  hypothetical protein  25.27 
 
 		 238 aa  49.3  0.00005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000720382  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0676  hypothetical protein  24.68 
 
 		 271 aa  48.9  0.00008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.860563 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1528  hypothetical protein  21.79 
 
 		 273 aa  48.5  0.00009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.676069  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1423  putative outer membrane protein  22.46 
 
 		 281 aa  48.1  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0426224  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0152  hypothetical protein  21.03 
 
 		 269 aa  47.4  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2786  hypothetical protein  22.5 
 
 		 278 aa  47  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.402012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2969  putative sigma E regulatory protein, MucB/RseB  22.5 
 
 		 278 aa  47  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1941  hypothetical protein  19.3 
 
 		 277 aa  47  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.143192  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3382  hypothetical protein  23.93 
 
 		 369 aa  45.4  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000236638  normal  0.0236952 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2084  hypothetical protein  26.52 
 
 		 260 aa  44.7  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.142481  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1471  hypothetical protein  26.52 
 
 		 260 aa  44.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2375  hypothetical protein  26.52 
 
 		 260 aa  44.7  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3142  hypothetical protein  26.52 
 
 		 260 aa  44.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.818868  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3256  hypothetical protein  26.52 
 
 		 260 aa  44.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.981217  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1390  hypothetical protein  26.52 
 
 		 260 aa  44.7  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.675237  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2544  hypothetical protein  23.67 
 
 		 275 aa  44.7  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.770236  normal  0.684927 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1111  hypothetical protein  26.52 
 
 		 257 aa  44.7  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2343  hypothetical protein  25.76 
 
 		 260 aa  45.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29490  hypothetical protein  24.14 
 
 		 330 aa  43.1  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>