44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2544 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_2544  hypothetical protein  100 
 
 		 275 aa  563  1.0000000000000001e-159  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.770236  normal  0.684927 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1294  hypothetical protein  43.64 
 
 		 262 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.522431 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2343  hypothetical protein  36.82 
 
 		 260 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3142  hypothetical protein  36.82 
 
 		 260 aa  161  9e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.818868  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2084  hypothetical protein  36.4 
 
 		 260 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.142481  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1471  hypothetical protein  36.4 
 
 		 260 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2375  hypothetical protein  36.4 
 
 		 260 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1111  hypothetical protein  36.4 
 
 		 257 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3256  hypothetical protein  36.4 
 
 		 260 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.981217  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1390  hypothetical protein  36.4 
 
 		 260 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.675237  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6688  hypothetical protein  33.19 
 
 		 261 aa  156  4e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.607984  normal  0.733294 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1948  hypothetical protein  33.6 
 
 		 259 aa  154  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.081935  normal  0.0130453 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2390  hypothetical protein  32.93 
 
 		 265 aa  135  9e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.564137  normal  0.698775 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3286  hypothetical protein  31.9 
 
 		 267 aa  129  7.000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0366  hypothetical protein  30 
 
 		 253 aa  120  3e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29490  hypothetical protein  31.52 
 
 		 330 aa  87.8  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1097  hypothetical protein  27.54 
 
 		 267 aa  81.6  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000255633  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2439  hypothetical protein  26.79 
 
 		 244 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3041  hypothetical protein  26.67 
 
 		 317 aa  68.9  0.00000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.123051 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1800  hypothetical protein  28.75 
 
 		 241 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.73611  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2021  hypothetical protein  26.55 
 
 		 238 aa  66.6  0.0000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000720382  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0384  hypothetical protein  24.14 
 
 		 241 aa  63.9  0.000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07027  hypothetical protein  26.39 
 
 		 261 aa  58.2  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000977  hypothetical protein  24.41 
 
 		 261 aa  57  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2661  hypothetical protein  22.73 
 
 		 270 aa  55.5  0.0000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1428  hypothetical protein  23.76 
 
 		 267 aa  55.5  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.906524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6147  hypothetical protein  25.23 
 
 		 253 aa  52.4  0.000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.832582  normal  0.467029 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5640  hypothetical protein  27.94 
 
 		 250 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6496  hypothetical protein  25.77 
 
 		 250 aa  52  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6005  hypothetical protein  27.94 
 
 		 250 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3198  hypothetical protein  23.66 
 
 		 255 aa  51.2  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1653  hypothetical protein  26.42 
 
 		 266 aa  49.7  0.00006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.561802  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003708  outer membrane lipoprotein-sorting protein  26.96 
 
 		 263 aa  48.9  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.212614  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0498  hypothetical protein  24.24 
 
 		 258 aa  47  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.432294 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2533  hypothetical protein  22.98 
 
 		 264 aa  45.8  0.0007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.154061  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2009  hypothetical protein  24.79 
 
 		 261 aa  45.8  0.0007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2902  hypothetical protein  22.89 
 
 		 243 aa  45.1  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0902383 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1661  hypothetical protein  21.47 
 
 		 257 aa  44.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.612075  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5301  hypothetical protein  21.47 
 
 		 257 aa  44.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.457246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2002  hypothetical protein  22.16 
 
 		 277 aa  43.5  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.465014  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1849  hypothetical protein  24.16 
 
 		 255 aa  43.9  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7414  hypothetical protein  23.16 
 
 		 246 aa  43.5  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0281509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2986  RND efflux transporter  25.76 
 
 		 1051 aa  42.7  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.594238  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2529  hypothetical protein  21.69 
 
 		 245 aa  42.4  0.008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0517946  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>