42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A1471 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006349  BMAA2084  hypothetical protein  100 
 
 
260 aa  537  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.142481  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1471  hypothetical protein  100 
 
 
260 aa  537  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2375  hypothetical protein  100 
 
 
260 aa  537  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3256  hypothetical protein  100 
 
 
260 aa  537  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.981217  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1390  hypothetical protein  100 
 
 
260 aa  537  9.999999999999999e-153  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.675237  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3142  hypothetical protein  99.23 
 
 
260 aa  533  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.818868  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1111  hypothetical protein  99.61 
 
 
257 aa  530  1e-149  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2343  hypothetical protein  95.77 
 
 
260 aa  497  1e-139  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1948  hypothetical protein  80.77 
 
 
259 aa  431  1e-120  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.081935  normal  0.0130453 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6688  hypothetical protein  66.67 
 
 
261 aa  329  2e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.607984  normal  0.733294 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2544  hypothetical protein  36.4 
 
 
275 aa  161  1e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.770236  normal  0.684927 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0366  hypothetical protein  36.1 
 
 
253 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1294  hypothetical protein  32.31 
 
 
262 aa  145  5e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.522431 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3286  hypothetical protein  35.53 
 
 
267 aa  137  1e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2390  hypothetical protein  31.62 
 
 
265 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.564137  normal  0.698775 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1097  hypothetical protein  26.61 
 
 
267 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000255633  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2439  hypothetical protein  31.62 
 
 
244 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0384  hypothetical protein  26.75 
 
 
241 aa  100  3e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000977  hypothetical protein  29.6 
 
 
261 aa  99  6e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07027  hypothetical protein  28.63 
 
 
261 aa  96.7  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2529  hypothetical protein  29.96 
 
 
245 aa  88.6  9e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0517946  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29490  hypothetical protein  33.73 
 
 
330 aa  77.4  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7414  hypothetical protein  25.6 
 
 
246 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0281509  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3041  hypothetical protein  28.99 
 
 
317 aa  71.2  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.123051 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6147  hypothetical protein  27.18 
 
 
253 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.832582  normal  0.467029 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6496  hypothetical protein  24.34 
 
 
250 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6005  hypothetical protein  24.34 
 
 
250 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5640  hypothetical protein  24.34 
 
 
250 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1800  hypothetical protein  23.85 
 
 
241 aa  55.1  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.73611  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2533  hypothetical protein  24.56 
 
 
264 aa  50.8  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.154061  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05400  hypothetical protein  28.68 
 
 
240 aa  50.1  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08460  hypothetical protein  26.43 
 
 
262 aa  48.5  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2661  hypothetical protein  25.78 
 
 
270 aa  47.8  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19650  hypothetical protein  21.11 
 
 
250 aa  46.2  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1428  hypothetical protein  25.38 
 
 
267 aa  46.2  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.906524  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23220  putative sigma E regulatory protein, MucB/RseB  25.29 
 
 
248 aa  45.8  0.0007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000142114  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1661  hypothetical protein  24.22 
 
 
257 aa  45.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.612075  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5301  hypothetical protein  24.22 
 
 
257 aa  45.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.457246  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001463  outer membrane lipoprotein-sorting protein  26.52 
 
 
248 aa  44.7  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2021  hypothetical protein  19.21 
 
 
238 aa  44.3  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000720382  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2009  hypothetical protein  24.04 
 
 
261 aa  43.5  0.004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0235  hypothetical protein  19.32 
 
 
360 aa  42.7  0.006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.129282  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>