54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2496 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2496  hypothetical protein  100 
 
 		 262 aa  539  9.999999999999999e-153  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0436  hypothetical protein  48.91 
 
 		 260 aa  245  6e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0378114  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2372  hypothetical protein  48.07 
 
 		 250 aa  218  8.999999999999998e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000349314  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5043  hypothetical protein  42.13 
 
 		 247 aa  213  2.9999999999999995e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1661  hypothetical protein  38.74 
 
 		 257 aa  195  8.000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.612075  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5301  hypothetical protein  38.74 
 
 		 257 aa  195  8.000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.457246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1428  hypothetical protein  39.53 
 
 		 267 aa  188  5.999999999999999e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.906524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3198  hypothetical protein  36.59 
 
 		 255 aa  185  7e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2661  hypothetical protein  35.96 
 
 		 270 aa  179  4e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05400  hypothetical protein  41.15 
 
 		 240 aa  173  1.9999999999999998e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2533  hypothetical protein  37.72 
 
 		 264 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.154061  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001463  outer membrane lipoprotein-sorting protein  40 
 
 		 248 aa  163  3e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1251  hypothetical protein  32.02 
 
 		 263 aa  154  2e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.309853  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2902  hypothetical protein  29.55 
 
 		 243 aa  115  1.0000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0902383 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08460  hypothetical protein  23.77 
 
 		 262 aa  89.4  6e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003708  outer membrane lipoprotein-sorting protein  29.69 
 
 		 263 aa  71.2  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.212614  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0366  hypothetical protein  27.63 
 
 		 253 aa  71.6  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23220  putative sigma E regulatory protein, MucB/RseB  21.95 
 
 		 248 aa  71.2  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000142114  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3286  hypothetical protein  27.66 
 
 		 267 aa  67.4  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2390  hypothetical protein  23.26 
 
 		 265 aa  66.2  0.0000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.564137  normal  0.698775 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2002  hypothetical protein  27.75 
 
 		 277 aa  60.5  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.465014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1322  von Willebrand factor, type A  25.89 
 
 		 266 aa  59.3  0.00000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1800  hypothetical protein  25.1 
 
 		 241 aa  58.2  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.73611  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2021  hypothetical protein  24.02 
 
 		 238 aa  57.4  0.0000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000720382  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1316  hypothetical protein  26.92 
 
 		 273 aa  57  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0910605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1941  hypothetical protein  24.82 
 
 		 277 aa  54.3  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.143192  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0539  hypothetical protein  26.88 
 
 		 269 aa  52.4  0.000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1179  hypothetical protein  22.89 
 
 		 263 aa  52  0.00001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2009  hypothetical protein  21.88 
 
 		 261 aa  52  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0396  hypothetical protein  23.99 
 
 		 279 aa  51.6  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000270968  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1653  hypothetical protein  24.5 
 
 		 266 aa  49.7  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.561802  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0210  hypothetical protein  24.12 
 
 		 268 aa  48.1  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.892318  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2343  hypothetical protein  26.11 
 
 		 260 aa  48.1  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1111  hypothetical protein  27.56 
 
 		 257 aa  47.4  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3142  hypothetical protein  28.21 
 
 		 260 aa  47.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.818868  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1390  hypothetical protein  27.56 
 
 		 260 aa  47  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.675237  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2375  hypothetical protein  27.56 
 
 		 260 aa  47  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3256  hypothetical protein  27.56 
 
 		 260 aa  47  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.981217  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2084  hypothetical protein  27.56 
 
 		 260 aa  47  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.142481  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2743  putative outer membrane protein  27.67 
 
 		 284 aa  47  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1471  hypothetical protein  27.56 
 
 		 260 aa  47  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1423  putative outer membrane protein  23.75 
 
 		 281 aa  45.1  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0426224  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0806  hypothetical protein  21 
 
 		 1083 aa  45.4  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.712772  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1294  hypothetical protein  22.29 
 
 		 262 aa  44.7  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.522431 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0235  hypothetical protein  23.08 
 
 		 360 aa  44.7  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.129282  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1515  hypothetical protein  22.34 
 
 		 268 aa  44.3  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.74653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1659  hypothetical protein  24.29 
 
 		 270 aa  43.5  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0152  hypothetical protein  24.71 
 
 		 269 aa  43.5  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2225  hypothetical protein  22.22 
 
 		 264 aa  43.9  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1948  hypothetical protein  23.87 
 
 		 259 aa  43.5  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.081935  normal  0.0130453 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0676  hypothetical protein  22.59 
 
 		 271 aa  43.1  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.860563 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0959  hypothetical protein  27.72 
 
 		 290 aa  42.7  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0435  hypothetical protein  23.65 
 
 		 268 aa  42.4  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0468  hypothetical protein  23.81 
 
 		 257 aa  42  0.01  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>