54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2661 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_2661  hypothetical protein  100 
 
 		 270 aa  558  1e-158  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1428  hypothetical protein  67.18 
 
 		 267 aa  380  1e-104  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.906524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3198  hypothetical protein  75.32 
 
 		 255 aa  374  1e-102  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001463  outer membrane lipoprotein-sorting protein  74.57 
 
 		 248 aa  342  4e-93  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05400  hypothetical protein  70.87 
 
 		 240 aa  327  1.0000000000000001e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1251  hypothetical protein  54.08 
 
 		 263 aa  279  3e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.309853  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1661  hypothetical protein  41.07 
 
 		 257 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.612075  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5301  hypothetical protein  41.07 
 
 		 257 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.457246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2533  hypothetical protein  38.14 
 
 		 264 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.154061  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5043  hypothetical protein  35.11 
 
 		 247 aa  166  2.9999999999999998e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2496  hypothetical protein  35.96 
 
 		 262 aa  166  5e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2372  hypothetical protein  34.93 
 
 		 250 aa  156  3e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000349314  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0436  hypothetical protein  32.46 
 
 		 260 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0378114  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2390  hypothetical protein  27.8 
 
 		 265 aa  90.1  4e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.564137  normal  0.698775 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23220  putative sigma E regulatory protein, MucB/RseB  26.05 
 
 		 248 aa  85.5  8e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000142114  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2902  hypothetical protein  21.74 
 
 		 243 aa  85.1  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0902383 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08460  hypothetical protein  26.18 
 
 		 262 aa  84  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2009  hypothetical protein  29 
 
 		 261 aa  83.6  0.000000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0366  hypothetical protein  23.55 
 
 		 253 aa  81.6  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003708  outer membrane lipoprotein-sorting protein  27.48 
 
 		 263 aa  77.4  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.212614  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3286  hypothetical protein  25.33 
 
 		 267 aa  76.6  0.0000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1316  hypothetical protein  22.73 
 
 		 273 aa  65.1  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0910605  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1653  hypothetical protein  25.27 
 
 		 266 aa  64.7  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.561802  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0539  hypothetical protein  25.87 
 
 		 269 aa  65.1  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2969  putative sigma E regulatory protein, MucB/RseB  25.15 
 
 		 278 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2786  hypothetical protein  25.15 
 
 		 278 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.402012  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1179  hypothetical protein  27.45 
 
 		 263 aa  57.8  0.0000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1659  hypothetical protein  25.68 
 
 		 270 aa  55.8  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2544  hypothetical protein  22.73 
 
 		 275 aa  55.5  0.0000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.770236  normal  0.684927 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0676  hypothetical protein  23.68 
 
 		 271 aa  55.5  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.860563 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1800  hypothetical protein  24.46 
 
 		 241 aa  54.7  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.73611  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1515  hypothetical protein  24.11 
 
 		 268 aa  54.3  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.74653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0210  hypothetical protein  20.3 
 
 		 268 aa  53.5  0.000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.892318  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29490  hypothetical protein  26.42 
 
 		 330 aa  53.1  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2002  hypothetical protein  21.23 
 
 		 277 aa  52.8  0.000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.465014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2225  hypothetical protein  22.22 
 
 		 264 aa  52  0.000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0454  hypothetical protein  24.2 
 
 		 268 aa  52  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1322  von Willebrand factor, type A  20 
 
 		 266 aa  51.6  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1528  hypothetical protein  21.23 
 
 		 273 aa  51.2  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.676069  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0435  hypothetical protein  23.58 
 
 		 268 aa  50.4  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0634  hypothetical protein  22.93 
 
 		 268 aa  48.5  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.71934  normal  0.575914 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0396  hypothetical protein  24.16 
 
 		 279 aa  47.8  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000270968  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2343  hypothetical protein  26.92 
 
 		 260 aa  47  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3142  hypothetical protein  27.21 
 
 		 260 aa  47  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.818868  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1471  hypothetical protein  27.21 
 
 		 260 aa  46.6  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3256  hypothetical protein  27.21 
 
 		 260 aa  46.6  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.981217  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2084  hypothetical protein  27.21 
 
 		 260 aa  46.6  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.142481  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1111  hypothetical protein  27.21 
 
 		 257 aa  47  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2375  hypothetical protein  27.21 
 
 		 260 aa  46.6  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1390  hypothetical protein  27.21 
 
 		 260 aa  46.6  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.675237  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2986  RND efflux transporter  23.48 
 
 		 1051 aa  45.8  0.0007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.594238  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2703  hypothetical protein  20.5 
 
 		 261 aa  45.1  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0806  hypothetical protein  20.77 
 
 		 1083 aa  42.7  0.006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.712772  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0959  hypothetical protein  22.22 
 
 		 290 aa  42  0.01  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>