45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0435 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0435  hypothetical protein  100 
 
 		 268 aa  556  1e-158  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0454  hypothetical protein  95.9 
 
 		 268 aa  525  1e-148  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1659  hypothetical protein  77.11 
 
 		 270 aa  409  1e-113  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1515  hypothetical protein  71.65 
 
 		 268 aa  393  1e-108  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.74653  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2009  hypothetical protein  32.33 
 
 		 261 aa  134  1.9999999999999998e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0152  hypothetical protein  34.12 
 
 		 269 aa  128  1.0000000000000001e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0634  hypothetical protein  30.23 
 
 		 268 aa  125  8.000000000000001e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.71934  normal  0.575914 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0396  hypothetical protein  30 
 
 		 279 aa  123  3e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000270968  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1179  hypothetical protein  31.11 
 
 		 263 aa  122  8e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2225  hypothetical protein  34.04 
 
 		 264 aa  112  5e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1528  hypothetical protein  30.85 
 
 		 273 aa  101  1e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.676069  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1316  hypothetical protein  26.56 
 
 		 273 aa  100  4e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0910605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003708  outer membrane lipoprotein-sorting protein  35.84 
 
 		 263 aa  99.8  5e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.212614  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08460  hypothetical protein  31.28 
 
 		 262 aa  92  9e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1653  hypothetical protein  29.61 
 
 		 266 aa  89.7  4e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.561802  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1423  putative outer membrane protein  29.39 
 
 		 281 aa  87.4  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0426224  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1322  von Willebrand factor, type A  26.79 
 
 		 266 aa  87.4  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2743  putative outer membrane protein  28.63 
 
 		 284 aa  86.7  3e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2703  hypothetical protein  26.24 
 
 		 261 aa  85.5  8e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0806  hypothetical protein  26.48 
 
 		 1083 aa  82.4  0.000000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.712772  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2786  hypothetical protein  23.36 
 
 		 278 aa  82.4  0.000000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.402012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2969  putative sigma E regulatory protein, MucB/RseB  23.36 
 
 		 278 aa  82.4  0.000000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0468  hypothetical protein  27.51 
 
 		 257 aa  74.7  0.000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2002  hypothetical protein  25.4 
 
 		 277 aa  73.6  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.465014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0676  hypothetical protein  29.14 
 
 		 271 aa  71.2  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.860563 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2533  hypothetical protein  25.21 
 
 		 264 aa  68.9  0.00000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.154061  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0210  hypothetical protein  25.35 
 
 		 268 aa  67.4  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.892318  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5301  hypothetical protein  25.45 
 
 		 257 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.457246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1661  hypothetical protein  25.45 
 
 		 257 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.612075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1019  hypothetical protein  25.6 
 
 		 254 aa  67.8  0.0000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.353251  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2986  RND efflux transporter  23.47 
 
 		 1051 aa  67.4  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.594238  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23220  putative sigma E regulatory protein, MucB/RseB  28.04 
 
 		 248 aa  65.9  0.0000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000142114  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0539  hypothetical protein  29.17 
 
 		 269 aa  60.8  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0959  hypothetical protein  24.42 
 
 		 290 aa  59.3  0.00000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1941  hypothetical protein  28.97 
 
 		 277 aa  58.9  0.00000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.143192  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5043  hypothetical protein  25.81 
 
 		 247 aa  55.1  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05400  hypothetical protein  25 
 
 		 240 aa  53.9  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1428  hypothetical protein  24.78 
 
 		 267 aa  53.1  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.906524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1294  hypothetical protein  25.84 
 
 		 262 aa  53.1  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.522431 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2661  hypothetical protein  23.2 
 
 		 270 aa  51.2  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001463  outer membrane lipoprotein-sorting protein  27.38 
 
 		 248 aa  50.1  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3198  hypothetical protein  27.66 
 
 		 255 aa  49.3  0.00007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2902  hypothetical protein  22.92 
 
 		 243 aa  48.1  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0902383 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2372  hypothetical protein  24.51 
 
 		 250 aa  45.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000349314  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0436  hypothetical protein  20.45 
 
 		 260 aa  43.1  0.005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0378114  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>