54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2902 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_2902  hypothetical protein  100 
 
 		 243 aa  491  9.999999999999999e-139  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0902383 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2533  hypothetical protein  31.25 
 
 		 264 aa  122  4e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.154061  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0436  hypothetical protein  28.91 
 
 		 260 aa  115  6e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0378114  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2372  hypothetical protein  26.64 
 
 		 250 aa  108  5e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000349314  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2496  hypothetical protein  29.55 
 
 		 262 aa  107  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5301  hypothetical protein  29.24 
 
 		 257 aa  104  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.457246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1661  hypothetical protein  29.24 
 
 		 257 aa  104  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.612075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08460  hypothetical protein  32.16 
 
 		 262 aa  102  5e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5043  hypothetical protein  26.43 
 
 		 247 aa  94.4  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3198  hypothetical protein  24.17 
 
 		 255 aa  90.1  3e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001463  outer membrane lipoprotein-sorting protein  24.55 
 
 		 248 aa  87  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2661  hypothetical protein  21.74 
 
 		 270 aa  85.9  6e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1428  hypothetical protein  22.27 
 
 		 267 aa  85.1  9e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.906524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05400  hypothetical protein  24.74 
 
 		 240 aa  80.9  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1251  hypothetical protein  21.49 
 
 		 263 aa  76.3  0.0000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.309853  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2390  hypothetical protein  25.48 
 
 		 265 aa  72.8  0.000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.564137  normal  0.698775 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003708  outer membrane lipoprotein-sorting protein  25.71 
 
 		 263 aa  70.9  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.212614  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1019  hypothetical protein  24.08 
 
 		 254 aa  70.9  0.00000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.353251  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23220  putative sigma E regulatory protein, MucB/RseB  23.87 
 
 		 248 aa  69.7  0.00000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000142114  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2009  hypothetical protein  27.22 
 
 		 261 aa  65.1  0.000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1179  hypothetical protein  27.95 
 
 		 263 aa  63.2  0.000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0396  hypothetical protein  22.99 
 
 		 279 aa  62.4  0.000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000270968  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1316  hypothetical protein  24.79 
 
 		 273 aa  60.8  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0910605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2743  putative outer membrane protein  28.29 
 
 		 284 aa  60.5  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1653  hypothetical protein  22.92 
 
 		 266 aa  59.7  0.00000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.561802  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1423  putative outer membrane protein  25.65 
 
 		 281 aa  58.2  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0426224  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2002  hypothetical protein  22.92 
 
 		 277 aa  57.4  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.465014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0210  hypothetical protein  25.54 
 
 		 268 aa  56.2  0.0000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.892318  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0366  hypothetical protein  25.56 
 
 		 253 aa  55.8  0.0000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0959  hypothetical protein  21.57 
 
 		 290 aa  54.3  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3286  hypothetical protein  24.44 
 
 		 267 aa  54.3  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1294  hypothetical protein  23.77 
 
 		 262 aa  52.4  0.000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.522431 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1322  von Willebrand factor, type A  21.49 
 
 		 266 aa  52  0.000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0676  hypothetical protein  22.46 
 
 		 271 aa  51.2  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.860563 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0468  hypothetical protein  24.34 
 
 		 257 aa  52  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2703  hypothetical protein  21.34 
 
 		 261 aa  50.8  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0634  hypothetical protein  25.29 
 
 		 268 aa  49.7  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.71934  normal  0.575914 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1800  hypothetical protein  22.22 
 
 		 241 aa  49.7  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.73611  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0539  hypothetical protein  22.22 
 
 		 269 aa  48.9  0.00007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1659  hypothetical protein  28.12 
 
 		 270 aa  48.9  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0435  hypothetical protein  23.05 
 
 		 268 aa  48.5  0.00009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0454  hypothetical protein  23.23 
 
 		 268 aa  48.5  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1941  hypothetical protein  25.16 
 
 		 277 aa  48.5  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.143192  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2986  RND efflux transporter  28.83 
 
 		 1051 aa  47  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.594238  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1515  hypothetical protein  23.39 
 
 		 268 aa  45.8  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.74653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000977  hypothetical protein  24.28 
 
 		 261 aa  45.4  0.0008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0806  hypothetical protein  23.27 
 
 		 1083 aa  44.7  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.712772  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2544  hypothetical protein  22.89 
 
 		 275 aa  44.7  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.770236  normal  0.684927 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07027  hypothetical protein  24.31 
 
 		 261 aa  44.3  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2969  putative sigma E regulatory protein, MucB/RseB  21 
 
 		 278 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2225  hypothetical protein  23.43 
 
 		 264 aa  44.3  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2786  hypothetical protein  21 
 
 		 278 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.402012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2529  hypothetical protein  24.5 
 
 		 245 aa  42.4  0.007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0517946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1528  hypothetical protein  25.17 
 
 		 273 aa  42  0.008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.676069  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>