32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_07027 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_07027  hypothetical protein  100 
 
 
261 aa  539  9.999999999999999e-153  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000977  hypothetical protein  96.55 
 
 
261 aa  521  1e-147  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0384  hypothetical protein  63.18 
 
 
241 aa  274  8e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2439  hypothetical protein  44.67 
 
 
244 aa  212  3.9999999999999995e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2529  hypothetical protein  33.33 
 
 
245 aa  125  9e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0517946  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1097  hypothetical protein  30.61 
 
 
267 aa  122  8e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000255633  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6147  hypothetical protein  29.27 
 
 
253 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.832582  normal  0.467029 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2390  hypothetical protein  31.53 
 
 
265 aa  106  3e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.564137  normal  0.698775 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2343  hypothetical protein  29.07 
 
 
260 aa  103  3e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3286  hypothetical protein  27.73 
 
 
267 aa  103  4e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5640  hypothetical protein  29.36 
 
 
250 aa  101  9e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6005  hypothetical protein  29.36 
 
 
250 aa  101  9e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6496  hypothetical protein  29.36 
 
 
250 aa  102  9e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1948  hypothetical protein  30.29 
 
 
259 aa  100  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.081935  normal  0.0130453 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0366  hypothetical protein  28.46 
 
 
253 aa  99.8  4e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7414  hypothetical protein  28.89 
 
 
246 aa  99  6e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0281509  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6688  hypothetical protein  29.52 
 
 
261 aa  98.2  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.607984  normal  0.733294 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3256  hypothetical protein  28.63 
 
 
260 aa  96.3  4e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.981217  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2375  hypothetical protein  28.63 
 
 
260 aa  96.3  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2084  hypothetical protein  28.63 
 
 
260 aa  96.3  4e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.142481  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1390  hypothetical protein  28.63 
 
 
260 aa  96.3  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.675237  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1111  hypothetical protein  28.63 
 
 
257 aa  96.3  4e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1471  hypothetical protein  28.63 
 
 
260 aa  96.3  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3142  hypothetical protein  28.19 
 
 
260 aa  93.2  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.818868  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29490  hypothetical protein  32.35 
 
 
330 aa  84  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3041  hypothetical protein  28.93 
 
 
317 aa  70.9  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.123051 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1800  hypothetical protein  25.87 
 
 
241 aa  63.2  0.000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.73611  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2544  hypothetical protein  26.39 
 
 
275 aa  58.2  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.770236  normal  0.684927 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19650  hypothetical protein  27.27 
 
 
250 aa  57.4  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2021  hypothetical protein  27.64 
 
 
238 aa  57  0.0000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000720382  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1294  hypothetical protein  25.34 
 
 
262 aa  45.4  0.0008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.522431 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2902  hypothetical protein  24.31 
 
 
243 aa  43.9  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0902383 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>