28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_6147 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008392  Bamb_6147  hypothetical protein  100 
 
 		 253 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.832582  normal  0.467029 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6496  hypothetical protein  88.93 
 
 		 250 aa  433  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5640  hypothetical protein  88.93 
 
 		 250 aa  432  1e-120  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6005  hypothetical protein  88.93 
 
 		 250 aa  432  1e-120  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7414  hypothetical protein  88.54 
 
 		 246 aa  430  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0281509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000977  hypothetical protein  30.45 
 
 		 261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07027  hypothetical protein  29.27 
 
 		 261 aa  108  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2439  hypothetical protein  27.04 
 
 		 244 aa  100  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3286  hypothetical protein  29.3 
 
 		 267 aa  99.8  4e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0384  hypothetical protein  29.09 
 
 		 241 aa  98.6  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2529  hypothetical protein  26.61 
 
 		 245 aa  89.4  6e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0517946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6688  hypothetical protein  27.68 
 
 		 261 aa  86.3  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.607984  normal  0.733294 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0366  hypothetical protein  26.56 
 
 		 253 aa  82.8  0.000000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2390  hypothetical protein  25.44 
 
 		 265 aa  80.1  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.564137  normal  0.698775 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29490  hypothetical protein  29.52 
 
 		 330 aa  69.3  0.00000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3142  hypothetical protein  27.18 
 
 		 260 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.818868  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1390  hypothetical protein  26.7 
 
 		 260 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.675237  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3256  hypothetical protein  26.7 
 
 		 260 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.981217  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2375  hypothetical protein  26.7 
 
 		 260 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1471  hypothetical protein  26.7 
 
 		 260 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2084  hypothetical protein  26.7 
 
 		 260 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.142481  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1111  hypothetical protein  27.12 
 
 		 257 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2343  hypothetical protein  25.73 
 
 		 260 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1097  hypothetical protein  25.31 
 
 		 267 aa  58.9  0.00000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000255633  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1948  hypothetical protein  24.7 
 
 		 259 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.081935  normal  0.0130453 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3041  hypothetical protein  27.91 
 
 		 317 aa  58.2  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.123051 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1294  hypothetical protein  23.41 
 
 		 262 aa  53.1  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.522431 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2544  hypothetical protein  25.23 
 
 		 275 aa  52.4  0.000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.770236  normal  0.684927 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>