34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3041 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_3041  hypothetical protein  100 
 
 
317 aa  644    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.123051 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29490  hypothetical protein  38.03 
 
 
330 aa  139  7.999999999999999e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0366  hypothetical protein  35.5 
 
 
253 aa  101  2e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2390  hypothetical protein  31.22 
 
 
265 aa  97.8  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.564137  normal  0.698775 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3286  hypothetical protein  36.17 
 
 
267 aa  87.4  3e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6688  hypothetical protein  32.28 
 
 
261 aa  86.3  7e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.607984  normal  0.733294 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000977  hypothetical protein  28.28 
 
 
261 aa  72.8  0.000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1097  hypothetical protein  30.43 
 
 
267 aa  71.6  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000255633  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07027  hypothetical protein  28.93 
 
 
261 aa  70.9  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3142  hypothetical protein  29.67 
 
 
260 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.818868  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2544  hypothetical protein  26.67 
 
 
275 aa  68.9  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.770236  normal  0.684927 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2343  hypothetical protein  30.22 
 
 
260 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1111  hypothetical protein  29.67 
 
 
257 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1471  hypothetical protein  29.67 
 
 
260 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1390  hypothetical protein  29.67 
 
 
260 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.675237  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3256  hypothetical protein  29.67 
 
 
260 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.981217  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2084  hypothetical protein  29.67 
 
 
260 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.142481  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2375  hypothetical protein  29.67 
 
 
260 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1948  hypothetical protein  27.92 
 
 
259 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.081935  normal  0.0130453 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0384  hypothetical protein  29.01 
 
 
241 aa  63.9  0.000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2529  hypothetical protein  27.7 
 
 
245 aa  61.6  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0517946  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1294  hypothetical protein  26.44 
 
 
262 aa  59.3  0.00000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.522431 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6147  hypothetical protein  27.91 
 
 
253 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.832582  normal  0.467029 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7414  hypothetical protein  29.05 
 
 
246 aa  57  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0281509  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2439  hypothetical protein  27.03 
 
 
244 aa  56.6  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6496  hypothetical protein  26.94 
 
 
250 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5640  hypothetical protein  26.94 
 
 
250 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6005  hypothetical protein  26.94 
 
 
250 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19650  hypothetical protein  27.21 
 
 
250 aa  51.2  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2533  hypothetical protein  25.71 
 
 
264 aa  45.4  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.154061  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0454  hypothetical protein  22.73 
 
 
268 aa  42.7  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003708  outer membrane lipoprotein-sorting protein  22.5 
 
 
263 aa  42.7  0.008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.212614  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1661  hypothetical protein  23.68 
 
 
257 aa  42.4  0.01  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.612075  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5301  hypothetical protein  23.68 
 
 
257 aa  42.4  0.01  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.457246  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>