59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003708 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_003708  outer membrane lipoprotein-sorting protein  100 
 
 		 263 aa  547  1e-155  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.212614  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1653  hypothetical protein  61.63 
 
 		 266 aa  320  9.999999999999999e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.561802  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1322  von Willebrand factor, type A  55.47 
 
 		 266 aa  289  3e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0539  hypothetical protein  54.85 
 
 		 269 aa  277  1e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2002  hypothetical protein  49.43 
 
 		 277 aa  266  2.9999999999999995e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.465014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0676  hypothetical protein  48.13 
 
 		 271 aa  240  2e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.860563 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2009  hypothetical protein  34.89 
 
 		 261 aa  134  1.9999999999999998e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2703  hypothetical protein  32.08 
 
 		 261 aa  120  1.9999999999999998e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1179  hypothetical protein  32.83 
 
 		 263 aa  120  3e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0152  hypothetical protein  32.66 
 
 		 269 aa  117  1.9999999999999998e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0396  hypothetical protein  33.84 
 
 		 279 aa  115  5e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000270968  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2986  RND efflux transporter  29.89 
 
 		 1051 aa  115  6.9999999999999995e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.594238  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1528  hypothetical protein  29.73 
 
 		 273 aa  112  6e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.676069  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2969  putative sigma E regulatory protein, MucB/RseB  31.2 
 
 		 278 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2225  hypothetical protein  30.93 
 
 		 264 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2786  hypothetical protein  31.2 
 
 		 278 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.402012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08460  hypothetical protein  29.86 
 
 		 262 aa  106  3e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0806  hypothetical protein  30.22 
 
 		 1083 aa  106  5e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.712772  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1659  hypothetical protein  35.47 
 
 		 270 aa  104  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1515  hypothetical protein  34.88 
 
 		 268 aa  101  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.74653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1316  hypothetical protein  30.15 
 
 		 273 aa  101  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0910605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0634  hypothetical protein  27.6 
 
 		 268 aa  100  2e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.71934  normal  0.575914 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0435  hypothetical protein  35.84 
 
 		 268 aa  99.4  5e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0454  hypothetical protein  35.26 
 
 		 268 aa  97.4  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2743  putative outer membrane protein  26.24 
 
 		 284 aa  92  9e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1423  putative outer membrane protein  28.57 
 
 		 281 aa  91.7  1e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0426224  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1941  hypothetical protein  28.51 
 
 		 277 aa  89  7e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.143192  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0468  hypothetical protein  33.52 
 
 		 257 aa  85.9  6e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0210  hypothetical protein  26.48 
 
 		 268 aa  84.3  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.892318  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0959  hypothetical protein  26.86 
 
 		 290 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2661  hypothetical protein  27.48 
 
 		 270 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3198  hypothetical protein  26.74 
 
 		 255 aa  77  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1428  hypothetical protein  26.25 
 
 		 267 aa  75.1  0.0000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.906524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2902  hypothetical protein  25.71 
 
 		 243 aa  70.5  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0902383 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5301  hypothetical protein  26.58 
 
 		 257 aa  69.7  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.457246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1661  hypothetical protein  26.58 
 
 		 257 aa  69.7  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.612075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23220  putative sigma E regulatory protein, MucB/RseB  24.52 
 
 		 248 aa  67.8  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000142114  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2496  hypothetical protein  28.27 
 
 		 262 aa  66.6  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2533  hypothetical protein  23.88 
 
 		 264 aa  65.1  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.154061  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05400  hypothetical protein  27.54 
 
 		 240 aa  63.2  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3286  hypothetical protein  25.42 
 
 		 267 aa  62  0.000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0436  hypothetical protein  27.23 
 
 		 260 aa  60.1  0.00000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0378114  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1019  hypothetical protein  22.18 
 
 		 254 aa  60.1  0.00000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.353251  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001463  outer membrane lipoprotein-sorting protein  28.47 
 
 		 248 aa  58.9  0.00000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0366  hypothetical protein  25.84 
 
 		 253 aa  57.8  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2390  hypothetical protein  24.19 
 
 		 265 aa  57.4  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.564137  normal  0.698775 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1251  hypothetical protein  21.48 
 
 		 263 aa  55.5  0.0000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.309853  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5043  hypothetical protein  25.35 
 
 		 247 aa  54.3  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1352  hypothetical protein  25.65 
 
 		 417 aa  51.2  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000699825  decreased coverage  0.0000016423 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2544  hypothetical protein  26.96 
 
 		 275 aa  48.9  0.00009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.770236  normal  0.684927 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2465  hypothetical protein  22.86 
 
 		 421 aa  47  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.149567  normal  0.267329 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1800  hypothetical protein  25.41 
 
 		 241 aa  43.9  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.73611  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1750  Outer membrane lipoprotein-sorting protein-like protein  21.62 
 
 		 362 aa  43.9  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1499  putative sigma E regulatory protein, MucB/RseB  34.94 
 
 		 243 aa  43.5  0.003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.464164  normal  0.0324686 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1553  hypothetical protein  26.19 
 
 		 239 aa  43.1  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29490  hypothetical protein  27.72 
 
 		 330 aa  42.7  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3041  hypothetical protein  22.5 
 
 		 317 aa  42.7  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.123051 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0163  hypothetical protein  30 
 
 		 451 aa  42.4  0.008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.942803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0589  hypothetical protein  24.17 
 
 		 435 aa  42.4  0.009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000090884 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>