10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1553 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1553  hypothetical protein  100 
 
 		 239 aa  479  1e-134  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3067  hypothetical protein  31.36 
 
 		 227 aa  88.6  8e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.259111 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0253  hypothetical protein  31.98 
 
 		 217 aa  85.5  6e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.738301  normal  0.860675 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3382  hypothetical protein  26.41 
 
 		 369 aa  62.4  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000236638  normal  0.0236952 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0888  hypothetical protein  24.68 
 
 		 239 aa  58.2  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1446  hypothetical protein  21.57 
 
 		 392 aa  55.1  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.950641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1750  Outer membrane lipoprotein-sorting protein-like protein  23.92 
 
 		 362 aa  45.4  0.0008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003708  outer membrane lipoprotein-sorting protein  26.19 
 
 		 263 aa  43.1  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.212614  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1824  hypothetical protein  24.75 
 
 		 186 aa  42.4  0.006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.136936  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0128  hypothetical protein  20.49 
 
 		 334 aa  42.4  0.007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.112171  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>