19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1750 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_1750  Outer membrane lipoprotein-sorting protein-like protein  100 
 
 
362 aa  734    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0235  hypothetical protein  28.61 
 
 
360 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.129282  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3382  hypothetical protein  26.51 
 
 
369 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000236638  normal  0.0236952 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0102  Outer membrane lipoprotein-sorting protein-like protein  27.69 
 
 
258 aa  101  3e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1446  hypothetical protein  24.27 
 
 
392 aa  95.5  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.950641  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0128  hypothetical protein  21.76 
 
 
334 aa  84  0.000000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.112171  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3379  hypothetical protein  27.36 
 
 
222 aa  67.8  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000316854  hitchhiker  0.00980308 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1041  Outer membrane lipoprotein-sorting protein-like protein  26.02 
 
 
262 aa  62.8  0.000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1751  hypothetical protein  22.51 
 
 
389 aa  54.7  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2316  hypothetical protein  26.04 
 
 
292 aa  52.4  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1207  hypothetical protein  30.58 
 
 
392 aa  52.4  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.556738  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34780  hypothetical protein  27.67 
 
 
205 aa  51.6  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2381  hypothetical protein  27.33 
 
 
410 aa  50.1  0.00006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1553  hypothetical protein  25.78 
 
 
239 aa  48.5  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1824  hypothetical protein  20.59 
 
 
186 aa  48.5  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.136936  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0398  hypothetical protein  24.65 
 
 
393 aa  47.8  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3710  putative outer membrane lipoprotein-sorting protein  24.37 
 
 
264 aa  47  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003708  outer membrane lipoprotein-sorting protein  21.62 
 
 
263 aa  44.3  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.212614  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3946  hypothetical protein  30.38 
 
 
196 aa  43.1  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.134594  normal  0.0381064 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>