37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0235 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_0235  hypothetical protein  100 
 
 
360 aa  739    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.129282  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3382  hypothetical protein  33.7 
 
 
369 aa  250  3e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000236638  normal  0.0236952 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1446  hypothetical protein  32.81 
 
 
392 aa  179  8e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.950641  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0128  hypothetical protein  28.61 
 
 
334 aa  162  7e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.112171  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1750  Outer membrane lipoprotein-sorting protein-like protein  28.61 
 
 
362 aa  137  4e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1824  hypothetical protein  29.44 
 
 
186 aa  93.6  5e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.136936  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2626  hypothetical protein  21.83 
 
 
385 aa  85.1  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000023102  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3379  hypothetical protein  25.68 
 
 
222 aa  76.3  0.0000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000316854  hitchhiker  0.00980308 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1751  hypothetical protein  22.19 
 
 
389 aa  72.8  0.000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0102  Outer membrane lipoprotein-sorting protein-like protein  24.39 
 
 
258 aa  58.9  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2390  hypothetical protein  21.91 
 
 
389 aa  55.8  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.759186  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0634  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  27.49 
 
 
236 aa  53.1  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.64483e-29 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1948  hypothetical protein  21.96 
 
 
259 aa  53.1  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.081935  normal  0.0130453 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1807  hypothetical protein  23.94 
 
 
554 aa  52.4  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2381  hypothetical protein  25.64 
 
 
410 aa  50.4  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0398  hypothetical protein  31.37 
 
 
393 aa  50.4  0.00005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3203  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA, putative  23.27 
 
 
242 aa  49.7  0.00007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.412131  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1041  Outer membrane lipoprotein-sorting protein-like protein  27.75 
 
 
262 aa  48.9  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0380  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  22.65 
 
 
229 aa  48.5  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3302  putative sigma E regulatory protein, MucB/RseB  21.24 
 
 
354 aa  47.8  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.663366  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6688  hypothetical protein  21.4 
 
 
261 aa  47.4  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.607984  normal  0.733294 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3710  putative outer membrane lipoprotein-sorting protein  20.62 
 
 
264 aa  46.2  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1293  hypothetical protein  23.84 
 
 
416 aa  46.2  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.896512  hitchhiker  0.00148296 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2806  hypothetical protein  29.01 
 
 
239 aa  45.8  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000791323  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0620  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  25.73 
 
 
236 aa  45.8  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.130714  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1444  hypothetical protein  22.37 
 
 
387 aa  45.1  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2009  hypothetical protein  22.97 
 
 
261 aa  44.7  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0146  hypothetical protein  29.86 
 
 
157 aa  44.7  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2607  hypothetical protein  22.65 
 
 
222 aa  44.3  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1729  hypothetical protein  28.93 
 
 
202 aa  43.9  0.004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3601  putative outer membrane lipoprotein-sorting protein  26.14 
 
 
264 aa  43.5  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2496  hypothetical protein  23.64 
 
 
262 aa  43.5  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0845  hypothetical protein  20.08 
 
 
330 aa  43.5  0.006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000342315  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1734  hypothetical protein  26.7 
 
 
282 aa  43.5  0.006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.199034  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1577  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  22.97 
 
 
220 aa  43.1  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1197  sigma E regulatory protein, MucB/RseB  25.36 
 
 
310 aa  42.7  0.01  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000235291  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1428  hypothetical protein  20.25 
 
 
382 aa  42.7  0.01  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>