21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2607 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE2607  hypothetical protein  100 
 
 
222 aa  453  1.0000000000000001e-126  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0350  export chaperone  26.7 
 
 
216 aa  80.1  0.00000000000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0325966  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2594  outer-membrane lipoprotein carrier protein  26.99 
 
 
208 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30310  outer-membrane lipoprotein carrier protein  26.99 
 
 
208 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2387  outer-membrane lipoprotein carrier protein  23.78 
 
 
208 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0116989 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3710  putative outer membrane lipoprotein-sorting protein  26.52 
 
 
264 aa  50.1  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1497  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  23.96 
 
 
202 aa  48.5  0.00008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.540106  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3203  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA, putative  23.72 
 
 
242 aa  47.8  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.412131  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0757  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  28.65 
 
 
212 aa  46.6  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000775377 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3601  putative outer membrane lipoprotein-sorting protein  26.73 
 
 
264 aa  45.8  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28210  outer-membrane lipoprotein carrier protein  23.59 
 
 
207 aa  45.8  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.372853  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0718  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  24 
 
 
241 aa  45.1  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000504074  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3092  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  21.96 
 
 
242 aa  44.7  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0120702  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0380  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  21.88 
 
 
229 aa  44.7  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2003  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  23.56 
 
 
205 aa  45.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0235  hypothetical protein  23.32 
 
 
360 aa  43.9  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.129282  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1296  Outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  20.09 
 
 
208 aa  43.9  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.435605 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1574  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  21.03 
 
 
219 aa  42.4  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.057142  normal  0.0500809 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1753  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  25.95 
 
 
233 aa  42.4  0.006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0975512  normal  0.0644178 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0634  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  24.38 
 
 
236 aa  42  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.64483e-29 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1206  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  19.72 
 
 
225 aa  42  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000867117  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>