79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1577 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1577  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  100 
 
 		 220 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6264  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  24.08 
 
 		 225 aa  87  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.9393  normal  0.236889 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1425  hypothetical protein  23.56 
 
 		 214 aa  83.2  0.000000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360648 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0805  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  27.4 
 
 		 234 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.391961  normal  0.496775 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3064  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  25.7 
 
 		 220 aa  79  0.00000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00368747 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3207  Outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  26.38 
 
 		 242 aa  70.9  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0138209  hitchhiker  0.00000000000000265971 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3203  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA, putative  27.54 
 
 		 242 aa  65.9  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.412131  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2699  gliding motility-related protein; outer membrane protein  22.33 
 
 		 214 aa  63.5  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0217781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0620  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  24.9 
 
 		 236 aa  60.8  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.130714  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3188  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  21.15 
 
 		 203 aa  60.1  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.949207  normal  0.702374 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0348  Outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  28.97 
 
 		 236 aa  58.9  0.00000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3197  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  24.79 
 
 		 237 aa  57.8  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0032  putative outer membrane lipoprotein-sorting protein  27.78 
 
 		 243 aa  57  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0634  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  24.58 
 
 		 236 aa  57.4  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.64483e-29 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3092  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  25 
 
 		 242 aa  56.2  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0120702  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0814  outer-membrane lipoprotein carrier protein  24.54 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000179338  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06255  hypothetical protein  24.51 
 
 		 221 aa  55.5  0.0000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0396795  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1206  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  22.97 
 
 		 225 aa  53.9  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000867117  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1935  outer-membrane lipoprotein carrier protein  28.49 
 
 		 212 aa  53.1  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.765114  normal  0.707119 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0718  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  22.46 
 
 		 241 aa  53.1  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000504074  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1419  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  25.57 
 
 		 225 aa  52.4  0.000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.174012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0995  outer-membrane lipoprotein carrier protein  22.17 
 
 		 203 aa  52.4  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1060  outer-membrane lipoprotein carrier protein  22.17 
 
 		 203 aa  52.4  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1026  outer-membrane lipoprotein carrier protein  22.17 
 
 		 203 aa  52.4  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0966  outer-membrane lipoprotein carrier protein  22.17 
 
 		 203 aa  52.4  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0187172  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1075  outer-membrane lipoprotein carrier protein  22.17 
 
 		 203 aa  52.4  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0370  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  24.87 
 
 		 233 aa  52  0.000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0721614 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0235  hypothetical protein  22.42 
 
 		 360 aa  51.6  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.129282  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5854  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  19.62 
 
 		 213 aa  51.6  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1729  hypothetical protein  26.18 
 
 		 202 aa  50.4  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2387  outer-membrane lipoprotein carrier protein  25.57 
 
 		 208 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0116989 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1729  hypothetical protein  26.18 
 
 		 202 aa  50.4  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2435  outer-membrane lipoprotein carrier protein  25.12 
 
 		 210 aa  50.4  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.699017  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1574  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  25.51 
 
 		 219 aa  50.1  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.057142  normal  0.0500809 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1720  outer-membrane lipoprotein carrier protein  24.42 
 
 		 203 aa  49.7  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2437  outer-membrane lipoprotein carrier protein  22.6 
 
 		 203 aa  48.5  0.00007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0718725  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2229  outer-membrane lipoprotein carrier protein  22.6 
 
 		 203 aa  48.5  0.00007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.583755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2705  outer-membrane lipoprotein carrier protein  22.6 
 
 		 203 aa  48.5  0.00007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0180788  normal  0.777132 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1988  outer-membrane lipoprotein carrier protein  23.5 
 
 		 203 aa  48.5  0.00007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.937867  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1053  outer-membrane lipoprotein carrier protein  22.6 
 
 		 203 aa  48.5  0.00007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0514291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0966  outer-membrane lipoprotein carrier protein  22.6 
 
 		 203 aa  48.5  0.00007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.015889  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00902  hypothetical protein  22.6 
 
 		 204 aa  48.5  0.00007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2752  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  22.6 
 
 		 203 aa  48.5  0.00007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000100398  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00895  outer-membrane lipoprotein carrier protein precursor  22.6 
 
 		 204 aa  48.5  0.00007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.169529  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0996  outer-membrane lipoprotein carrier protein  22.6 
 
 		 203 aa  48.5  0.00007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00638939  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3208  Outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  26.86 
 
 		 272 aa  48.5  0.00008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.102941  hitchhiker  0.0000000000001111 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01040  outer-membrane lipoprotein carrier protein  26.7 
 
 		 216 aa  48.1  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.331194  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06126  outer-membrane lipoprotein carrier protein  26.7 
 
 		 216 aa  48.1  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.294227  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2594  outer-membrane lipoprotein carrier protein  26.67 
 
 		 208 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0380  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  24.65 
 
 		 229 aa  47.8  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1765  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  24 
 
 		 219 aa  47.8  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.455724  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30310  outer-membrane lipoprotein carrier protein  26.67 
 
 		 208 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1669  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  24.59 
 
 		 223 aa  47.8  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.632485  normal  0.483182 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1711  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  25.81 
 
 		 214 aa  47  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.113541  normal  0.724755 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2359  outer-membrane lipoprotein carrier protein  24.64 
 
 		 204 aa  47  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.328226  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2459  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  22.94 
 
 		 213 aa  47.4  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00395649  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1684  outer-membrane lipoprotein carrier protein  23.11 
 
 		 203 aa  47  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.146126 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1663  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  25.23 
 
 		 205 aa  46.6  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0801317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0893  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  22.11 
 
 		 238 aa  46.6  0.0003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0787284 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3798  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  23.18 
 
 		 238 aa  45.8  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1286  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  23.96 
 
 		 210 aa  45.4  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.699876  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1753  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  24.73 
 
 		 233 aa  45.4  0.0006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0975512  normal  0.0644178 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3202  hypothetical protein  27.55 
 
 		 270 aa  45.4  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.146501  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1497  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  25 
 
 		 202 aa  45.4  0.0007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.540106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1125  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  22.63 
 
 		 205 aa  45.4  0.0007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.437749 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3382  hypothetical protein  21.55 
 
 		 369 aa  45.1  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000236638  normal  0.0236952 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1549  outer-membrane lipoprotein carrier protein  27.01 
 
 		 216 aa  45.1  0.0009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.483652  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1956  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  24.86 
 
 		 224 aa  45.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0667595  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003878  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  25.57 
 
 		 208 aa  44.3  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000605758  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1783  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  27.31 
 
 		 208 aa  45.1  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.839422  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2555  outer-membrane lipoprotein carrier protein  23.81 
 
 		 215 aa  42.7  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.442107  normal  0.931729 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28210  outer-membrane lipoprotein carrier protein  24.48 
 
 		 207 aa  42.7  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.372853  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0765  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  25.13 
 
 		 217 aa  42.7  0.004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0575497  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1678  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  22.27 
 
 		 212 aa  43.1  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2151  outer-membrane lipoprotein carrier protein  23.81 
 
 		 215 aa  42.7  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.100483  normal  0.437177 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0757  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  24.3 
 
 		 212 aa  42.4  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000775377 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1760  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  24.56 
 
 		 216 aa  42  0.007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.889402 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1415  outer-membrane lipoprotein carrier protein  24.55 
 
 		 204 aa  42  0.008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.560758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1599  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  21.97 
 
 		 247 aa  42  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>