20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3064 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3064  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  100 
 
 		 220 aa  449  1e-125  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00368747 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2699  gliding motility-related protein; outer membrane protein  40.74 
 
 		 214 aa  172  2.9999999999999996e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0217781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6264  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  41.85 
 
 		 225 aa  171  9e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.9393  normal  0.236889 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5854  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  41.94 
 
 		 213 aa  158  6e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3188  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  36.97 
 
 		 203 aa  136  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.949207  normal  0.702374 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06255  hypothetical protein  30.14 
 
 		 221 aa  98.6  7e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0396795  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1461  hypothetical protein  30.14 
 
 		 215 aa  89  5e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2111  hypothetical protein  30.14 
 
 		 237 aa  89  5e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.19718  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1425  hypothetical protein  27.27 
 
 		 214 aa  84.7  0.000000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360648 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1577  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  25.26 
 
 		 220 aa  70.5  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1635  hypothetical protein  29.41 
 
 		 215 aa  58.9  0.00000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3207  Outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  25 
 
 		 242 aa  56.6  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0138209  hitchhiker  0.00000000000000265971 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0634  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  23.97 
 
 		 236 aa  54.3  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.64483e-29 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3203  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA, putative  22.27 
 
 		 242 aa  53.5  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.412131  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0620  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  22.31 
 
 		 236 aa  46.2  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.130714  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0718  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  22.22 
 
 		 241 aa  45.4  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000504074  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3092  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  20.94 
 
 		 242 aa  45.4  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0120702  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0719  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  26.12 
 
 		 277 aa  43.5  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000737257  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6863  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  24.4 
 
 		 258 aa  43.5  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0520741 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1669  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  21.92 
 
 		 223 aa  41.6  0.01  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.632485  normal  0.483182 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>