34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6264 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6264  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  100 
 
 		 225 aa  451  1.0000000000000001e-126  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.9393  normal  0.236889 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3064  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  41.85 
 
 		 220 aa  171  9e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00368747 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2699  gliding motility-related protein; outer membrane protein  39.56 
 
 		 214 aa  164  9e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0217781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5854  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  37.69 
 
 		 213 aa  134  8e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3188  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  37.62 
 
 		 203 aa  132  3e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.949207  normal  0.702374 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06255  hypothetical protein  29.26 
 
 		 221 aa  90.1  3e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0396795  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1577  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  23.68 
 
 		 220 aa  85.1  8e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2111  hypothetical protein  28.27 
 
 		 237 aa  81.3  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.19718  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1461  hypothetical protein  26.39 
 
 		 215 aa  80.1  0.00000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1425  hypothetical protein  27.59 
 
 		 214 aa  76.3  0.0000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360648 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2003  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  22.58 
 
 		 205 aa  57  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1669  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  20.32 
 
 		 223 aa  50.8  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.632485  normal  0.483182 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1497  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  24.02 
 
 		 202 aa  50.4  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.540106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1988  outer-membrane lipoprotein carrier protein  28.34 
 
 		 203 aa  50.4  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.937867  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1720  outer-membrane lipoprotein carrier protein  27.97 
 
 		 203 aa  50.8  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1419  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  22.16 
 
 		 225 aa  48.1  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.174012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3425  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  24.82 
 
 		 211 aa  47.4  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.936296  normal  0.790188 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1614  outer-membrane lipoprotein carrier protein  24.57 
 
 		 202 aa  45.8  0.0006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.154829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2595  outer-membrane lipoprotein carrier protein  24.57 
 
 		 202 aa  45.8  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00615115  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2684  outer-membrane lipoprotein carrier protein  24.57 
 
 		 202 aa  45.8  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.272207  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1935  outer-membrane lipoprotein carrier protein  23.16 
 
 		 212 aa  45.4  0.0007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.765114  normal  0.707119 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1760  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  21.56 
 
 		 216 aa  44.7  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.889402 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3207  Outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  22.54 
 
 		 242 aa  44.7  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0138209  hitchhiker  0.00000000000000265971 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2232  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  23.67 
 
 		 208 aa  43.5  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000470092  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0348  Outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  21.72 
 
 		 236 aa  43.5  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2259  outer-membrane lipoprotein carrier protein  26.7 
 
 		 204 aa  43.1  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.409405  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1125  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  22.58 
 
 		 205 aa  42.7  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.437749 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1826  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  21.05 
 
 		 219 aa  42.7  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.119174  hitchhiker  0.00000680848 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1684  outer-membrane lipoprotein carrier protein  23.48 
 
 		 203 aa  42.4  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.146126 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2359  outer-membrane lipoprotein carrier protein  26.04 
 
 		 204 aa  42.4  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.328226  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5362  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  24.8 
 
 		 211 aa  42.4  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2719  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  25.2 
 
 		 212 aa  42  0.007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.72131  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3381  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  25.2 
 
 		 210 aa  42  0.009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.23519 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1729  hypothetical protein  22.4 
 
 		 202 aa  41.6  0.01  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>