53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6863 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_6863  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  100 
 
 
258 aa  530  1e-150  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0520741 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0106  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  36.02 
 
 
226 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0095  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  36.02 
 
 
226 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0090  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  34.67 
 
 
207 aa  105  9e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.227988  normal  0.252414 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0088  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  34.95 
 
 
228 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.700906  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3197  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  29 
 
 
237 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0634  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  28.57 
 
 
236 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.64483e-29 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0620  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  28.12 
 
 
236 aa  72  0.000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.130714  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3092  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  27.27 
 
 
242 aa  70.1  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0120702  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3203  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA, putative  27.01 
 
 
242 aa  66.6  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.412131  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0718  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  26.73 
 
 
241 aa  64.7  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000504074  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0370  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  24.32 
 
 
233 aa  63.9  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0721614 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3207  Outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  25.5 
 
 
242 aa  63.5  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0138209  hitchhiker  0.00000000000000265971 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0377  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA, putative  31.86 
 
 
230 aa  62.4  0.000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.365354  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0547  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  31.86 
 
 
230 aa  62.4  0.000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.117593  hitchhiker  0.000046415 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1574  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  27.89 
 
 
219 aa  59.7  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.057142  normal  0.0500809 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2003  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  24.58 
 
 
205 aa  58.2  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1599  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  26.04 
 
 
247 aa  57  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1669  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  26.04 
 
 
223 aa  57  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.632485  normal  0.483182 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0184  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  26.59 
 
 
231 aa  56.6  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.386737 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0719  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  28.25 
 
 
277 aa  56.2  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000737257  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0380  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  27.17 
 
 
229 aa  55.5  0.0000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0805  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  21.81 
 
 
234 aa  54.3  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.391961  normal  0.496775 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3202  hypothetical protein  28.67 
 
 
270 aa  53.5  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.146501  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0686  outer-membrane lipoprotein carrier protein  27.61 
 
 
214 aa  52.8  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.973881  normal  0.650962 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3208  Outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  30.4 
 
 
272 aa  52.4  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.102941  hitchhiker  0.0000000000001111 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1125  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  28.46 
 
 
205 aa  52  0.000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.437749 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0348  Outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  25.84 
 
 
236 aa  52  0.000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1296  Outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  23.37 
 
 
208 aa  51.6  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.435605 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1753  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  24.78 
 
 
233 aa  52  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0975512  normal  0.0644178 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2599  outer-membrane lipoprotein carrier protein  28.89 
 
 
212 aa  51.6  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28210  outer-membrane lipoprotein carrier protein  23.94 
 
 
207 aa  50.4  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.372853  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30310  outer-membrane lipoprotein carrier protein  23.53 
 
 
208 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2594  outer-membrane lipoprotein carrier protein  23.53 
 
 
208 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1765  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  21.74 
 
 
219 aa  48.1  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.455724  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1711  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  23.84 
 
 
214 aa  48.5  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.113541  normal  0.724755 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1419  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  23.89 
 
 
225 aa  47.4  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.174012  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2151  outer-membrane lipoprotein carrier protein  26.12 
 
 
215 aa  47.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.100483  normal  0.437177 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1206  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  23.56 
 
 
225 aa  47.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000867117  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2555  outer-membrane lipoprotein carrier protein  25.37 
 
 
215 aa  46.6  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.442107  normal  0.931729 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3440  outer-membrane lipoprotein carrier protein  28.35 
 
 
244 aa  46.2  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.544535 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1783  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  22.54 
 
 
208 aa  46.2  0.0005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.839422  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1039  outer-membrane lipoprotein carrier protein  28.69 
 
 
244 aa  45.8  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0236245  normal  0.725621 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1497  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  25.36 
 
 
202 aa  44.7  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.540106  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0893  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  21.08 
 
 
238 aa  44.7  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0787284 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2387  outer-membrane lipoprotein carrier protein  20.74 
 
 
208 aa  44.3  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0116989 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2340  outer-membrane lipoprotein carrier protein  26.12 
 
 
215 aa  44.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.197859 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0032  putative outer membrane lipoprotein-sorting protein  25.68 
 
 
243 aa  44.7  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1869  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  26.52 
 
 
210 aa  43.9  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3064  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  24.4 
 
 
220 aa  43.5  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00368747 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0178  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  22.86 
 
 
207 aa  43.5  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.697529  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0636  outer-membrane lipoprotein carrier protein  27.07 
 
 
231 aa  42.4  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4909  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  33.33 
 
 
313 aa  42.4  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.296324  normal  0.198292 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>