51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_3208 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_3208  Outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  100 
 
 		 272 aa  552  1e-156  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.102941  hitchhiker  0.0000000000001111 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3202  hypothetical protein  69.6 
 
 		 270 aa  396  1e-109  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.146501  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0719  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  58.3 
 
 		 277 aa  316  2e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000737257  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0634  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  38.78 
 
 		 236 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.64483e-29 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0718  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  37.22 
 
 		 241 aa  171  1e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000504074  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0620  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  37.26 
 
 		 236 aa  171  2e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.130714  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3203  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA, putative  36.76 
 
 		 242 aa  161  1e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.412131  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3092  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  36.7 
 
 		 242 aa  157  3e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0120702  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3207  Outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  35.48 
 
 		 242 aa  154  1e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0138209  hitchhiker  0.00000000000000265971 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3197  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  34.34 
 
 		 237 aa  145  8.000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0380  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  24.72 
 
 		 229 aa  89.4  7e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0032  putative outer membrane lipoprotein-sorting protein  26.22 
 
 		 243 aa  84.3  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0348  Outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  27.53 
 
 		 236 aa  57.8  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1574  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  24.19 
 
 		 219 aa  57  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.057142  normal  0.0500809 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1599  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  21.64 
 
 		 247 aa  55.1  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1783  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  24.25 
 
 		 208 aa  53.9  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.839422  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0178  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  26.76 
 
 		 207 aa  53.5  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.697529  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6863  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  31.5 
 
 		 258 aa  52.8  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0520741 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2435  outer-membrane lipoprotein carrier protein  25.46 
 
 		 210 aa  52.8  0.000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.699017  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1286  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  25.97 
 
 		 210 aa  52.4  0.000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.699876  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1765  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  23.33 
 
 		 219 aa  52.4  0.000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.455724  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2003  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  28.09 
 
 		 205 aa  51.6  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5362  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  26.89 
 
 		 211 aa  51.2  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3710  putative outer membrane lipoprotein-sorting protein  26.19 
 
 		 264 aa  49.7  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1125  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  25.59 
 
 		 205 aa  48.9  0.00008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.437749 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1669  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  26.67 
 
 		 223 aa  48.9  0.00009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.632485  normal  0.483182 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1935  outer-membrane lipoprotein carrier protein  24.32 
 
 		 212 aa  48.9  0.00009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.765114  normal  0.707119 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0814  outer-membrane lipoprotein carrier protein  23.29 
 
 		 204 aa  48.5  0.0001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000179338  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3210  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  24.77 
 
 		 216 aa  48.5  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.378959  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1577  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  25.9 
 
 		 220 aa  48.5  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0893  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  23.29 
 
 		 238 aa  48.9  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0787284 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3798  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  27.53 
 
 		 238 aa  47.8  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30310  outer-membrane lipoprotein carrier protein  26.77 
 
 		 208 aa  47  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3382  hypothetical protein  23.39 
 
 		 369 aa  47  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000236638  normal  0.0236952 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1826  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  22.14 
 
 		 219 aa  46.6  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.119174  hitchhiker  0.00000680848 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2594  outer-membrane lipoprotein carrier protein  27.48 
 
 		 208 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1729  hypothetical protein  23.39 
 
 		 202 aa  45.4  0.0009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0095  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  21.4 
 
 		 226 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0106  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  21.4 
 
 		 226 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3425  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  25.13 
 
 		 211 aa  45.4  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.936296  normal  0.790188 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1729  hypothetical protein  24.31 
 
 		 202 aa  45.4  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2387  outer-membrane lipoprotein carrier protein  23.04 
 
 		 208 aa  44.3  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0116989 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6264  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  22.34 
 
 		 225 aa  44.3  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.9393  normal  0.236889 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06126  outer-membrane lipoprotein carrier protein  30.86 
 
 		 216 aa  43.9  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.294227  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01040  outer-membrane lipoprotein carrier protein  30.86 
 
 		 216 aa  43.9  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.331194  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0088  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  21.4 
 
 		 228 aa  43.5  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.700906  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3407  outer-membrane lipoprotein carrier protein  23.53 
 
 		 211 aa  42.7  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.315594 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28210  outer-membrane lipoprotein carrier protein  24.88 
 
 		 207 aa  42.7  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.372853  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1711  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  24.29 
 
 		 214 aa  42.7  0.006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.113541  normal  0.724755 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1760  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  22.83 
 
 		 216 aa  42  0.01  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.889402 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1497  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  36 
 
 		 202 aa  42  0.01  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.540106  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>