40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU3202 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3202  hypothetical protein  100 
 
 		 270 aa  546  1e-155  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.146501  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3208  Outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  74.18 
 
 		 272 aa  393  1e-108  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.102941  hitchhiker  0.0000000000001111 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0719  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  54.61 
 
 		 277 aa  306  3e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000737257  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3092  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  40.38 
 
 		 242 aa  175  9e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0120702  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0718  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  36.19 
 
 		 241 aa  171  1e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000504074  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0634  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  36.23 
 
 		 236 aa  170  2e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.64483e-29 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0620  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  35.47 
 
 		 236 aa  168  7e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.130714  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3203  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA, putative  40.08 
 
 		 242 aa  166  4e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.412131  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3207  Outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  38.55 
 
 		 242 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0138209  hitchhiker  0.00000000000000265971 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3197  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  35.98 
 
 		 237 aa  137  1e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0380  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  25.1 
 
 		 229 aa  94.7  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0032  putative outer membrane lipoprotein-sorting protein  29.25 
 
 		 243 aa  80.1  0.00000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1765  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  25.71 
 
 		 219 aa  55.5  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.455724  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1599  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  22.86 
 
 		 247 aa  54.3  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2003  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  28.89 
 
 		 205 aa  53.9  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6863  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  28.67 
 
 		 258 aa  53.5  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0520741 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0348  Outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  25 
 
 		 236 aa  53.5  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1286  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  25.14 
 
 		 210 aa  53.1  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.699876  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1783  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  24.64 
 
 		 208 aa  52  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.839422  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0095  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  24.59 
 
 		 226 aa  50.1  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0106  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  24.59 
 
 		 226 aa  50.1  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0088  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  25.14 
 
 		 228 aa  49.7  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.700906  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2435  outer-membrane lipoprotein carrier protein  25 
 
 		 210 aa  48.1  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.699017  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2594  outer-membrane lipoprotein carrier protein  23.83 
 
 		 208 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30310  outer-membrane lipoprotein carrier protein  23.83 
 
 		 208 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1206  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  22.79 
 
 		 225 aa  46.2  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000867117  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1574  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  23.72 
 
 		 219 aa  46.6  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.057142  normal  0.0500809 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1497  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  25 
 
 		 202 aa  46.2  0.0006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.540106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1125  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  23.19 
 
 		 205 aa  45.8  0.0006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.437749 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1669  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  24.16 
 
 		 223 aa  45.8  0.0008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.632485  normal  0.483182 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1577  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  26.53 
 
 		 220 aa  45.1  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1935  outer-membrane lipoprotein carrier protein  22.6 
 
 		 212 aa  45.4  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.765114  normal  0.707119 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3210  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  23.73 
 
 		 216 aa  44.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.378959  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0178  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  24.41 
 
 		 207 aa  44.3  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.697529  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0090  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  23.37 
 
 		 207 aa  43.5  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.227988  normal  0.252414 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2387  outer-membrane lipoprotein carrier protein  22.64 
 
 		 208 aa  43.5  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0116989 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1121  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  25 
 
 		 203 aa  43.5  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.310503  normal  0.176319 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3425  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  23.6 
 
 		 211 aa  43.1  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.936296  normal  0.790188 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0814  outer-membrane lipoprotein carrier protein  21.69 
 
 		 204 aa  43.1  0.005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000179338  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28210  outer-membrane lipoprotein carrier protein  21.8 
 
 		 207 aa  42.4  0.007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.372853  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>