25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0719 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_0719  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  100 
 
 		 277 aa  567  1e-161  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000737257  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3202  hypothetical protein  54.61 
 
 		 270 aa  306  3e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.146501  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3208  Outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  60.55 
 
 		 272 aa  305  5.0000000000000004e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.102941  hitchhiker  0.0000000000001111 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0620  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  36.03 
 
 		 236 aa  167  2e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.130714  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0634  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  36.4 
 
 		 236 aa  166  5e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.64483e-29 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3203  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA, putative  34.78 
 
 		 242 aa  154  2e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.412131  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0718  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  31.34 
 
 		 241 aa  149  5e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000504074  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3092  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  34.7 
 
 		 242 aa  149  7e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0120702  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3207  Outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  32.97 
 
 		 242 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0138209  hitchhiker  0.00000000000000265971 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3197  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  30 
 
 		 237 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0032  putative outer membrane lipoprotein-sorting protein  27.64 
 
 		 243 aa  93.6  4e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0380  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  21.43 
 
 		 229 aa  71.2  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1599  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  23.68 
 
 		 247 aa  56.6  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6863  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  28.25 
 
 		 258 aa  56.2  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0520741 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3710  putative outer membrane lipoprotein-sorting protein  25.23 
 
 		 264 aa  51.6  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1286  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  22.34 
 
 		 210 aa  50.8  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.699876  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1125  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  22.59 
 
 		 205 aa  47.8  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.437749 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1711  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  22.82 
 
 		 214 aa  46.2  0.0006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.113541  normal  0.724755 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3601  putative outer membrane lipoprotein-sorting protein  24.54 
 
 		 264 aa  45.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1783  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  23.48 
 
 		 208 aa  45.1  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.839422  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1206  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  21.11 
 
 		 225 aa  44.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000867117  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0547  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  25.28 
 
 		 230 aa  43.5  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.117593  hitchhiker  0.000046415 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0377  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA, putative  25.28 
 
 		 230 aa  43.5  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.365354  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3064  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  26.12 
 
 		 220 aa  43.5  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00368747 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0814  outer-membrane lipoprotein carrier protein  25.96 
 
 		 204 aa  42.7  0.007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000179338  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>