89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3382 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3382  hypothetical protein  100 
 
 		 369 aa  753    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000236638  normal  0.0236952 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0235  hypothetical protein  33.7 
 
 		 360 aa  243  3e-63  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.129282  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1446  hypothetical protein  35.88 
 
 		 392 aa  200  3e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.950641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0128  hypothetical protein  32.31 
 
 		 334 aa  145  9e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.112171  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1824  hypothetical protein  38.04 
 
 		 186 aa  117  3e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.136936  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1750  Outer membrane lipoprotein-sorting protein-like protein  26.56 
 
 		 362 aa  117  5e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3379  hypothetical protein  30.4 
 
 		 222 aa  98.6  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000316854  hitchhiker  0.00980308 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2626  hypothetical protein  21.7 
 
 		 385 aa  86.7  6e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000023102  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1553  hypothetical protein  26.41 
 
 		 239 aa  62.4  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0366  hypothetical protein  23.08 
 
 		 253 aa  58.5  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0102  Outer membrane lipoprotein-sorting protein-like protein  24.52 
 
 		 258 aa  57  0.0000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1286  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  28.14 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.699876  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3177  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  26.51 
 
 		 213 aa  55.8  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1251  hypothetical protein  26.7 
 
 		 263 aa  53.9  0.000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.309853  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1553  hypothetical protein  25.85 
 
 		 357 aa  53.1  0.000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0165231  hitchhiker  0.00912158 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1121  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  26.2 
 
 		 203 aa  53.1  0.000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.310503  normal  0.176319 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5362  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  23.21 
 
 		 211 aa  53.1  0.000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1428  hypothetical protein  26.2 
 
 		 267 aa  53.1  0.000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.906524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3381  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  26.35 
 
 		 210 aa  52.8  0.000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.23519 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2719  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  26.35 
 
 		 212 aa  53.1  0.000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.72131  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0634  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  26.85 
 
 		 236 aa  52  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.64483e-29 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3210  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  25.88 
 
 		 216 aa  52.8  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.378959  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3424  Outer membrane lipoprotein-sorting protein-like protein  26.22 
 
 		 381 aa  50.8  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.272957 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3601  putative outer membrane lipoprotein-sorting protein  18.29 
 
 		 264 aa  50.8  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1760  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  22.91 
 
 		 216 aa  50.4  0.00005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.889402 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1734  hypothetical protein  28.81 
 
 		 282 aa  50.1  0.00006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.199034  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28210  outer-membrane lipoprotein carrier protein  23.31 
 
 		 207 aa  50.1  0.00006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.372853  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0620  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  27.03 
 
 		 236 aa  49.7  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.130714  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3425  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  25.3 
 
 		 211 aa  49.7  0.00008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.936296  normal  0.790188 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0380  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  26.32 
 
 		 229 aa  49.7  0.00008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1041  Outer membrane lipoprotein-sorting protein-like protein  25.61 
 
 		 262 aa  49.3  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1593  hypothetical protein  24.49 
 
 		 371 aa  49.3  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0146  hypothetical protein  27.27 
 
 		 157 aa  48.9  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3710  putative outer membrane lipoprotein-sorting protein  20.73 
 
 		 264 aa  49.3  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2533  hypothetical protein  24.56 
 
 		 264 aa  49.3  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.154061  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1684  outer-membrane lipoprotein carrier protein  27.72 
 
 		 203 aa  48.5  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.146126 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0398  hypothetical protein  25.44 
 
 		 393 aa  48.5  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0805  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  20.99 
 
 		 234 aa  48.1  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.391961  normal  0.496775 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2684  outer-membrane lipoprotein carrier protein  31.25 
 
 		 202 aa  47.8  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.272207  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1614  outer-membrane lipoprotein carrier protein  31.25 
 
 		 202 aa  47.8  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.154829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2595  outer-membrane lipoprotein carrier protein  31.25 
 
 		 202 aa  47.8  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00615115  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3092  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  21.01 
 
 		 242 aa  47.8  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0120702  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0718  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  22.88 
 
 		 241 aa  47.4  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000504074  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3207  Outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  26.25 
 
 		 242 aa  47.4  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0138209  hitchhiker  0.00000000000000265971 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1751  hypothetical protein  19.6 
 
 		 389 aa  47  0.0005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0032  putative outer membrane lipoprotein-sorting protein  21.43 
 
 		 243 aa  47  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2390  hypothetical protein  26.67 
 
 		 265 aa  47  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.564137  normal  0.698775 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1206  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  26.4 
 
 		 225 aa  47  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000867117  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1293  hypothetical protein  23.23 
 
 		 416 aa  47  0.0006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.896512  hitchhiker  0.00148296 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3208  Outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  23.39 
 
 		 272 aa  47  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.102941  hitchhiker  0.0000000000001111 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1125  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  26.29 
 
 		 205 aa  46.6  0.0007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.437749 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2387  outer-membrane lipoprotein carrier protein  22.86 
 
 		 208 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0116989 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1765  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  23.84 
 
 		 219 aa  46.6  0.0007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.455724  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2229  outer-membrane lipoprotein carrier protein  39.29 
 
 		 203 aa  45.4  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.583755  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00895  outer-membrane lipoprotein carrier protein precursor  39.29 
 
 		 204 aa  45.4  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.169529  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2752  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  39.29 
 
 		 203 aa  45.4  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000100398  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001463  outer membrane lipoprotein-sorting protein  23.93 
 
 		 248 aa  45.8  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0814  outer-membrane lipoprotein carrier protein  25.95 
 
 		 204 aa  45.8  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000179338  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1720  outer-membrane lipoprotein carrier protein  26.23 
 
 		 203 aa  45.8  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00902  hypothetical protein  39.29 
 
 		 204 aa  45.4  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214105  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1807  hypothetical protein  27.46 
 
 		 554 aa  45.8  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1053  outer-membrane lipoprotein carrier protein  39.29 
 
 		 203 aa  45.4  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0514291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2705  outer-membrane lipoprotein carrier protein  39.29 
 
 		 203 aa  45.4  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0180788  normal  0.777132 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0996  outer-membrane lipoprotein carrier protein  39.29 
 
 		 203 aa  45.4  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00638939  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0966  outer-membrane lipoprotein carrier protein  39.29 
 
 		 203 aa  45.4  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.015889  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2437  outer-membrane lipoprotein carrier protein  39.29 
 
 		 203 aa  45.4  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0718725  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1428  hypothetical protein  18.97 
 
 		 382 aa  45.1  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1415  outer-membrane lipoprotein carrier protein  26.92 
 
 		 204 aa  45.4  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.560758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1419  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  22.44 
 
 		 225 aa  44.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.174012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0857  hypothetical protein  27.42 
 
 		 395 aa  45.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.583299  normal  0.0121379 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3198  hypothetical protein  22.58 
 
 		 255 aa  44.7  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1026  outer-membrane lipoprotein carrier protein  37.5 
 
 		 203 aa  44.3  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2435  outer-membrane lipoprotein carrier protein  24.62 
 
 		 210 aa  44.3  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.699017  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0995  outer-membrane lipoprotein carrier protein  37.5 
 
 		 203 aa  44.3  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1060  outer-membrane lipoprotein carrier protein  37.5 
 
 		 203 aa  44.3  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1075  outer-membrane lipoprotein carrier protein  37.5 
 
 		 203 aa  44.3  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2259  outer-membrane lipoprotein carrier protein  29.89 
 
 		 204 aa  43.9  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.409405  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0966  outer-membrane lipoprotein carrier protein  37.5 
 
 		 203 aa  44.3  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0187172  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30310  outer-membrane lipoprotein carrier protein  22.27 
 
 		 208 aa  43.5  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05400  hypothetical protein  24.44 
 
 		 240 aa  43.5  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1296  Outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  21.99 
 
 		 208 aa  43.5  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.435605 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0370  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  24.73 
 
 		 233 aa  43.1  0.007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0721614 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1661  hypothetical protein  22.28 
 
 		 257 aa  43.1  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.612075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1988  outer-membrane lipoprotein carrier protein  26.05 
 
 		 203 aa  43.1  0.008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.937867  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5301  hypothetical protein  22.28 
 
 		 257 aa  43.1  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.457246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1669  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  22.16 
 
 		 223 aa  42.7  0.009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.632485  normal  0.483182 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0757  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  22.83 
 
 		 212 aa  42.7  0.009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000775377 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2359  outer-membrane lipoprotein carrier protein  31.03 
 
 		 204 aa  42.7  0.01  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.328226  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1678  outer membrane lipoprotein carrier protein LolA  22.52 
 
 		 212 aa  42.7  0.01  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>