38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I1251 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I1251  hypothetical protein  100 
 
 		 263 aa  535  1e-151  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.309853  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1428  hypothetical protein  57.14 
 
 		 267 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.906524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3198  hypothetical protein  57.87 
 
 		 255 aa  298  5e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2661  hypothetical protein  54.08 
 
 		 270 aa  279  3e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001463  outer membrane lipoprotein-sorting protein  59.21 
 
 		 248 aa  270  1e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05400  hypothetical protein  59.4 
 
 		 240 aa  269  4e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5301  hypothetical protein  34.27 
 
 		 257 aa  164  9e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.457246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1661  hypothetical protein  34.27 
 
 		 257 aa  164  9e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.612075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2496  hypothetical protein  32.02 
 
 		 262 aa  145  5e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2533  hypothetical protein  31.02 
 
 		 264 aa  138  1e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.154061  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0436  hypothetical protein  30.43 
 
 		 260 aa  132  6.999999999999999e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0378114  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5043  hypothetical protein  33.03 
 
 		 247 aa  130  3e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2372  hypothetical protein  28.24 
 
 		 250 aa  121  9.999999999999999e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000349314  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2390  hypothetical protein  28.29 
 
 		 265 aa  79.7  0.00000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.564137  normal  0.698775 
 
 
-
 
NC_002950  PG1179  hypothetical protein  26.15 
 
 		 263 aa  77.4  0.0000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0366  hypothetical protein  23.94 
 
 		 253 aa  76.3  0.0000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2902  hypothetical protein  22.58 
 
 		 243 aa  74.7  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0902383 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23220  putative sigma E regulatory protein, MucB/RseB  27.81 
 
 		 248 aa  75.1  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000142114  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2009  hypothetical protein  25.43 
 
 		 261 aa  72.4  0.000000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08460  hypothetical protein  24.67 
 
 		 262 aa  70.5  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1316  hypothetical protein  23.08 
 
 		 273 aa  67  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0910605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3286  hypothetical protein  29.76 
 
 		 267 aa  63.5  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0396  hypothetical protein  23.55 
 
 		 279 aa  62.4  0.000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000270968  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0539  hypothetical protein  26.6 
 
 		 269 aa  56.6  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0806  hypothetical protein  25.15 
 
 		 1083 aa  56.2  0.0000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.712772  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003708  outer membrane lipoprotein-sorting protein  21.48 
 
 		 263 aa  55.5  0.0000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.212614  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1322  von Willebrand factor, type A  25.28 
 
 		 266 aa  54.7  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3382  hypothetical protein  26.7 
 
 		 369 aa  53.9  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000236638  normal  0.0236952 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1800  hypothetical protein  23.69 
 
 		 241 aa  53.9  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.73611  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2021  hypothetical protein  25.62 
 
 		 238 aa  52  0.000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000720382  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1653  hypothetical protein  23 
 
 		 266 aa  47.8  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.561802  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2703  hypothetical protein  20.93 
 
 		 261 aa  47.8  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2743  putative outer membrane protein  23.56 
 
 		 284 aa  46.6  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2786  hypothetical protein  20.45 
 
 		 278 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.402012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2969  putative sigma E regulatory protein, MucB/RseB  20.45 
 
 		 278 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2986  RND efflux transporter  21.56 
 
 		 1051 aa  43.9  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.594238  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0498  hypothetical protein  26.61 
 
 		 258 aa  42.4  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.432294 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0454  hypothetical protein  24.07 
 
 		 268 aa  42.4  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>