47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0396 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0396  hypothetical protein  100 
 
 		 279 aa  579  1e-164  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000270968  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1316  hypothetical protein  38.8 
 
 		 273 aa  201  8e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0910605  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1179  hypothetical protein  39.63 
 
 		 263 aa  179  4.999999999999999e-44  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2009  hypothetical protein  33.05 
 
 		 261 aa  147  1.0000000000000001e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0806  hypothetical protein  29.2 
 
 		 1083 aa  135  7.000000000000001e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.712772  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1515  hypothetical protein  29.21 
 
 		 268 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.74653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1659  hypothetical protein  30.8 
 
 		 270 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0454  hypothetical protein  30.74 
 
 		 268 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1322  von Willebrand factor, type A  33.21 
 
 		 266 aa  125  1e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0435  hypothetical protein  30.77 
 
 		 268 aa  125  1e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2703  hypothetical protein  31.56 
 
 		 261 aa  124  2e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003708  outer membrane lipoprotein-sorting protein  34.22 
 
 		 263 aa  121  9.999999999999999e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.212614  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2225  hypothetical protein  28.63 
 
 		 264 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2002  hypothetical protein  29.23 
 
 		 277 aa  116  3.9999999999999997e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.465014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0152  hypothetical protein  29.7 
 
 		 269 aa  115  6.9999999999999995e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2969  putative sigma E regulatory protein, MucB/RseB  30.29 
 
 		 278 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2786  hypothetical protein  30.29 
 
 		 278 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.402012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1528  hypothetical protein  30.08 
 
 		 273 aa  110  3e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.676069  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2986  RND efflux transporter  27.94 
 
 		 1051 aa  105  8e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.594238  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1653  hypothetical protein  36.87 
 
 		 266 aa  105  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.561802  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08460  hypothetical protein  29.15 
 
 		 262 aa  95.9  7e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1941  hypothetical protein  27.11 
 
 		 277 aa  92.4  7e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.143192  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0959  hypothetical protein  26.64 
 
 		 290 aa  91.3  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0468  hypothetical protein  25.74 
 
 		 257 aa  90.5  2e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0539  hypothetical protein  30.64 
 
 		 269 aa  90.5  3e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0676  hypothetical protein  29.49 
 
 		 271 aa  85.1  0.000000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.860563 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0210  hypothetical protein  27.38 
 
 		 268 aa  84.7  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.892318  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0634  hypothetical protein  26.67 
 
 		 268 aa  84.3  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.71934  normal  0.575914 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1423  putative outer membrane protein  27.88 
 
 		 281 aa  81.6  0.00000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0426224  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5301  hypothetical protein  22.56 
 
 		 257 aa  79  0.00000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.457246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1661  hypothetical protein  22.56 
 
 		 257 aa  79  0.00000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.612075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2743  putative outer membrane protein  29.59 
 
 		 284 aa  73.2  0.000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3198  hypothetical protein  23.25 
 
 		 255 aa  69.3  0.00000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1251  hypothetical protein  23.55 
 
 		 263 aa  67  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.309853  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23220  putative sigma E regulatory protein, MucB/RseB  23.73 
 
 		 248 aa  65.9  0.0000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000142114  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2533  hypothetical protein  23.49 
 
 		 264 aa  63.5  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.154061  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2902  hypothetical protein  23.2 
 
 		 243 aa  63.5  0.000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0902383 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0436  hypothetical protein  22.58 
 
 		 260 aa  60.8  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0378114  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05400  hypothetical protein  27.54 
 
 		 240 aa  60.1  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1428  hypothetical protein  24.07 
 
 		 267 aa  58.5  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.906524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001463  outer membrane lipoprotein-sorting protein  26.24 
 
 		 248 aa  55.8  0.0000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1019  hypothetical protein  32.71 
 
 		 254 aa  55.8  0.0000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.353251  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2661  hypothetical protein  24.16 
 
 		 270 aa  49.3  0.00006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2496  hypothetical protein  23.99 
 
 		 262 aa  47.4  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2372  hypothetical protein  23.95 
 
 		 250 aa  47  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000349314  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5043  hypothetical protein  24.1 
 
 		 247 aa  45.1  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2547  hypothetical protein  37.31 
 
 		 434 aa  44.7  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.119051  normal  0.289813 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>