47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3198 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3198  hypothetical protein  100 
 
 		 255 aa  520  1e-147  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1428  hypothetical protein  78.88 
 
 		 267 aa  392  1e-108  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.906524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2661  hypothetical protein  75.32 
 
 		 270 aa  374  1e-102  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05400  hypothetical protein  77.08 
 
 		 240 aa  367  1e-101  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001463  outer membrane lipoprotein-sorting protein  75.62 
 
 		 248 aa  367  1e-100  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1251  hypothetical protein  57.87 
 
 		 263 aa  298  5e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.309853  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5301  hypothetical protein  37.45 
 
 		 257 aa  185  6e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.457246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1661  hypothetical protein  37.45 
 
 		 257 aa  185  6e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.612075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2496  hypothetical protein  36.59 
 
 		 262 aa  170  2e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5043  hypothetical protein  37.5 
 
 		 247 aa  167  2e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2533  hypothetical protein  34.39 
 
 		 264 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.154061  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0436  hypothetical protein  35.04 
 
 		 260 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0378114  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2372  hypothetical protein  33.74 
 
 		 250 aa  158  9e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000349314  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23220  putative sigma E regulatory protein, MucB/RseB  28.81 
 
 		 248 aa  93.2  4e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000142114  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2902  hypothetical protein  24.67 
 
 		 243 aa  85.9  5e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0902383 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08460  hypothetical protein  27.23 
 
 		 262 aa  82  0.000000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1179  hypothetical protein  26.88 
 
 		 263 aa  78.2  0.0000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003708  outer membrane lipoprotein-sorting protein  26.74 
 
 		 263 aa  77  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.212614  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2009  hypothetical protein  27.37 
 
 		 261 aa  75.1  0.000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2390  hypothetical protein  24.23 
 
 		 265 aa  71.6  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.564137  normal  0.698775 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1316  hypothetical protein  22.82 
 
 		 273 aa  70.9  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0910605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0366  hypothetical protein  21.57 
 
 		 253 aa  68.6  0.00000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3286  hypothetical protein  24.19 
 
 		 267 aa  68.2  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1800  hypothetical protein  26.6 
 
 		 241 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.73611  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0396  hypothetical protein  23.62 
 
 		 279 aa  67.8  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000270968  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2986  RND efflux transporter  22.08 
 
 		 1051 aa  62  0.000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.594238  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0539  hypothetical protein  24.12 
 
 		 269 aa  60.8  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2021  hypothetical protein  24.88 
 
 		 238 aa  60.1  0.00000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000720382  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2703  hypothetical protein  24.72 
 
 		 261 aa  60.1  0.00000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2225  hypothetical protein  23.53 
 
 		 264 aa  57.4  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1653  hypothetical protein  25 
 
 		 266 aa  57.8  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.561802  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1322  von Willebrand factor, type A  22.01 
 
 		 266 aa  55.8  0.0000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0468  hypothetical protein  25 
 
 		 257 aa  55.1  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2002  hypothetical protein  21.28 
 
 		 277 aa  52.4  0.000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.465014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2544  hypothetical protein  23.66 
 
 		 275 aa  51.2  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.770236  normal  0.684927 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1423  putative outer membrane protein  22.42 
 
 		 281 aa  50.1  0.00004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0426224  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1941  hypothetical protein  19.77 
 
 		 277 aa  49.7  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.143192  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0435  hypothetical protein  27.66 
 
 		 268 aa  49.3  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0676  hypothetical protein  23.71 
 
 		 271 aa  48.5  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.860563 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2743  putative outer membrane protein  23.15 
 
 		 284 aa  47.8  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0454  hypothetical protein  27.13 
 
 		 268 aa  47  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2786  hypothetical protein  22.09 
 
 		 278 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.402012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0210  hypothetical protein  18.62 
 
 		 268 aa  45.4  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.892318  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0806  hypothetical protein  21.05 
 
 		 1083 aa  45.1  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.712772  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2969  putative sigma E regulatory protein, MucB/RseB  22.09 
 
 		 278 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3382  hypothetical protein  22.58 
 
 		 369 aa  44.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000236638  normal  0.0236952 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1659  hypothetical protein  24.04 
 
 		 270 aa  42.4  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>