38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0468 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0468  hypothetical protein  100 
 
 		 257 aa  520  1e-146  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1179  hypothetical protein  29.92 
 
 		 263 aa  103  2e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2703  hypothetical protein  33.08 
 
 		 261 aa  95.9  5e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2009  hypothetical protein  36.07 
 
 		 261 aa  88.2  1e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08460  hypothetical protein  25.1 
 
 		 262 aa  87.4  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003708  outer membrane lipoprotein-sorting protein  33.52 
 
 		 263 aa  85.9  6e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.212614  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0396  hypothetical protein  25.74 
 
 		 279 aa  84  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000270968  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1659  hypothetical protein  30.86 
 
 		 270 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23220  putative sigma E regulatory protein, MucB/RseB  30.04 
 
 		 248 aa  80.1  0.00000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000142114  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2225  hypothetical protein  26.46 
 
 		 264 aa  79.3  0.00000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1515  hypothetical protein  30.27 
 
 		 268 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.74653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0152  hypothetical protein  24.46 
 
 		 269 aa  76.3  0.0000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0454  hypothetical protein  25.1 
 
 		 268 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0435  hypothetical protein  27.51 
 
 		 268 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0634  hypothetical protein  24.1 
 
 		 268 aa  72.8  0.000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.71934  normal  0.575914 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1322  von Willebrand factor, type A  28.33 
 
 		 266 aa  71.6  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1653  hypothetical protein  33.08 
 
 		 266 aa  69.3  0.00000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.561802  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0806  hypothetical protein  27.72 
 
 		 1083 aa  67.8  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.712772  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0676  hypothetical protein  25.58 
 
 		 271 aa  65.9  0.0000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.860563 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5301  hypothetical protein  27.13 
 
 		 257 aa  64.7  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.457246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1661  hypothetical protein  27.13 
 
 		 257 aa  64.7  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.612075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1528  hypothetical protein  23.91 
 
 		 273 aa  63.2  0.000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.676069  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2002  hypothetical protein  25.7 
 
 		 277 aa  61.6  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.465014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2743  putative outer membrane protein  25.94 
 
 		 284 aa  61.6  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2986  RND efflux transporter  24.49 
 
 		 1051 aa  60.8  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.594238  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1316  hypothetical protein  25.73 
 
 		 273 aa  60.1  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0910605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1423  putative outer membrane protein  26.11 
 
 		 281 aa  58.9  0.00000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0426224  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001463  outer membrane lipoprotein-sorting protein  24.46 
 
 		 248 aa  55.8  0.0000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0210  hypothetical protein  21.61 
 
 		 268 aa  55.5  0.0000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.892318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3198  hypothetical protein  25 
 
 		 255 aa  55.1  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2533  hypothetical protein  23.77 
 
 		 264 aa  54.3  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.154061  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05400  hypothetical protein  26.67 
 
 		 240 aa  53.5  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2902  hypothetical protein  24.55 
 
 		 243 aa  51.6  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0902383 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1428  hypothetical protein  25.32 
 
 		 267 aa  48.5  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.906524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2969  putative sigma E regulatory protein, MucB/RseB  21.83 
 
 		 278 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2786  hypothetical protein  21.83 
 
 		 278 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.402012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0539  hypothetical protein  27.74 
 
 		 269 aa  46.2  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3286  hypothetical protein  25 
 
 		 267 aa  42.4  0.008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>