42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0634 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_0634  hypothetical protein  100 
 
 		 268 aa  541  1e-153  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.71934  normal  0.575914 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0152  hypothetical protein  53.41 
 
 		 269 aa  264  1e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1528  hypothetical protein  49.41 
 
 		 273 aa  241  7e-63  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.676069  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2225  hypothetical protein  36.56 
 
 		 264 aa  149  4e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0454  hypothetical protein  31.47 
 
 		 268 aa  126  3e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0435  hypothetical protein  30.49 
 
 		 268 aa  123  4e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1515  hypothetical protein  31.6 
 
 		 268 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.74653  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1179  hypothetical protein  32.49 
 
 		 263 aa  120  1.9999999999999998e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1659  hypothetical protein  30.77 
 
 		 270 aa  119  6e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2703  hypothetical protein  26.74 
 
 		 261 aa  115  1.0000000000000001e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2009  hypothetical protein  29.44 
 
 		 261 aa  109  6e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1322  von Willebrand factor, type A  28.19 
 
 		 266 aa  108  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0210  hypothetical protein  31.47 
 
 		 268 aa  107  2e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.892318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2002  hypothetical protein  30.19 
 
 		 277 aa  104  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.465014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003708  outer membrane lipoprotein-sorting protein  27.6 
 
 		 263 aa  100  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.212614  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1653  hypothetical protein  32.98 
 
 		 266 aa  99.8  4e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.561802  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2743  putative outer membrane protein  31.15 
 
 		 284 aa  96.3  5e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08460  hypothetical protein  28.77 
 
 		 262 aa  95.5  9e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0676  hypothetical protein  33.91 
 
 		 271 aa  90.1  3e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.860563 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2986  RND efflux transporter  32.21 
 
 		 1051 aa  90.1  3e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.594238  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0959  hypothetical protein  27.94 
 
 		 290 aa  85.5  8e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1316  hypothetical protein  28.22 
 
 		 273 aa  84  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0910605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1941  hypothetical protein  27.35 
 
 		 277 aa  79.3  0.00000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.143192  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0396  hypothetical protein  26.67 
 
 		 279 aa  77  0.0000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000270968  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1423  putative outer membrane protein  28.44 
 
 		 281 aa  76.3  0.0000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0426224  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0806  hypothetical protein  27.39 
 
 		 1083 aa  74.3  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.712772  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0539  hypothetical protein  28.72 
 
 		 269 aa  73.6  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0468  hypothetical protein  24.1 
 
 		 257 aa  72.8  0.000000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1661  hypothetical protein  29.52 
 
 		 257 aa  72  0.000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.612075  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5301  hypothetical protein  29.52 
 
 		 257 aa  72  0.000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.457246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2969  putative sigma E regulatory protein, MucB/RseB  25.42 
 
 		 278 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2786  hypothetical protein  25.42 
 
 		 278 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.402012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2533  hypothetical protein  28.12 
 
 		 264 aa  65.1  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.154061  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1019  hypothetical protein  24.71 
 
 		 254 aa  61.6  0.00000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.353251  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2902  hypothetical protein  26.55 
 
 		 243 aa  48.9  0.00008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0902383 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23220  putative sigma E regulatory protein, MucB/RseB  22.01 
 
 		 248 aa  48.9  0.00008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000142114  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2661  hypothetical protein  22.93 
 
 		 270 aa  48.5  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2547  hypothetical protein  28.21 
 
 		 434 aa  47.4  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.119051  normal  0.289813 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4078  hypothetical protein  29.13 
 
 		 261 aa  43.5  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.419356  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2372  hypothetical protein  28.21 
 
 		 250 aa  43.1  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000349314  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3936  hypothetical protein  28.7 
 
 		 261 aa  42  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4045  hypothetical protein  28.7 
 
 		 261 aa  42  0.01  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>