41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1528 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_1528  hypothetical protein  100 
 
 		 273 aa  545  1e-154  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.676069  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0152  hypothetical protein  57.63 
 
 		 269 aa  289  3e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0634  hypothetical protein  49.41 
 
 		 268 aa  241  7e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.71934  normal  0.575914 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2225  hypothetical protein  38.14 
 
 		 264 aa  163  3e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0210  hypothetical protein  33.59 
 
 		 268 aa  123  4e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.892318  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1179  hypothetical protein  27.63 
 
 		 263 aa  117  3e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1322  von Willebrand factor, type A  30.47 
 
 		 266 aa  113  3e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003708  outer membrane lipoprotein-sorting protein  29.73 
 
 		 263 aa  112  6e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.212614  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1653  hypothetical protein  31.63 
 
 		 266 aa  109  5e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.561802  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08460  hypothetical protein  29.26 
 
 		 262 aa  107  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2009  hypothetical protein  27.71 
 
 		 261 aa  105  6e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1515  hypothetical protein  27.38 
 
 		 268 aa  105  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.74653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1659  hypothetical protein  31.91 
 
 		 270 aa  104  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2703  hypothetical protein  25.68 
 
 		 261 aa  103  4e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0454  hypothetical protein  30.85 
 
 		 268 aa  102  6e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0435  hypothetical protein  30.85 
 
 		 268 aa  101  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2743  putative outer membrane protein  31.98 
 
 		 284 aa  98.6  1e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0396  hypothetical protein  29.7 
 
 		 279 aa  96.7  4e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000270968  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2002  hypothetical protein  29.73 
 
 		 277 aa  95.5  8e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.465014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1941  hypothetical protein  25.18 
 
 		 277 aa  93.6  4e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.143192  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2986  RND efflux transporter  29.11 
 
 		 1051 aa  90.1  3e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.594238  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1423  putative outer membrane protein  28.51 
 
 		 281 aa  87  3e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0426224  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0959  hypothetical protein  27.34 
 
 		 290 aa  84  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0539  hypothetical protein  30.21 
 
 		 269 aa  83.6  0.000000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1316  hypothetical protein  27.73 
 
 		 273 aa  82.8  0.000000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0910605  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0806  hypothetical protein  26.94 
 
 		 1083 aa  79.7  0.00000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.712772  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0676  hypothetical protein  28.51 
 
 		 271 aa  76.6  0.0000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.860563 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1019  hypothetical protein  22.53 
 
 		 254 aa  71.2  0.00000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.353251  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2786  hypothetical protein  23.33 
 
 		 278 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.402012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2969  putative sigma E regulatory protein, MucB/RseB  23.33 
 
 		 278 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0468  hypothetical protein  23.91 
 
 		 257 aa  63.2  0.000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1661  hypothetical protein  24.32 
 
 		 257 aa  54.7  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.612075  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5301  hypothetical protein  24.32 
 
 		 257 aa  54.7  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.457246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2661  hypothetical protein  21.23 
 
 		 270 aa  51.2  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0436  hypothetical protein  26.97 
 
 		 260 aa  50.4  0.00003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0378114  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2533  hypothetical protein  25.97 
 
 		 264 aa  50.1  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.154061  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1428  hypothetical protein  22.35 
 
 		 267 aa  47.8  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.906524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23220  putative sigma E regulatory protein, MucB/RseB  21.98 
 
 		 248 aa  47.8  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000142114  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5043  hypothetical protein  22.73 
 
 		 247 aa  46.2  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2902  hypothetical protein  25.17 
 
 		 243 aa  42.7  0.007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0902383 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001463  outer membrane lipoprotein-sorting protein  22.9 
 
 		 248 aa  42  0.01  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>