47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2002 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2002  hypothetical protein  100 
 
 		 277 aa  573  1.0000000000000001e-162  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.465014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003708  outer membrane lipoprotein-sorting protein  49.43 
 
 		 263 aa  266  2.9999999999999995e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.212614  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1653  hypothetical protein  54.55 
 
 		 266 aa  266  2.9999999999999995e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.561802  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0539  hypothetical protein  50.78 
 
 		 269 aa  264  1e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0676  hypothetical protein  47.58 
 
 		 271 aa  255  6e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.860563 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1322  von Willebrand factor, type A  45.69 
 
 		 266 aa  241  7.999999999999999e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1179  hypothetical protein  31.44 
 
 		 263 aa  121  9.999999999999999e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2986  RND efflux transporter  31.25 
 
 		 1051 aa  114  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.594238  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2009  hypothetical protein  27.98 
 
 		 261 aa  108  9.000000000000001e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0396  hypothetical protein  28.87 
 
 		 279 aa  108  1e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000270968  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0634  hypothetical protein  30.19 
 
 		 268 aa  104  2e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.71934  normal  0.575914 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2703  hypothetical protein  28.77 
 
 		 261 aa  97.8  2e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0806  hypothetical protein  27.78 
 
 		 1083 aa  97.1  3e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.712772  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2225  hypothetical protein  27.89 
 
 		 264 aa  96.7  4e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0152  hypothetical protein  29.01 
 
 		 269 aa  95.9  6e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1528  hypothetical protein  29.73 
 
 		 273 aa  95.5  9e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.676069  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1941  hypothetical protein  25.86 
 
 		 277 aa  94  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.143192  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2969  putative sigma E regulatory protein, MucB/RseB  24.05 
 
 		 278 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2786  hypothetical protein  24.05 
 
 		 278 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.402012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1316  hypothetical protein  26.05 
 
 		 273 aa  86.7  4e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0910605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0210  hypothetical protein  25.48 
 
 		 268 aa  84  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.892318  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08460  hypothetical protein  27.85 
 
 		 262 aa  78.2  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2743  putative outer membrane protein  24.66 
 
 		 284 aa  76.3  0.0000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1659  hypothetical protein  25.95 
 
 		 270 aa  75.9  0.0000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0435  hypothetical protein  25.4 
 
 		 268 aa  73.6  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1515  hypothetical protein  26.06 
 
 		 268 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.74653  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0454  hypothetical protein  25.4 
 
 		 268 aa  72  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1423  putative outer membrane protein  23.74 
 
 		 281 aa  70.9  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0426224  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1428  hypothetical protein  24.06 
 
 		 267 aa  65.5  0.0000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.906524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0959  hypothetical protein  26.64 
 
 		 290 aa  65.5  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0468  hypothetical protein  25.7 
 
 		 257 aa  61.6  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5301  hypothetical protein  25.16 
 
 		 257 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.457246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1661  hypothetical protein  25.16 
 
 		 257 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.612075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2902  hypothetical protein  23.75 
 
 		 243 aa  57  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0902383 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2496  hypothetical protein  27.23 
 
 		 262 aa  55.8  0.0000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2533  hypothetical protein  25 
 
 		 264 aa  54.7  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.154061  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2661  hypothetical protein  21.23 
 
 		 270 aa  52.8  0.000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3198  hypothetical protein  21.28 
 
 		 255 aa  52.4  0.000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1019  hypothetical protein  26.55 
 
 		 254 aa  52  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.353251  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23220  putative sigma E regulatory protein, MucB/RseB  23 
 
 		 248 aa  49.3  0.00007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000142114  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001463  outer membrane lipoprotein-sorting protein  24.46 
 
 		 248 aa  48.9  0.00008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05400  hypothetical protein  23.48 
 
 		 240 aa  47  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0366  hypothetical protein  24.38 
 
 		 253 aa  45.8  0.0008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2390  hypothetical protein  25.35 
 
 		 265 aa  45.8  0.0009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.564137  normal  0.698775 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0436  hypothetical protein  22.9 
 
 		 260 aa  45.4  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0378114  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3286  hypothetical protein  24.86 
 
 		 267 aa  44.3  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2544  hypothetical protein  22.16 
 
 		 275 aa  43.5  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.770236  normal  0.684927 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>