45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_2743 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_2743  putative outer membrane protein  100 
 
 		 284 aa  573  1.0000000000000001e-162  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1423  putative outer membrane protein  78.81 
 
 		 281 aa  378  1e-104  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0426224  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0210  hypothetical protein  50 
 
 		 268 aa  246  4e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.892318  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1941  hypothetical protein  43.43 
 
 		 277 aa  222  6e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.143192  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0152  hypothetical protein  31.18 
 
 		 269 aa  112  9e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2009  hypothetical protein  26.38 
 
 		 261 aa  107  3e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1179  hypothetical protein  28.14 
 
 		 263 aa  103  3e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1528  hypothetical protein  29.74 
 
 		 273 aa  102  1e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.676069  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0634  hypothetical protein  31.82 
 
 		 268 aa  99.4  6e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.71934  normal  0.575914 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2703  hypothetical protein  26.67 
 
 		 261 aa  98.6  1e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2225  hypothetical protein  25.7 
 
 		 264 aa  97.1  3e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2986  RND efflux transporter  26.18 
 
 		 1051 aa  96.7  4e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.594238  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003708  outer membrane lipoprotein-sorting protein  26.72 
 
 		 263 aa  96.7  4e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.212614  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08460  hypothetical protein  27.91 
 
 		 262 aa  96.3  5e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0806  hypothetical protein  27.62 
 
 		 1083 aa  95.5  9e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.712772  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0454  hypothetical protein  28.68 
 
 		 268 aa  93.6  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1322  von Willebrand factor, type A  26.85 
 
 		 266 aa  93.2  4e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2786  hypothetical protein  24.28 
 
 		 278 aa  92.4  8e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.402012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2969  putative sigma E regulatory protein, MucB/RseB  24.28 
 
 		 278 aa  92.4  8e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0435  hypothetical protein  27.78 
 
 		 268 aa  88.6  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1019  hypothetical protein  28.37 
 
 		 254 aa  88.2  1e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.353251  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1316  hypothetical protein  21.86 
 
 		 273 aa  82.8  0.000000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0910605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1659  hypothetical protein  28.94 
 
 		 270 aa  82  0.000000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0676  hypothetical protein  30.12 
 
 		 271 aa  79  0.00000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.860563 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2002  hypothetical protein  24.66 
 
 		 277 aa  76.6  0.0000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.465014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1515  hypothetical protein  26.56 
 
 		 268 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.74653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2533  hypothetical protein  29.79 
 
 		 264 aa  69.3  0.00000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.154061  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0959  hypothetical protein  25.2 
 
 		 290 aa  69.3  0.00000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1653  hypothetical protein  24.12 
 
 		 266 aa  67.8  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.561802  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2372  hypothetical protein  25.13 
 
 		 250 aa  66.2  0.0000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000349314  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0396  hypothetical protein  28.87 
 
 		 279 aa  64.3  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000270968  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0436  hypothetical protein  22.02 
 
 		 260 aa  63.5  0.000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0378114  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0468  hypothetical protein  22.9 
 
 		 257 aa  62.8  0.000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2902  hypothetical protein  28.29 
 
 		 243 aa  60.5  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0902383 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0539  hypothetical protein  24.55 
 
 		 269 aa  60.5  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1661  hypothetical protein  25.47 
 
 		 257 aa  56.6  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.612075  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5301  hypothetical protein  25.47 
 
 		 257 aa  56.6  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.457246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05400  hypothetical protein  23.36 
 
 		 240 aa  53.5  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23220  putative sigma E regulatory protein, MucB/RseB  22.63 
 
 		 248 aa  52  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000142114  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1428  hypothetical protein  22.96 
 
 		 267 aa  50.4  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.906524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1251  hypothetical protein  22.58 
 
 		 263 aa  50.1  0.00004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.309853  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3198  hypothetical protein  22.42 
 
 		 255 aa  49.7  0.00006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5043  hypothetical protein  23.27 
 
 		 247 aa  49.3  0.00006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001463  outer membrane lipoprotein-sorting protein  21.03 
 
 		 248 aa  48.9  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2496  hypothetical protein  24.28 
 
 		 262 aa  47.4  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>