40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1941 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_1941  hypothetical protein  100 
 
 		 277 aa  565  1e-160  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.143192  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0210  hypothetical protein  45.13 
 
 		 268 aa  230  2e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.892318  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2743  putative outer membrane protein  44.4 
 
 		 284 aa  220  1.9999999999999999e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1423  putative outer membrane protein  44 
 
 		 281 aa  204  9e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0426224  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1179  hypothetical protein  29.52 
 
 		 263 aa  104  1e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2969  putative sigma E regulatory protein, MucB/RseB  25.7 
 
 		 278 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2786  hypothetical protein  25.7 
 
 		 278 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.402012  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2703  hypothetical protein  26.09 
 
 		 261 aa  97.4  2e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2009  hypothetical protein  30.36 
 
 		 261 aa  96.7  4e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0152  hypothetical protein  28.74 
 
 		 269 aa  95.5  9e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2002  hypothetical protein  25.86 
 
 		 277 aa  94  3e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.465014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1528  hypothetical protein  25.18 
 
 		 273 aa  93.6  4e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.676069  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0806  hypothetical protein  24.15 
 
 		 1083 aa  89.7  5e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.712772  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003708  outer membrane lipoprotein-sorting protein  28.51 
 
 		 263 aa  89  8e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.212614  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1322  von Willebrand factor, type A  29.69 
 
 		 266 aa  86.3  5e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08460  hypothetical protein  25.33 
 
 		 262 aa  85.9  7e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2225  hypothetical protein  24.57 
 
 		 264 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1316  hypothetical protein  25.85 
 
 		 273 aa  83.2  0.000000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0910605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0634  hypothetical protein  27.35 
 
 		 268 aa  79.3  0.00000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.71934  normal  0.575914 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0396  hypothetical protein  27.11 
 
 		 279 aa  79  0.00000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000270968  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2986  RND efflux transporter  28.12 
 
 		 1051 aa  78.6  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.594238  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1019  hypothetical protein  26.07 
 
 		 254 aa  76.6  0.0000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.353251  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1515  hypothetical protein  26.44 
 
 		 268 aa  75.5  0.0000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.74653  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1653  hypothetical protein  25 
 
 		 266 aa  73.9  0.000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.561802  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0539  hypothetical protein  29.59 
 
 		 269 aa  73.2  0.000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0676  hypothetical protein  24.56 
 
 		 271 aa  71.6  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.860563 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1659  hypothetical protein  25.94 
 
 		 270 aa  66.6  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0959  hypothetical protein  22.91 
 
 		 290 aa  65.9  0.0000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0435  hypothetical protein  28.36 
 
 		 268 aa  58.5  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0454  hypothetical protein  24.75 
 
 		 268 aa  57.4  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1428  hypothetical protein  20.93 
 
 		 267 aa  52.4  0.000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.906524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0436  hypothetical protein  21.18 
 
 		 260 aa  52.4  0.000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0378114  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2496  hypothetical protein  24.82 
 
 		 262 aa  50.8  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1661  hypothetical protein  25 
 
 		 257 aa  50.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.612075  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5301  hypothetical protein  25 
 
 		 257 aa  50.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.457246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3198  hypothetical protein  19.77 
 
 		 255 aa  49.7  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23220  putative sigma E regulatory protein, MucB/RseB  25 
 
 		 248 aa  48.9  0.00008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000142114  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2902  hypothetical protein  25.16 
 
 		 243 aa  48.5  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0902383 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2533  hypothetical protein  27.06 
 
 		 264 aa  47.8  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.154061  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001463  outer membrane lipoprotein-sorting protein  22.66 
 
 		 248 aa  42.7  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>