42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0152 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_0152  hypothetical protein  100 
 
 		 269 aa  540  9.999999999999999e-153  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1528  hypothetical protein  57.63 
 
 		 273 aa  289  3e-77  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.676069  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0634  hypothetical protein  53.41 
 
 		 268 aa  264  1e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.71934  normal  0.575914 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2225  hypothetical protein  37.3 
 
 		 264 aa  167  1e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0210  hypothetical protein  33.46 
 
 		 268 aa  129  6e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.892318  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1179  hypothetical protein  29.66 
 
 		 263 aa  127  1.0000000000000001e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0454  hypothetical protein  30.52 
 
 		 268 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0435  hypothetical protein  34.12 
 
 		 268 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1659  hypothetical protein  36.13 
 
 		 270 aa  126  5e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1515  hypothetical protein  31.76 
 
 		 268 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.74653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1322  von Willebrand factor, type A  33.47 
 
 		 266 aa  118  9e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003708  outer membrane lipoprotein-sorting protein  32.66 
 
 		 263 aa  117  1.9999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.212614  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2703  hypothetical protein  28.24 
 
 		 261 aa  114  1.0000000000000001e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2009  hypothetical protein  27.2 
 
 		 261 aa  111  1.0000000000000001e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2743  putative outer membrane protein  30.86 
 
 		 284 aa  108  1e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0396  hypothetical protein  29.32 
 
 		 279 aa  105  6e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000270968  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1423  putative outer membrane protein  31.08 
 
 		 281 aa  105  6e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0426224  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1653  hypothetical protein  28.81 
 
 		 266 aa  104  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.561802  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08460  hypothetical protein  31.08 
 
 		 262 aa  104  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1316  hypothetical protein  28.86 
 
 		 273 aa  99  7e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0910605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2002  hypothetical protein  29.01 
 
 		 277 aa  95.9  6e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.465014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1941  hypothetical protein  28.74 
 
 		 277 aa  95.5  8e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.143192  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2986  RND efflux transporter  24.81 
 
 		 1051 aa  93.6  3e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.594238  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0959  hypothetical protein  25.1 
 
 		 290 aa  86.7  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0676  hypothetical protein  31.27 
 
 		 271 aa  82  0.000000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.860563 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2786  hypothetical protein  25.11 
 
 		 278 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.402012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2969  putative sigma E regulatory protein, MucB/RseB  25.11 
 
 		 278 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0539  hypothetical protein  29.38 
 
 		 269 aa  77.4  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0806  hypothetical protein  24.66 
 
 		 1083 aa  76.3  0.0000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.712772  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0468  hypothetical protein  24.46 
 
 		 257 aa  76.3  0.0000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1019  hypothetical protein  25.1 
 
 		 254 aa  67.4  0.0000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.353251  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23220  putative sigma E regulatory protein, MucB/RseB  20.24 
 
 		 248 aa  59.3  0.00000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000142114  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2533  hypothetical protein  28.48 
 
 		 264 aa  58.5  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.154061  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1661  hypothetical protein  26.49 
 
 		 257 aa  54.7  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.612075  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5301  hypothetical protein  26.49 
 
 		 257 aa  54.7  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.457246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2390  hypothetical protein  24.32 
 
 		 265 aa  53.9  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.564137  normal  0.698775 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0436  hypothetical protein  24.03 
 
 		 260 aa  49.3  0.00007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0378114  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05400  hypothetical protein  21.68 
 
 		 240 aa  46.2  0.0006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0366  hypothetical protein  23.92 
 
 		 253 aa  45.8  0.0008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1428  hypothetical protein  21.99 
 
 		 267 aa  45.8  0.0008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.906524  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5043  hypothetical protein  25.32 
 
 		 247 aa  43.9  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2372  hypothetical protein  26.27 
 
 		 250 aa  43.5  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000349314  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>