39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_5043 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_5043  hypothetical protein  100 
 
 		 247 aa  507  1e-143  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0436  hypothetical protein  40.83 
 
 		 260 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0378114  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2372  hypothetical protein  37.8 
 
 		 250 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000349314  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2496  hypothetical protein  40.49 
 
 		 262 aa  194  1e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5301  hypothetical protein  37.74 
 
 		 257 aa  193  3e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.457246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1661  hypothetical protein  37.74 
 
 		 257 aa  193  3e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.612075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1428  hypothetical protein  36.51 
 
 		 267 aa  176  4e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.906524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3198  hypothetical protein  36.8 
 
 		 255 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2661  hypothetical protein  35.11 
 
 		 270 aa  167  2e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2533  hypothetical protein  35.27 
 
 		 264 aa  166  4e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.154061  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05400  hypothetical protein  37.96 
 
 		 240 aa  159  5e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001463  outer membrane lipoprotein-sorting protein  37.1 
 
 		 248 aa  156  3e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1251  hypothetical protein  31.02 
 
 		 263 aa  132  5e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.309853  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2902  hypothetical protein  26.43 
 
 		 243 aa  93.6  3e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0902383 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08460  hypothetical protein  26.87 
 
 		 262 aa  85.5  7e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1800  hypothetical protein  29.96 
 
 		 241 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.73611  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2390  hypothetical protein  23.86 
 
 		 265 aa  69.7  0.00000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.564137  normal  0.698775 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2021  hypothetical protein  27.07 
 
 		 238 aa  67.4  0.0000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000720382  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0366  hypothetical protein  22.18 
 
 		 253 aa  61.6  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2009  hypothetical protein  25.12 
 
 		 261 aa  57.8  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3286  hypothetical protein  22.32 
 
 		 267 aa  56.6  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003708  outer membrane lipoprotein-sorting protein  25.48 
 
 		 263 aa  55.8  0.0000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.212614  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0435  hypothetical protein  25.81 
 
 		 268 aa  54.7  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1423  putative outer membrane protein  22.12 
 
 		 281 aa  53.9  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0426224  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23220  putative sigma E regulatory protein, MucB/RseB  24.39 
 
 		 248 aa  54.3  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000142114  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1179  hypothetical protein  26.25 
 
 		 263 aa  53.1  0.000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0454  hypothetical protein  25 
 
 		 268 aa  52.8  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0806  hypothetical protein  25.29 
 
 		 1083 aa  52  0.000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.712772  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1019  hypothetical protein  25.73 
 
 		 254 aa  51.6  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.353251  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2743  putative outer membrane protein  23.12 
 
 		 284 aa  48.9  0.00007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1948  hypothetical protein  22.83 
 
 		 259 aa  47  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.081935  normal  0.0130453 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1659  hypothetical protein  23.39 
 
 		 270 aa  46.6  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0539  hypothetical protein  21.52 
 
 		 269 aa  46.6  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1528  hypothetical protein  22.73 
 
 		 273 aa  45.8  0.0006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.676069  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1294  hypothetical protein  19.2 
 
 		 262 aa  45.1  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.522431 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2703  hypothetical protein  21.29 
 
 		 261 aa  45.1  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0152  hypothetical protein  25.32 
 
 		 269 aa  43.5  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2225  hypothetical protein  17.79 
 
 		 264 aa  43.5  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0210  hypothetical protein  20.5 
 
 		 268 aa  43.1  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.892318  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>