37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1019 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_1019  hypothetical protein  100 
 
 		 254 aa  509  1e-143  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.353251  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2703  hypothetical protein  28.46 
 
 		 261 aa  90.5  2e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08460  hypothetical protein  26.47 
 
 		 262 aa  87.4  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2743  putative outer membrane protein  28.37 
 
 		 284 aa  87.8  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1423  putative outer membrane protein  24.32 
 
 		 281 aa  83.6  0.000000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0426224  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1941  hypothetical protein  26.07 
 
 		 277 aa  76.6  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.143192  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1179  hypothetical protein  25 
 
 		 263 aa  73.6  0.000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2533  hypothetical protein  28.57 
 
 		 264 aa  73.2  0.000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.154061  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1528  hypothetical protein  22.53 
 
 		 273 aa  71.2  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.676069  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0152  hypothetical protein  25.1 
 
 		 269 aa  67.4  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1800  hypothetical protein  28.36 
 
 		 241 aa  66.6  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.73611  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2009  hypothetical protein  27.24 
 
 		 261 aa  66.2  0.0000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2902  hypothetical protein  23.08 
 
 		 243 aa  65.1  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0902383 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0435  hypothetical protein  25.93 
 
 		 268 aa  65.1  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0454  hypothetical protein  25 
 
 		 268 aa  63.5  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0634  hypothetical protein  24.71 
 
 		 268 aa  61.6  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.71934  normal  0.575914 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0959  hypothetical protein  20.48 
 
 		 290 aa  60.8  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003708  outer membrane lipoprotein-sorting protein  22.18 
 
 		 263 aa  60.1  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.212614  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2786  hypothetical protein  20.91 
 
 		 278 aa  58.9  0.00000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.402012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2969  putative sigma E regulatory protein, MucB/RseB  20.91 
 
 		 278 aa  58.9  0.00000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2225  hypothetical protein  21.89 
 
 		 264 aa  58.2  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0806  hypothetical protein  26.03 
 
 		 1083 aa  57.8  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.712772  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0210  hypothetical protein  24.02 
 
 		 268 aa  56.2  0.0000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.892318  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0436  hypothetical protein  20.34 
 
 		 260 aa  55.5  0.0000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0378114  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1322  von Willebrand factor, type A  20.51 
 
 		 266 aa  54.7  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1659  hypothetical protein  24.36 
 
 		 270 aa  54.3  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1316  hypothetical protein  22.53 
 
 		 273 aa  54.3  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0910605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0396  hypothetical protein  33.04 
 
 		 279 aa  53.9  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000270968  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1515  hypothetical protein  23.02 
 
 		 268 aa  52.4  0.000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.74653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2002  hypothetical protein  26.55 
 
 		 277 aa  52  0.000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.465014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2986  RND efflux transporter  22.13 
 
 		 1051 aa  52  0.000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.594238  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5043  hypothetical protein  25.73 
 
 		 247 aa  51.2  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23220  putative sigma E regulatory protein, MucB/RseB  24.3 
 
 		 248 aa  51.2  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000142114  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0676  hypothetical protein  21.79 
 
 		 271 aa  48.5  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.860563 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2390  hypothetical protein  22.54 
 
 		 265 aa  45.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.564137  normal  0.698775 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0366  hypothetical protein  21.57 
 
 		 253 aa  44.3  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6688  hypothetical protein  21.9 
 
 		 261 aa  43.5  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.607984  normal  0.733294 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>